Ll_transcript_439243

• Id Trinity: TRINITY_DN48372_c4_g5_i5
• Name Transcript: Ll_transcript_439243
• Sequence: TACGATTCTAGATAATAATAATAATGGCAACCACTGCTTGTTTCATCATTGTTAGCAGAAATGATATTCCTATATATGAAGCTGAAGTTGGAGTAGCTGC TAAAGTATGATTCTTTTTTATTTCGTTGCAAAACTTAAGGTTTAATATTTCTAAATACTGAACGGGGAAGAGAAAATGTGTTCCTTAATTTAGTTAAATT GAAGATTCTAACTTTCCTGGTCTGTTTGCGAGTTGGTTTTTCGAGGTTAATGGAGAGAAGGGAAAAGGCTGTGAGTCGTGAAATACACTTGTGATATGGT TCCCTAAAAGTCATTTTCTTTGACTCCGAAACTGAACTCACAAATAGACCTTCAAAATATCAAACGTTAATCATACTAGTACCTAATGTGTTTTTAAAAA ATTTCTTGAATGGAGATAATTTTGGCTGGTATTTGAGATTCTTAGGGACCAAGTTGAAAAATTTCATTTCAAAGGGACTAATTGACCCCAATTTCTATAA TTGTTTTAGAAAAAAAGAGCTTGATTCTTGATAGATATTGGTTTTTCTGACTGTTGAAGTGGATTTTATGATTTTAGAGGCTAATTGATGTCTGGAAATG TTATGGAGGATCCGATTCACATTATGATTTGTTCTTTAGATGTAAAAGCTTATTTGAGTCTCTTGCAATGGCTTGTTTTTTGTGGCTTTGAAAACAAGGG AACCTTCCTTTTCTTCACTAAATTTACATCTTTTGCAATTTTATGCTGCCCTGTGACAGAGGGAGGATGCTGCACAGCTCCATCAATTTATACTTCATGC TGCTCTTGATGTTGTTCAGGACCTTGCTTGGACTACCAGTGCTATGTACTTGAAATCGGTAGACAGATTTAATGAACTGGTGGTCTCAGTGTATGTCACA GCTGGTCATATCCTTTTTATGAGGGAACTATTTTACAGTTGAAATAAAAATTTATTGCTAATGTTTTGTTCATATAAATTAAGTACCGAGTACCAAACAT TAAGGACCATGCGATTTGACTTCCTTCTTTAATGTTTTGTTCATACCATTGTTCTTGCCCTTAACTCCTTCGTTTGTGTCTGGTGAGTGAGGCAACAAAA TGAACAAGAGTGGAATTCTTACACGCACCTTACAGCTTTTATACATTTTGATTTTTGTTAAGTTTTCCTTGACTTGTCATACATACCCGACTAATGTTGC TTCATGACTCTCGTAATGATGATGGCATTAAGAGCTTCTTCCAAGAGGTGCACGAACTTTACATAAAGACTCTTCTTAATCCTCTCTACTTGCCTGGTTC TCGGATCACGTCATCGCATTTTGATACAAAAGTTCGTGCTCTTGCACGAAAATATTTGTAGAAACCACAGGCTAGTTCCTCATGGTCTTTGGGTAACAAG TTTCTAGTTCATATAGCACTGTGGCCTAACTCCTACCATGTTTGTCTTCTTTGTTTTCCCCTTCATGATCTGGGACAAGGTAGGTTTGCTTCATAATGTT TTGTGGCATTATCACAAGATGGCTAAATTTGTAATACATACTGATCTTGTACTTCTTGTACTTTATGGCAACTATTTGATTTTTAATGAGAATGATTTAT TATGTTTTTGTGCTTCAAAATTAACTTAGGCCAAGGTTATTGTAGGTCTTGAAATTGGAAGTTTATCTAACAGTGCTCTCTGTCCACTCATATACACAAA CAAAATGGGATATTTTACC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_160529;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_439243

FPKM

• PAB: 0.2
• PNAB: 0.3
• PS1: 0.1
• PS2: 0.2
• PS3: 0
• PW1: 0.1
• PW2: 0.1
• PW3: 0

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_439243

• Blastp: -
• Blastx: Transport protein particle 20 kDa subunit from Schizosaccharomyces with 59.65% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: Link to kegg annotations (SPBC11G11.04)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0002066)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019415462.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;