Ll_transcript_440760

• Id Trinity: TRINITY_DN48390_c1_g1_i15
• Name Transcript: Ll_transcript_440760
• Sequence: TTTAGGATCGGGTAAGGCAAGACCAACCTTAACCCAAAAAAGTTTAATAAGGTATATTTTGGATCGTCAATGTCATTGTCACCCACCCTGTCTTTTTTGT CCTGTTCCACAGCATCAAACCTCTATCTCTTTCTCAAGCATATCTGCTTTCTACCTTGTGATATGTTTGATTCTCTCTTAACTCAAAACTATAAAATCAC CTGAATCAACCTCACAACAACGACGACGACAACAACAACGACGACGACAACAACTGTTAAACCCTTTCAATTTCTACTACTATTCCCATTCCAATGGAAG CAGTGGCTGGATCACTAATTACATACAGAATCATGGAACAAGAACAACCTCTCTCAGTTTCTGTTTCTGATTCTGTTTCTTCTGAAAATGATGGAACTCC TTCTGATGCAGTTATCTTCTTTGGTCTCAGTTTGGCTATTGGAATAACATGCAGACACCTTCTCCGTGGGACTAGAATTCCTTATACTGTTGCCCTTCTC ATCCTTGGAATTGCTCTTGGATCTTTAGAATATGGTACTCATCATCGGCTGGGAAAGATTGGGGCTGGAATTCGTCTTTGGTCAGAGATTGATCCAGACC TTCTGTTAGCTGTTTTTCTTCCTGCTCTCCTTTTCGAGAGCTCATTCTCAATGGAAATTCACCAAATTAAGAGGTGTGTTGCACAAATGTTCTTGTTAGC TGGTCCAGGTGTTGCAGTTTCAACTGTTTGTCTTGGATTTGTTTTGAAGTTTACTTTTCCATATAACTGGAGTTGGAAAACATCACTTTTGCTTGGGGGA CTTCTGAGTGCAACTGATCCTGTTGCAGTTGTCGCTTTGCTGAAAGAGCTTGGTGCAAGCAAAAAGCTAAGCACAATAATTGAAGGGGAATCCTTGATGA ATGATGGGACGGCTATTGTGGTCTATACACTATTCTATCGGATGGTCCTTGGAGAGACCTTCAATTGGATTGCCATAATCAAATTTCTAGCACAAGTTTC ACTAGGAGCTGTAGGAATTGGTGTTGCTTTTGGGATAGTATCTGTTTTGTGGCTTGGATTTATTTTTAATGATACAGTGATAGAGATTTCTCTAACACTT GCTGTTAGCTACATTGCATACTTCACTGCTCAAGAGGGTGCTGCTGTCTCTGGTGTTTTGACGGTGATGTCATTGGGAATGTTCTATTCTGCCTTTGCAA GGACAGCTTTTAAGGGTGAAAGTCAACAAAGCTTGCATCACTTTTGGGAAATGATTGCTTATATTGCTAATACATTAATATTCATCTTGAGTGGAGTTGT TATAGCTGAAAGCATACTTGGTGGTGGTAGCCATATTGTTTCTGATGGAAAATCATGGGTCTACCTCTTGCTTCTCTATGCTTATGTTCAAGTATCTCGA TGCATTGTAGTTGGAGCATTATTTCCCTTTCTAAGATATTTTGGTTATGGTTTGGAGTGGAAGGAAGCTATTATTCTCACCTGGTCAGGATTGCGTGGGG CAGTTGCATTGTCTCTTTCACTATCAGTAAAGAGCTCAAGTGGCAGATCCGCTGAATTGACTCCAGAAACAGGAACACTGGTATGTTTTGCAATTTATAT GGATAAGGCACTTGTAAACTTTATATGCTTGACATTTTTCTATGATTTTTCATGGCGATTCCCATTATAATTCAGAAGCCTTTAACATATGGAAAATGCA TTGCAACCATTGTTTTTTCAAGTATCCTGCTAAGGAAAAAAATAATATTACTTAAATTTATATGAAACTTTATTGCTTATAACCTAAAACTTGACAAATT GGTCCATACATGTACTTGTAGTGATGCGTTTTGTTCTCATTTCTCCTCATTAAGTAGGTAAGACATTCTATGGGGTTCTAGTTATATGAAATGTATAATA AAAGTTACTTTGTAATATTAAAATTTTGGAATGAAACCTGAAATTATAGAAATTTAAAAAACAATTGGGATTAAGATTTAGTTGATAAGTAAATGCAAGT GGTGGAATTGTCTTTATAATAATTGATGGGAAGGGTACTGGTATCCTTAAAGAATAAGGATCCCAGAGAAGAGCCCTTATAATAGTTGTCTATAAACTTA CTCAAATGATTTTATGATTGTGCAGTTTGTTTTTTTCACCGGTGGAATTGTGTTTTTAACACTTACAGTGAACGGTTCAACCACACAATTTATTTTACGC TTCTTAGGTATGGACAAGTTATCAGCAGCTAAGGTAAGAGTTCTCTTGATCCTCTACATCCAACTACTTTTTATGAGAGATGAAATTTGTTGATATCTTA TATTTATAAGTGGCACCTTAATGTTTTTATAAAGCTTCAGTGTTGTATAAATGCTTGTTATAAATTGTTTTCAAATGAAACTCTCTAGATATTTCCTTTC TCTTCTATTTGCTATATTTACACGTGGCCCTCATGTTTTGGTCATGTCATTATAGAAACGTGTCCTTGACTTTACAAAGTACGAAATGTTGAACAAAGCA TTGGAGGCTTTTGGTGAGCTTGGAGATGATGAGGAACTGGGGCCTGCTGACTGGAGTACAGTGAAGAGATATATATCATGTTTAAATAATATTGAAGGTG AACGTGTTCACCCTCATGGTGCATCTGAAACCGATGGTAACCTCGATCCTATGAATGTGAAAGACATACGGATTCGCTTGCTAAATGGTGTCCAATCTGC TTACTGGGAGATGCTTGATGAAGGAAGAATTTCTCAAACAATAGCTAATCTCCTAATGCTGTCAGTCGAGGAAGCAATAGATTTAGCTTCAGATGAGCCT CTATGTGACTGGAAAGGTTTAAAAGATAATGTCCACTTCCCGAATTACTACAACTTTCTTCAGTCTGGCAGGTTCCCACCAAAATTAGTCACATACTTCA CTGTGGAAAGATTGGAATCTGCATGTTATATTTGTGCTGCATTTCTTCGTGCCCATAGAATTGCTCGACGACTGTTGCATGACTTTATTGGTGATAGTGG TGTTGCTTCTGCTGTTATCAATGAAAGTCTTGTAGAAGGACAAGAGGCAAAGAAATTCCTAGAAGATGTTCGTTTAACGTATCCTCAGGTTTTGCGTGTT GTCAAAACAAGGCAAGCAACATATTCTGTACTAAATAATTTACTTGAATATGTTCAAAACCTTGAGAAGGTTGGAATATTGGAAGAGAAAGAGATGCTAC ACCTTCATGATGCTGTACAGACTGATTTAAAGAAATTGCTTAGAAATCCTCCTCTAGTGAAGCTCCCTAAAATAAGCACTTTACATCCTATGTTGGGTGC TCTTACATCTTTGGTTCGTGAAGCACTTGTACGCAATATCAGGGAAATGATGAAATTGCGTAGTTTGACACTGTACAAGGAAGGAGCCAAATCAAATGGT ATTTGGTTAATTTCTAATGGAGTGGTGAAGTGGGAAAGCAAGATGATAAAAAACAAGCATCCTTTTTATCCAACTTTTTCACACGGGAGCACATTGGGTC TATATGAAGTGCTGACTGGAAGACCATACATTTGTGATGTGATCACAGATTCTGTGGTACAATGTTTTTTCATAGAAGCTGACAAGATAGTTTCAAGTGT TAAAATAGACCCTTCAGTGGAGGACTTTCTCTGGCAGGAAAGTGCTATTTTTCTTTCCAAACTATTGTTGCCCCAAATATTTGAGAAACTGGCTATGCAA GATTTAAGAGCTCTTGTTGCTGAACGATCAGTAATGGCCATATACATAAGAGGAGAAACAATAGAAATCCCTCGACATTCAGTTGCGTTCTTATTAGAAG GATATGTCAAAACTCAAGGTACTCAAGAGCTGGTAACATCACCAGCAGCTCTGCTTCCTTCACATGGGAATCTAAGCTTTCAAAATTTGATGATTTCAGG TTCTAAGGAATCTAGTTTTTCTCATCAAGGATCCTCTTATCTAGTTGAAACTAGAGCAAGGATAATCATATTTGACGTTGCAGCATTTGAGGCTGATGCT GCTCTTCCTAGAAGGTCAAGTTCAATGTTATCACATGCCATGGATCATTCCCACAGAAGTTTAGGTAGACAACATAGTTCTCTTATGAGTTGGCCTGAAC ACTTCTACACGCAAGAACACCCTAAGCAAAACTCTGAAGGTATTGGGCAACAATCCAATAGTTTGTCTGCCAGGGCAATGCAGCTTAGCATTTACGGGAG CATGGT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_160695;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_440760

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0.8
• PS1: 0.2
• PS2: 2.3
• PS3: 0.8
• PW1: 0.2
• PW2: 1.8
• PW3: 1.3

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_440760

• Blastp: Sodium/hydrogen exchanger 7 from Arabidopsis with 62.09% of identity
• Blastx: Sodium/hydrogen exchanger 7 from Arabidopsis with 58.67% of identity
• Eggnog: Sodium hydrogen exchanger(COG0025)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G01980)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019460034.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;