Ll_transcript_440753

Id TrinityTRINITY_DN48390_c1_g1_i10
Name TranscriptLl_transcript_440753
SequenceTTTAGGATCGGGTAAGGCAAGACCAACCTTAACCCAAAAAAGTTTAATAAGGTATATTTTGGATCGTCAATGTCATTGTCACCCACCCTGTCTTTTTTGT CCTGTTCCACAGCATCAAACCTCTATCTCTTTCTCAAGCATATCTGCTTTCTACCTTGTGATATGTTTGATTCTCTCTTAACTCAAAACTATAAAATCAC CTGAATCAACCTCACAACAACGACGACGACAACAACAACGACGACGACAACAACTGTTAAACCCTTTCAATTTCTACTACTATTCCCATTCCAATGGAAG CAGTGGCTGGATCACTAATTACATACAGAATCATGGAACAAGAACAACCTCTCTCAGTTTCTGTTTCTGATTCTGTTTCTTCTGAAAATGATGGAACTCC TTCTGATGCAGTTATCTTCTTTGGTCTCAGTTTGGCTATTGGAATAACATGCAGACACCTTCTCCGTGGGACTAGAATTCCTTATACTGTTGCCCTTCTC ATCCTTGGAATTGCTCTTGGATCTTTAGAATATGGTACTCATCATCGGCTGGGAAAGATTGGGGCTGGAATTCGTCTTTGGTCAGAGATTGATCCAGACC TTCTGTTAGCTGTTTTTCTTCCTGCTCTCCTTTTCGAGAGCTCATTCTCAATGGAAATTCACCAAATTAAGAGGTGTGTTGCACAAATGTTCTTGTTAGC TGGTCCAGGTGTTGCAGTTTCAACTGTTTGTCTTGGATTTGTTTTGAAGTTTACTTTTCCATATAACTGGAGTTGGAAAACATCACTTTTGCTTGGGGGA CTTCTGAGTGCAACTGATCCTGTTGCAGTTGTCGCTTTGCTGAAAGAGCTTGGTGCAAGCAAAAAGCTAAGCACAATAATTGAAGGGGAATCCTTGATGA ATGATGGGACGGCTATTGTGGTCTATACACTATTCTATCGGATGGTCCTTGGAGAGACCTTCAATTGGATTGCCATAATCAAATTTCTAGCACAAGTTTC ACTAGGAGCTGTAGGAATTGGTGTTGCTTTTGGGATAGTATCTGTTTTGTGGCTTGGATTTATTTTTAATGATACAGTGATAGAGATTTCTCTAACACTT GCTGTTAGCTACATTGCATACTTCACTGCTCAAGAGGGTGCTGCTGTCTCTGGTGTTTTGACGGTGATGTCATTGGGAATGTTCTATTCTGCCTTTGCAA GGACAGCTTTTAAGGGTGAAAGTCAACAAAGCTTGCATCACTTTTGGGAAATGATTGCTTATATTGCTAATACATTAATATTCATCTTGAGTGGAGTTGT TATAGCTGAAAGCATACTTGGTGGTGGTAGCCATATTGTTTCTGATGGAAAATCATGGGTCTACCTCTTGCTTCTCTATGCTTATGTTCAAGTATCTCGA TGCATTGTAGTTGGAGCATTATTTCCCTTTCTAAGATATTTTGGTTATGGTTTGGAGTGGAAGGAAGCTATTATTCTCACCTGGTCAGGATTGCGTGGGG CAGTTGCATTGTCTCTTTCACTATCAGTAAAGAGCTCAAGTGGCAGATCCGCTGAATTGACTCCAGAAACAGGAACACTGGTATGTTTTGCAATTTATAT GGATAAGGCACTTGTAAACTTTATATGCTTGACATTTTTCTATGATTTTTCATGGCGATTCCCATTATAATTCAGAAGCCTTTAACATATGGAAAATGCA TTGCAACCATTGTTTTTTCAAGTATCCTGCTAAGGAAAAAAATAATATTACTTAAATTTATATGAAACTTTATTGCTTATAACCTAAAACTTGACAAATT GGTCCATACATGTACTTGTAGTGATGCGTTTTGTTCTCATTTCTCCTCATTAAGTAGGTAAGACATTCTATGGGGTTCTAGTTATATGAAATGTATAATA AAAGTTACTTTGTAATATTAAAATTTTGGAATGAAACCTGAAATTATAGAAATTTAAAAAACAATTGGGATTAAGATTTAGTTGATAAGTAAATGCAAGT GGTGGAATTGTCTTTATAATAATTGATGGGAAGGGTACTGGTATCCTTAAAGAATAAGGATCCCAGAGAAGAGCCCTTATAATAGTTGTCTATAAACTTA CTCAAATGATTTTATGATTGTGCAGTTTGTTTTTTTCACCGGTGGAATTGTGTTTTTAACACTTACAGTGAACGGTTCAACCACACAATTTATTTTACGC TTCTTAGGTATGGACAAGTTATCAGCAGCTAAGAAACGTGTCCTTGACTTTACAAAGTACGAAATGTTGAACAAAGCATTGGAGGCTTTTGGTGAGCTTG GAGATGATGAGGAACTGGGGCCTGCTGACTGGAGTACAGTGAAGAGATATATATCATGTTTAAATAATATTGAAGGTGAACGTGTTCACCCTCATGGTGC ATCTGAAACCGATGGTAACCTCGATCCTATGAATGTGAAAGACATACGGATTCGCTTGCTAAATGGTGTCCAATCTGCTTACTGGGAGATGCTTGATGAA GGAAGAATTTCTCAAACAATAGCTAATCTCCTAATGCTGTCAGTCGAGGAAGCAATAGATTTAGCTTCAGATGAGCCTCTATGTGACTGGAAAGGTTTAA AAGATAATGTCCACTTCCCGAATTACTACAACTTTCTTCAGTCTGGCAGGTTCCCACCAAAATTAGTCACATACTTCACTGTGGAAAGATTGGAATCTGC ATGTTATATTTGTGCTGCATTTCTTCGTGCCCATAGAATTGCTCGACGACTGTTGCATGACTTTATTGGTGATAGTGGTGTTGCTTCTGCTGTTATCAAT GAAAGTCTTGTAGAAGGACAAGAGGCAAAGAAATTCCTAGAAGATGTTCGTTTAACGTATCCTCAGGTTTTGCGTGTTGTCAAAACAAGGCAAGCAACAT ATTCTGTACTAAATAATTTACTTGAATATGTTCAAAACCTTGAGAAGGTTGGAATATTGGAAGAGAAAGAGATGCTACACCTTCATGATGCTGTACAGAC TGATTTAAAGAAATTGCTTAGAAATCCTCCTCTAGTGAAGCTCCCTAAAATAAGCACTTTACATCCTATGTTGGGTGCTCTTACATCTTTGGTTCGTGAA GCACTTGTACGCAATATCAGGGAAATGATGAAATTGCGTAGTTTGACACTGTACAAGGAAGGAGCCAAATCAAATGGTATTTGGTTAATTTCTAATGGAG TGGTGAAGTGGGAAAGCAAGATGATAAAAAACAAGCATCCTTTTTATCCAACTTTTTCACACGGGAGCACATTGGGTCTATATGAAGTGCTGACTGGAAG ACCATACATTTGTGATGTGATCACAGATTCTGTGGTACAATGTTTTTTCATAGAAGCTGACAAGATAGTTTCAAGTGTTAAAATAGACCCTTCAGTGGAG GACTTTCTCTGGCAGGAAAGTGCTATTTTTCTTTCCAAACTATTGTTGCCCCAAATATTTGAGAAACTGGCTATGCAAGATTTAAGAGCTCTTGTTGCTG AACGATCAGTAATGGCCATATACATAAGAGGAGAAACAATAGAAATCCCTCGACATTCAGTTGCGTTCTTATTAGAAGGATATGTCAAAACTCAAGGTAC TCAAGAGCTGGTAACATCACCAGCAGCTCTGCTTCCTTCACATGGGAATCTAAGCTTTCAAAATTTGATGATTTCAGGTATTCTAAATTAAATATCCGTT AATATGTTTCTCTATCTAATATTTTTTCCGCCAAAGTTAGCATTATGAATGTTGGTTAGGGAGCAATAGGTTGAATATGGAGATTTGGGAATAGTAAGTC ACAAATCGGAATTTAAGCATCAGCCTGAATATGGAAACTAAGTGTGTCTAAGATTATACAAATTTTCATTCTTACTTTTCTACTCTTTTTTTGTCACAGC TAACAATATATTCCCTTCACTTAAGTGTGCTGATTATTTATGATAAGATTTTTAGCCTTTAATGTTATGGGAGAAAAAGGGACTTCATTGAGAACATTTA GGCAAGATGATTTAACATTTCCATTTTTATAAAGTTAGTAGTTGTGTTTCCTCAATATTATCTGTTTGCTCTTTGATAGAAATGAAATTGTATTTTTGTT TGCCTGTTTGGTAAGATAATTATGATGTAAAGTGAACACCTAATACTGGTTTATGTCTCTAACACACACCTCTTAGGCAAGAGGTGCATTAGCATAAACT TGTGCTGGAATTTAATTTTTCTGTATGAAGAAGAATATGGGCTACTCTTAACTAATTATTCTAGAGCTTAAGCTGAATGGAAGTCCTTGAATGAATTTTA TTAGATAATAACTGTTATGGAGTATAATAGTTTAGCTTAATGTATAAGCTAAACAGTTGCATAGAGCTACTTCACTACTTTTATGCCACTAATTGTATTT ATGTAAAAAAAATAAAGTTAGCGATCTTTTCATCATGTGGAAATTTTTATAATTTGATCACAGTGCTTTTTTCCTTGGCTAGATACCACTCTCCATTTTT TTTTATTTTCGGTTCAATGATCATATGGTAAACTGTAAGTAATTGGAAAATTTTGACACATCTTTACATTCCAATTATACCAGGTTCTAAGGAATCTAGT TTTTCTCATCAAGGATCCTCTTATCTAGTTGAAACTAGAGCAAGGATAATCATATTTGACGTTGCAGCATTTGAGGCTGATGCTGCTCTTCCTAGAAGGT CAAGTTCAATGTTATCACATGCCATGGATCATTCCCACAGAAGTTTAGGTAGACAACATAGTTCTCTTATGAGTTGGCCTGAACACTTCTACACGCAAGA ACACCCTAAGCAAAACTCTGAAGGTATTGGGCAACAATCCAATAGTTTGTCTGCCAGGGCAATGCAGCTTAGCATTTACGGGAGCATGGTGGACATTCGT CACCAGAGTAGAGGTTCATCAAGCAGTCGTGCTAAGCCACCTCTGAGTTTGTCATATCCAACCATTGTGTCTGGTCATGAGCGTCCACTTGTTTCAGTCA AATCGGAAGGAGCTTCAACTGCCAAGAAAGGTAATGATGCGAGGGAGTTCACAAGAATTGTTACAAATCCACCTTTACAAAGCACAGAACAAAGGACACA AAATGATGAAGAGGATTCAAGTGATGATTCTGCTGTTGAAGATATCATTGTGAGGATTGATTCCCCAAGTGGGCTATCTTTCCACCCCTCATCTTGAGGT ACAAGAGGTGAGAAATCAGTTTTGACATTTTATTTGTGTGCACCAAGGGCATCCTAGCCAATAGTCGAAAATTAATCTCTTTCGATGTGTGTTGTGATAT ATTTTGTCTTGGTGCTTCTGTATAGACAATTCTGTCATGAAATCTTAGATTTATAAATGTAAAGCATATATCAATTTTATGTTTTGTTGTAAAGATAAAC ATATTTTTAGTAAATTATAAAGGTTGATGGAGTTGGATTCTGCAAGTTGAGTTAACCTTTAATGTTTTCTTGTAAAGATAAACACAATTTTAATAAAAGA AAGCTATCTAATGAT BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_160695; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_440753

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_440753

BlastpSodium/hydrogen exchanger 7 from Arabidopsis with 75.06% of identity
BlastxSodium/hydrogen exchanger 7 from Arabidopsis with 66.09% of identity
EggnogSodium hydrogen exchanger(COG0025)
KeggLink to kegg annotations (AT2G01980)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019460039.1)
PfamSodium/hydrogen exchanger family (PF00999.20)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;