Ll_transcript_364293

Id TrinityTRINITY_DN48433_c2_g1_i6
Name TranscriptLl_transcript_364293
SequenceTTCACCACTCCATAGATATATTGAGAGAGAATCAGAAAACCTTCATTATCGATCATCCCTTAGCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGACGATCATGTTACG GGTACGAGGATGATTGAGTATATTTTTGGTTATTGAATGGATTACACTGCTAGTGTTATGCTGCAATTATTGTGACATTTATTGATTGCGAGATATTATG GGGGGAGCCTGTTCTAGGAATCAAGACAGGGGTAATGAAGATAATTCTCGTAGGGTACTTTTGCGAAGATTTTCCAAAAGTGGGAGTTTGAGATGGTGGG CATCCTCATTTTCTTGTCCATCTGTAGACATCCAGTTACGAAAGGGAGAATGTCCGTCACTGCTGGAATTGTGCATCTTGAAAATAAATCAGGATATTGA CAAGTATGGCACATTCTCTATGTTGCCACGGGATATAAGTCAGCAAATTTTTAATAAATTGGTATTCTCCCAGCGTCTGACTGATGTTTCCCTTGAGGCA TTTCGAGATTGTGCTCTCCAGGATTTTTACTTAGGAGAATATCTCGGTGTCAATGATGCTTGGATGGATGTCATCTCATCACAGGGTTCATCTTTGCTTT CTTTAGACCTTTCTGGGTCTGATGTCACTGATTTTGGGCTGACTTATCTGAAAGATTGTGAAAATCTCATGTCTTTAAATCTAAATTACTGTGACCATAT TTCAGATCATGGACTGGAGGGCATCAGTGGTCTGTCAAGCTTGACAACTTTGAGTTTTAAAAGAAACGATTCAATATCTGCTCAAGGAATGAGTACCTTT TCTGGTCTTGTTAACTTGGCCAAATTGGATTTGGAGAGATGTCCTGGGATTCATGGAGGTCTTGTTCATCTTCAAGGTTTGACCAAGTTGGAATCTCTCA ATTTAAAGTGGTGTAATTGCGTAACAGATGGTGATATGAAGCCTCTATCAGAGCTTGCAAGCTTGAAAAGTCTAGAGATTTCTTGCAGTAAAGTGACTGA CTTTGGCATCAGTTTTCTGAAAGGATTGCAAAAGCTTGCCCTGTTAAATCTGGAAGGTTGCCTGGTGACCGCTGCATGTTTGGATTATCTTACAGGTTGA ATTCCTTCGTAGACTTGTAGGCTTATTCGTTAATTTTGTTGTGATTATATTCATAGAGGGTGAGCCTCAACACAATGACAAGGTTGCTGCTTAGTGACCA ATGAGGTCACGAGTTCAAATCCTGGAAACAACCTCTCCGGTTACAGGGCTAAGGATATGTACATCTACCTCCTCAGAACCCAGTTGTGCATTGGGTCTTC CTTCTTTTTTATATATTTAGACATACTGGCACCAAGTCACCACCTAGTTGTTCGGATAATCTTTGGTTATTGGTCCATGAATGCTTTAAGCTTGTAGTTG AAACACTGTTTATCAGGATACCTTCAGCATATCAATCCCAGCAGATTGTGATGTGAGCAAAGAAAGTCCCCTGACTGCGAAATTTTAGACAACAAAATAT GGGGTAGAAGAACATGATATGAACAATTAAATCATAAAATTTATATTGCTGAGTTTATTATTTATTTTAATCTTATTTTTCTCAGGGGTTCAGAGTTTAG ACCTTGATATCTTTACAAAAAAAAACATGACTTTTGTTTCCATCAAGTCAAAAGTCAAAACATTATTCACCTTTTTGCTTTATTCAGTAGCTTTGAGGGT TTAATATCATGTGTCTGCTTGACCCATTTAAAAGTAAGAGGTTTCAACTGATCATTATTATTACATAAACACACCATTATTTGAACCAGCTGCTATTAGT TTTATTATTATCAGTGAACTTCTTTTGTTGGATGTAAAGTTTAACTTTACTACATCTTTCTTGTGTGTAATAACTTACTAAGACCTGAATACTGATTCAA AGTTTTGATTTGACGTTGACATGTTTCCTGCCAGAGCTTTCTGCCCTATCAACCTTGAATCTTAATAGATGTAATCTTTCTGATGTTGGATGTGAAAAGT TTGCAAGACTGGAAAATTTGAAAGTACTAAACTTGGGATTTAATGACATAACGGATGCATGTTTAGCACACTTGAAAGGATTAACAAAATTGGAGAGCTT GAATCTTGATTCATGTAGGATTCGTGACGAAGGATTGATCAACTTGGCAGGTTGTGCTCTAATTCTCTCCTTTTATCTTGTCTACAGTGGTGCCTTTCTG TGTAAAAATGTTGCTAGAAATTTTGGGAAAAGAAAATGGAAAAAATAGCATATTGGCTTTTTTTATCTTGGCATAAATGGTTGCAACTGATTGATTTGAA ATATGGTTGTGTTGCATGTGATTTTGTTATTGAAAATTCATATTTCTATCTTGAGGGAAAACGTGAGTAACATCTTCTCAATGCTTTTAGGCCATAGGAA ATTGAGCTGCTTGGAATTGTCTGATACAGAAGTTGGAAACAATGGGTTACACCATTTATCAGGTTAGATATGGCAGTTCCTAATTACTTTCAACGTTTGT GTGCTCGTATTTCATTATTATCTGTCTTTGATTATCTAAGCTATTTTGAGAAATACTTTCGCAGACTATAATTATCTCTGATCATTGTTCCTGTTGCATC TCATCTGATTTGGTAATTCATGATTGCTTCCCTTGATTGTTTGTTTTGGGTTGCTTTCCTTCTTGTTGAAGTTAGCTTTATCCCTTTGACATTGCTGACT GCTGAGTATTGAATAGAACTTGTCAGTGGGAGATATGAATATGACATTCTTTTAATTGTAGTGGTTGATTCATAATTCAGTAGGATTATTATTTCCATGT AATATTGTGTAGTTTTCTGCAGTTATCTTTGTATTCGGCTCCAGTTTTTCTATTTTGATTAATTTGTAATACTATTTCTTTTAGGATTGTCTAGTCTGGA GAGGATAAACCTATCATTCACAGTGGTTAGTGATAGCGGTTTGAGGAAATTGTGTGGACTCTCATCTCTAAAGTCACTTAATTTGGATGCTCACCAAATT ACTGATGCTGGGCTGGCAAACCTTACAAGTTTGACTGGGCTTACTGAGCTGGATCTGTTTGGCGCTCGAATCACAGACTTTGGAACAGACTATTTGAAAA AACTTAAGAACCTGACATCCCTGGAAATATGTGGTGGAGGATTGACTGATGCTGGTGTGAAAAATATCAAAGAGCTTTCTTCTCTAATGTGCTTAAATTT ATCACAAAACTGCAACCTTACAGACAAAACCCTGGAGTTTATTTCTGGGCTTTCTGGGTTGATTTCATTGAATGTGTCAAATTCTCGTATCACAAATGCT GGACTGCAACATTTGAAAACACTAAAGAATTTGAGGTCTCTGACATTGGAGTCATGTAAGGTGACAGCAAATGACATTAAGAAACTTCAATCAACATATC TCCCAAATTTGGTAAGCTTCAGACCAGAGTAGTTACTAAGGGAGAGATATTCTGATATGTATATGTATATAAATAAGATATACTAGCATATGTTAGAGAG ACATGGGAATACAACCTCAAATTTGTACATAGGCTAATGGCTTCATGAAAGGGTTGATGCTATGATGATATGTATATATATAAGGGTAAGATGTAATGAT ATATGTTGTGGAGAAACATGGGATGACAATTTCATATTGTATATAGGCTATTTATTTTATGCATGAATATACTTAAGCATTATGCTTGCTCAATCAACAC TAAAAATTGTTGTTTTTATTTTGATTTTCAATGATTATTTTTTCTCAAAA BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_161047; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_364293

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_364293

BlastpF-box/LRR-repeat protein 16 from Mus with 32.22% of identity
BlastxF-box/LRR-repeat protein 14 from Homo with 33.88% of identity
EggnogF-box and leucine-rich repeat protein 16(ENOG410XQRM)
KeggLink to kegg annotations (214931)
CantataDBLink to cantataDB annotations (CNT0000802)
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019456694.1)
PfamLeucine Rich repeat (PF13516.5)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;