Ll_transcript_440346

• Id Trinity: TRINITY_DN48369_c2_g6_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_440346
• Sequence: AGTAAGGCTTTTAAGGCTGGAATTGTATGGGTCAATTGCTCTCAACCATGCTTCACTGAAGCCCCATGGGGAGGCAACAAACGTAGTGGTTTTGGTCGTG ACTTAGGAGAATGGGGACTTGATAACTACTTGACTGTGAAACAAGTGACTCAGTATATCTCTGATGAACCTTGGGGCTGGTACCAACCTCCTTCTAAGCT GTGATAGGTAAATTAATGATAAAGTGGTGTTTAATAACTGACACCAAATAAGTTGGGGATGATATCAAATTATGATTATGGTAGGGAACACTTGATATAA TAACTTCAAAGCTGGAAAGAAAGTTACATTAAAATAATAGCTTTAAAAAGATAATAGCGCCTTATTATAATTACATGGAAGTTTTTGATTGATTGTGCAC ACTAGAGTTGTTCAGAAAAGTGATGGGTTTCTGTTTGGGTTTTTGAATAAAGTTAATAGCATCATGCATATGAATATATAGCACCGACACAGCACACATA GCTGAGAGCATAAACATATCACCAAATCATTCAAATATCAACCAAATCTCAATATTGCAGAAATGGGGATCAAAATGACAGTATCAGGTTCAATTATCCA ACAAGAAATATATCTATAACTTTCATAATTCGAGAGATATTCGTTTTTCATGTTACAAAACCACAACAGTGAAAAATGCCATTTAATGCATAAGTAATTC ATTATTTAACATTTTGACCTCGCTCTGATGGTGATAGAATATTAGAGAAATACGCTTCTATTTTCCAAGAAGAACCATAGCGTTTGTACAAATATCAAGT GGAGTAATGAAAAGAGAAAAACACTTGAGTAAATGAGGTAGTTATAGTCTCAACTAGGAATAATGGTGCAAAATAATTGGAATTTATGATGAGAGATAAA TGGTATTATAGAAAATTAATAAATAATTTTACTATATTAATCGATTTTCTTAATATATGTGTCAAAACATTAAAATGACAGTTATATAGGAACAGAGAGA CTATTTAATTAACCAAAAGATCCCTAGCAAAATCATTTATTGTTTAGAGATCCTAATTTTTGAAGTTGGACACCAAAATATTTTTTTATATAAACTAAAA TGCATTAACATCAACACAAGGGGTGCTAACCCAATACAAAAGAAAGATCAGGTCTTGATCTTTTTAGAATGAAACAAGATACAGTATATAGGAACAATAC ACCAATTTGCAAAAACTAAAGCAGTCGGAGCACTATCTGAAAAGAACCAGTCCAGAATCTAGCCTGAATTAAATCCATGATATGAGTAAAGCTAACCTGC TTATCAGAAAAAGCTAACTTGGGTATCAACATATTTAAATGAAAGAGTTTAATATTTATTTATATATTAATATTGTAGTTTTTTTCTTATAGTGTTGATT TATTATCTCTTATTAATTATCGTCGATTCTATAAAGATGATATAATGATTAATGTACTGAAAATTTAAAAAGCGTTAAAATATATTAAATTCACCAATTA ATTTGACATCAATCCCACAAGAATTATTAGCTATGCAAAAACATCTTTGATTTTCCACATGAATAATAGAATTATCAATTAAAAATGGTGTGAACACAAA AAACTCAAAATTACTTTTCCCAAAAAATAATTAAATTCGATAAAGTGACCAAGTTGTTTTTGAACTCAAAAATAAGAGAGGTGTTGATATTTATTCCTTT ATTTTTAATGAAAAAATTGATTAAATAAACACCTGATAAGGATGTTTATTAGTTTGTTACATTTTTTAATTGGTAAATAAGTTTATTTGGAAAATTAAAC ACCTGATAAGGATGTTTATTAGTTTGTTACATTTTTTAATTGGTAAATATGTTTATTTGGAAAATTAATAAAATATTGCCATAAAAGTTTGTTATGATTC AGGTTTTATTTATTTGTGTTTATCTCTTAAAAATAAACCATACGTGGTGTTAGTTGAGAGACACTACCAAGAAAGAGATAAACACACAAAAATATTGGAG AGAAACAGGAGAAAATAATGAGATTGCTCAAAATTTGTGTTGTCTCTCATCCTTTGTTTAACTTCTTTCATATGTTACGTGAATATTTCTTAGATTTGTT GTTGTACGACATTGCCAACCATCATTTTACATGTTACAACAACTATTCAGTTTGAACATGCTGTTATAGACACAAACAAGTTTAATTGTGATCATCTCTA AATCTATGTCACTCTCAAGAATTGAATATTTAATCTTATAATATAACTAAAGACTTAGTTGGAGACATGACATTAACTATTAGACCAACACTTTATTAGT CCAATAAAAGTTAGTAAAAATATATAATTAGCACTGTCATGTGATGAACATGTAACAATTTTATTCATTTGGCATAAGCAAAAATATCTTTCAACATATA GATTAGTAAGAGGTGTGCACGTACCCGCACATAATTTTTTTTCTTTGAATCTATATTTTATCTATTTTGAAAGAGAAACACTGAAATAAAAAGTTTAGAA ATCACTTCATAAAAGTATTTC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_160481;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_440346

FPKM

• PAB: 3.9
• PNAB: 2.7
• PS1: 2.3
• PS2: 0.6
• PS3: 0.8
• PW1: 10.2
• PW2: 11.8
• PW3: 3

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_440346

• Blastp: -
• Blastx: Betaine aldehyde dehydrogenase 2, mitochondrial from Arabidopsis with 88.06% of identity
• Eggnog: Dehydrogenase(COG1012)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G48170)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019463492.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;