Id Trinity | TRINITY_DN48453_c4_g1_i17 |
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Name Transcript | Ll_transcript_364439 |
Sequence | ATTTGTATGTGTGTGGCTTATGCTTTTGCATTACAAGTGATTTGAAACAAGGAAAATGGAAAAAACAAAGTTGAACTTCAAAGACAAAAGATGGTCGCTG CATGGGATGACAGCTCTAGTAACAGGAGGAACTAGAGGCATTGGGTTTGTTATCTCATCTATAATTGTTGCAAACAAGTCCCTGCTTTTATTTTAATTTC TTAATTAATCACTTTTTTTTAACTTATTCTGATTATTAGTCATGCAATTGTGGAAGAGTTAGCGGAATTTGGAGCATCTGTTCATATATGTGCACGTAAC CAAACAGATATTGATAAATGTTTGGAAGAGTGGAAAGACAAAGGATTTAACGTTACAGGATCAGTATGTGATGTTCTCTACAGTCACCAACGTCAAAGTT TAATGGAAACTGTTGCTTCCATCTTTCATGGAAAGCTTAACATTCTAGTAAATAATGCAGGTATAGTGATACCTAAGAGCATCCTAGATCATAGTGGTGA TGATATAGCAACAATAATGGGTACAAATTTTGAGTCTGGTTACCATTTGTGTCAACTTGCATACCCATTTCTTAAAGCATCTGGGTATGGGAGCATAGTA TTCATTTCCTCCATTGCAGGTTTCAAAGCTATTCCTCATCTCTCTCTTTATGCTGCCTCTAAAGGAGCCATGAATCAATTTACCAAGAATTTGGCTTTGG AATGGTCAAAGGATAACATTCGTACAAATACTGTAGCACCCGGTTATGTTAAGACTTTCCTTTTGGACAATTTGCTGGTATGCATTGTTTCATTTAAGTT TATCAAGATTAAATGATTGCAAAAATAAAATTAATTTTTAATCAAATAATTTATATATTATTTTATAATTATAATTTGTCTATTTTATTATTACTTTATA AAATTTATTATCAATTTAATAATTATTTTATATATATTGATTATTGTAAAATATATTGATTATTGTAAAATATATTAATATATATTTAAATTTAAAAACT TGTTGGGTATTTGCGAAAATCCGCTATCGATGTGGGCATTTGTAAATATTATGAATATGTATACAGGAAAGTAACACTCATACCTGTTCTGTCTCATTGT CATCCCTAATCAACACAGGCATGTCAACATTGAATTTCATTCCTCATTTTCATTGTTAAACTAGTTGTATCTAACTAAGTCCCAACCTAGCCAAAGTCAC CTGAAAAAGAGGTAATTATGCCCAACTAAACTAAAATGGATTACTTCCCCTTAGAGTCCCATGAAAAAACATTAACACGTGTTAAGTATTTTATATCCTA TGTTATTAATTTTTACAATTATGCTCATAATTTATGTTATGAGTACTTCTCTTGTGTTATAGAACTCTACTGAAGGACATGGCCTTCTGGATGATTTGAA GACTCGAACACATGTTGATCATATTGGAGAACCAAAAGAGATATCTTCATTGGTTGCTTTTCTTTGCCTTCCTGCTGCATCATACATCACTGGACAAATT ATAACTGCAGATGGGGGTTTCACAATTTAAATTGTTTTGTTAATTTAATATTGGACACATATTATTAACAATTTTTCATTTGATTGTTTAGTTTGCATCA TTGGCACAAATAACTGAGATTCCAAAACAAAGTGCTCATGAATTGCAAAACTTCCACCATGTGAGAGGACAAAAATGGTGCCAATTTGTGATCACAAATA TTTGCAATAATAATATTTTATCCATTATAGATGTTTGTGCAAGGTCTTGATATGTGATATTGGTACCAACAACATAACAAGTGTTGAATCCAATGAACTT TAATTTGGCAGAAGGCTGCATGTACAGCATATTCAATAGATATGTCATAGGAGGGTAAGGCAAAGCAGTATAATAAAGTATGGGTGGTGTGGACACTTGG CAATGATAATAAGCTCATACCTCACAGACATGTGTGCAACACATTGTTAACATGTTTAATGTTATTCCCATGCAAATTTTGAACCGAGTAGAACATAATT CTTGGTGACTTTAGATTATGTTATAACTGATTTGTAGAATAAGTATCATGTAGAGATAAATATTTGTTTGTCTTCATGTTTTTTATGATAAAAATGTAAT TTCATGATAAATAAAATAATAAATGTGTTATTAAAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_161175; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_364439
Blastp | Tropinone reductase 1 from Datura with 63.11% of identity |
---|---|
Blastx | Tropinone reductase 1 from Datura with 60.8% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | Link to kegg annotations (AAA33281) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019450253.1) |
Pfam | Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase (PF13561.5) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |