Ll_transcript_362715

• Id Trinity: TRINITY_DN48411_c2_g1_i12
• Name Transcript: Ll_transcript_362715
• Sequence: GAAAGAAGAAGCAGAAAAAAATAAAGGGTGTGAAATGAAATTAAGTTGATTGGATCACGCGCATGGCAAAAAACGCACGAAAGAGTATATAAAAGAAAGT ACCTCACACAAACATGTCTCAGATAAACAAAAACAACTTTCAAACCCTAGCGATTGCGAGGTTAACCCAAAATTCCCACTCTCCTTTTCAATTCTCCAGA TTTTCATCTTTTTTTAGTATCTATTCGATTTAACTATTCGTTTTTTTATCTGTTTTGATCGAGAGGAATTCGATTTTGGGATTTTTAGGGTTTGATTTCA ATTTTCTTTTTTACCCTTCTGATCGGTTTTGTTGTTTAATAAAATCGTTTGTTGTGTTTTTAGTTTTTCATTTAGAGTTTCTGATATTTGCAATTGAAAA AAAAATAGTTTATTTTGGTAAAGAGAATCTTCTGATTATCATGCTATTTTGTTTTTAATTAATTTTGTGTTAAGAGCACATATTTACCTCTCTACTAATT TTAATTATTATCAGTAGTATGCAACAAGTTTGGTTTTGGTTTAAAATTGACTTCACATGCTTTTGTTGCAAAACATTTGATATATATGCTATAATTAGAC TTTGTAATAAAATTGTGACAACGCAATTGTTTTTGAACAATGGGGTTTGAATCCTCAGACCCCCCGCGTTTCAATGGTGGTTCATGTTTAAGTTTTTAAT GGTTGCTTTATCTATATAGGATCAGTTTATTTGTTACTTGTGAGTTGGATAAGCAGGTTTATATGTGAATTTTGTGTTCATGTCATGATATATTTTATAA TTGTACATGTAATATAGTACCAACTACCAAAATATCTCTGATTCAAACTTTTTTTCTTTTTTGTATTACTTGCACATTTCTTGAAGCAAGTTGAATGTTT ATTTCTTGGAGTGAGTGTGAGGAGTCGGGCTCTTTATTTGTCTTTGGAATTGAGTGTCGTAGTTTGTTTCATAATCGTCATCATTACAATAACTCTTTTC CTTCATTCTGTTTTGGAAACTGGGGCTGTCATGCTTGTTGCCTTTATACTCACTTTTATGTAGTTTTAAGTACCGGTACGACTAAATTTGTGTGTTAATC TTTGTACAGTTGAGATGGCTTCAAAACGTATTACTAAGGAGTTGAAGGACCTACAGAAAGATCCTCCTGTTTCCTGCAGTGCTGGTCTGTTTTTGCTGGC CTTCTCTTCCCGTCTCACTATCTTTATACTACATACTTACCCCTATTCTTTCAATATCTAACAATGTTGTGTGCATATAAATACCAAATTTATCTCGAAT CGAAATAAATTAATAAAGTCTCTTGGTACTTCTATGGCGTTCTACTTTGTAATGAGTATGGATACTCATATTTTTTTACTCCTTTTTTATTCTGTTTTTT CTTCTGGCTATTAAGCTATTTGTCATTTTGGATTATAACATGATTACTAGACTTGCCATCAAGTTTAAATTCTCTCAACTGATTTGAAGTGGCTTATTTA TGAAGGAGTTCTGTTTTCAGTGGACAAGATACTCAAATAATATGTTGAGTAAATTGAGTTTTGCTTAAATAGAAGATATTATGATAATAAAGAGTTGTTT AATATGGGCTTGGCTTTTACACCATTTTGCATGCATGGTTTGGAAATCTGAGGGGAGAAAAGGATGCTAACAAGGTGACTGGAAATAACTTTGATGCATA CACTATTTTAAAACAGAAAATGTCTGAAGATAGACAAGTTGATTATTGTACATGGATTACAGAGTGAGTGCAAAGGCATTTGTTGATAATAGAAGACGCT ATGTGTATATCTTACGTATTTTCCAACTTTTGATTGCTTATTCATGTAGTAAACTCCAACGGTGAAGTAGGTTATTTGGTTGAGATGAAAATAGGAATCA TAAAAAAATATATAATGAAATCTCTTTATGGCAGGAGTATCTTACTCTGACAGTAAGGGAATAAATTTTAATCATTGATTATGCATGTATGGTCAAGATA AAAACATAAAATAATGCAACGAAGGGTTTCTCCGTTTTGTATTGACAAGCTATCATAATCATTATATTCTACATACATGCAGGCCCTGTTGGTGAAGACA TCTTTCATTGGCAAGCTACAATCATGGGTCCAGCAGACAGCCCTTATGCTGGTGGTGTATTCCTAGTGACAATTCACTTCCCACCAGATTATCCATTTAA GCCACCAAAGGTTGCCTTCAAAACAAAGGTATTCCACCCCAACATCAACAGCAATGGAAGTATCTGTCTTGACATCCTGAAAGAGCAATGGAGCCCTGCC CTTACAGTTTCCAAGGTTCTGCTGTCAATTTGCTCCCTGCTGACAGACCCAAACCCTGATGACCCTCTAGTTCCAGATATTGCTCACATGTACAAGACTG ACCGAGCCAAGTACGAGAGCACGGCCCGTTCTTGGACTCAGAAATATGCCATGAACTAGTTGACCTATGCTTATGGTTCTGGTGGGCAGTTTATGTGCAA AGAAAGTTGTCGAGAAATATCAGCTAGTATATATTCATATGAATGGTTCTTCCGCTTTGATTTAATAATAATTCCAACTCAGAAATGTTTAGCTTTCATG GTTAATATGGCAAAGTCTTCAGAATGGGTTGCATTTTTATTTGCTTTGAGATTTCAGTTTTTGCCCTCTTTTCTTAATTTTGTAGTTTAATGAGAAGCAA AATATCAAGGCCAAATTTCAATATTAAGCTTCAGTTTTGCAACG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_160853;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_362715

FPKM

• PAB: 1.2
• PNAB: 0
• PS1: 0.3
• PS2: 0.1
• PS3: 0.3
• PW1: 0.3
• PW2: 0.6
• PW3: 0.8

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_362715

• Blastp: Ubiquitin-conjugating enzyme E2 5B from Oryza sativa with 95.5% of identity
• Blastx: Ubiquitin-conjugating enzyme E2 28 from Arabidopsis with 92.86% of identity
• Eggnog: ubiquitin-conjugating enzyme(COG5078)
• Kegg: Link to kegg annotations (4328940)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0002933)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_013466022.1)
• Pfam: Ubiquitin-conjugating enzyme (PF00179.25)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;