Id Trinity | TRINITY_DN48481_c1_g1_i12 |
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Name Transcript | Ll_transcript_362020 |
Sequence | GTCAAAGATATGATTGATTAAAAAATAATTAATTATTAATTTTTTAATTTAAAAAATATTTTTCAATCAATGATAAACATTACATCGAATGATATAACTG GTAGGATAGTAGATGTACTACCATCATCATGCCCCCTTTAGGAGTCCTACTCCTCATCATCTTCTTTCAATTTGGATCTTCAATCAGTTAGTTAACTACT CAGTCTGTCTATTCAATCTCATCTCTTCTACTCAATCGGGTCAAAAGGATGGAGCCCATGGACATCGTTGGAAAAGCAAAGGAAGACGCTTCTCTTCCTA AAGGTACATCTGTCTTATGATGCAATTTTATCTTCTTAATTCTTTGAAGATATTTTATTGATAAATTTTGTTACTAGTTTTTTTGTTTTTTAGATTTCGG ATTCGTTGTAATTCTTGTTTAATGTTAAAACTTTTTGCACAAAGTTACACTGATCTCTTGATTTAATTATGCTGACTATCCTCTTGTTTCATAAATATTA TCATGTTATGACTTAAAATACACCAGAAGAGTTCAACCTAAAAAACTATCTCTGTAAAGGTTAGAGAACATACTTAAGTAACACAGTGGTTTGCTATGCT GCACAATCTAGGATTCCTAACATTACCACACCTTTAAGGGCTGACATCCATGGTGGCTATCATTCAATCGGTACTGACCTGATCCTAACCCTTTCTCTTG TGGTGCGCCACTCACTTACGAGTAGTTGGTAATATATCATACTCAGAAAAACACATTAGGAGAGCCCAACTCAAAAGACTTGACTCTCCTCATGTGATTA AGGCCTTATATCATTACACCCAGCTTTTCTGAATGGTCATATTGAAATTACATATCCCTCTAGAGAAGGTGAATGTAGTTTTTCAAACAAATGTTGTGGA GTAGAATTAAACTAAACCTCAAGCTAGATCAGTGTAATTATACCCAAAAAGTATAACCTAGCGGTGAAACGAAGCGAAAAAATGGTGTCGTTTTTATTTG GTTTTATTGCTTAATGTGGTTACTTGTGGTATTCTTTTACTGAAACAAGATATATGATGATTTTTTTGCTAGCAACAATGACGAAAATTATTAAAGAGAT GTTGCCCCCAGATGTCCGTGTTGCAAGAGATACTCAAGATATATTAATTGAGTGCTGCGTTGAGTTCATAAACCTCCTCTCATCAGAGTCCAATGAAGTC TGTGGTAGGGACGAAAGAAGGACAATTGCACCTGAGCATGTATTGAAGGCTTTAGGGGTAATCATTAATGATTATATCTCAAGTTTTAATGTGGATACGT TCCAATTTATATTTTAGTGTATAAGTTCTCTCCTTTGACGTGTGGCATTTTGTTTCTTTTTTAACTTCCGCTTCTGTTATACTTTATTTTTCATCGTGTT GTAGTTTGATGTCCGACACCACCAACCATAAAGGGTTATATTGGTGTGATTTGGATCCTTGATCATATACCTTGTCTGAGTGTTGTTAACATATGGAGAA CTTAATTGGCTTTCATAGTATGTACAGTTTTAGTGTGTGAATATTGAGATGGAGACAGCATGTGGCATAATTATCTAGGTAGTCATTCGCGGAGGAGCAG TGCACTCTGGCCCTCCATGCGACATGAAGTTAAATCATGGAGCGGACAGCTGTTACCCTCAGTCGCGTCTAAATCGTGGTGTTTCCGTGAATAGCGTCCG GGATAGATTTCATTAAGAGTGAACCTTGGTTAAGGCTGAAAAGCTTATTTTACCCCTACTAATATTAAATCCTAATTTTAATGTATTAATTATTTTGCCC TACCCTCTTTTTTTGTGATTTGAGCCAAGACCAACAAAAGCTTCTGAAGCCTTCTCTTCCTTCTAAAGCTTCTGAAGGACCAAAAACTGTTTACTCTGCT GAAGCTTTCGAAGCAAAGACGGAACAGAGCTATGGAACCTCAAGTTCTGTAGTGACATTTGCTCATTCCTGGCAACTCCCAGCAGTATCCAGCCACCCAC CTTATTCTTCTTCTTCCCCTCACTTCTGCACAGCCATTCATCTCAAATTCTAAACCTTGCTTCCATTTAAGGATTAAACTTAAAGTGGATAGTGATTATG CTGAATGGAACCACTTTTATTTAGTTTCATTCTTAGATTTGTGTCTTGAAGCCCTTAGAAGCTTAAACTTGTTTTGAGTATTAAAAATGATGTGTGTGTG TTTACTTTGGATTTGAATTTTTGACACTGACTATGAGTTTTGATTACTAATTATGAATGTCTTCAGTTTAGTGTTTTAGTACATTTAGTATTTATATGTA TAGGGTAAATAAATTATCTATACTTGCTGTAACGGCCATCCCGCTATCCTGCTATTGCATCTTTGGGGCTGGCTGCTATCTGTGCTTGATTAACTTGGTG ATTATGCAATGGTCATATAAAGGTTCTTAGTGGTTCTATTTAAGGATTATGATTTGGAAGCATTCAGATTAGTTGATAATTGTAACAAATCATGCTTTCC ATTATTTGTAAAACCTGATTTGCAAGAAAGTATTCTTAGTTAATCAGCAAATTGAAACCACAGTGAATTCATGACATACCTACCCTGAGGCTCAAGTACT GCTTTACAATTCCTGAAATGATATTCTCTTGGTAGCACCTCGACACCTCCTAATTATGCTTTCATCTGCTTCCTACTTCACAGACATTGAAAATTGTCAA TGCGTAATTCATAAGATTGTCATTCATCCTGAACTCAAGTAGTTGATCGTCTTTTGTTAGAGCAAATTACTTTGGTTTCCTACAAACAGTTGATAATTGA TCCATAAATGTATTTTGCTTAGTTGCTACTACATAAAATGTGGTATTTATTTTATTTTGTTGTATTTAGGATTGTGCCAGAATATCTTAATTGAAAGGTC AATTTTCACATGATCCCTTATTAGTTCCTAAGTTATAAAGTATTCCAGCAAAGCATAAGTTTGTTTCCTTTTGTTTTGAAATTTGAAGCATGCTATTTGT TTATTAATTTTGTATTTGATTTTATCAGGGTCTTGGTTTTGGTGAGTACATAGAGGAAGTTTATGCAGCATATGAACAGCACAAAGTGGAGACTATGCAG GACTCTCTAAAAGGTGCTAAGTTGAGCAACAGAGCTGAGATGACCGAGGAAGAAGCATTAGTAGAGCAGCAAAGGATGTTTGCTGAGGCGCGTGCTAGAA TGAATGGTGGGGCAATTGCTTCTAAACAGCCAGATGCTGACCAAAGTTTTGAGAGCTAACTATAGAGCCTTTATTTTCTTTAAGCATAGGCAAGCATCTC TCACTCTTCTCGGTAAGTCTAATTTGGCAAGATTGTGTAGAAAAACCATCCAATTTGGTAAGGTTGTGTACAAAAACCATTCAGTACATGGTTGGCCTTT GTGGATGTGTTCTTATCTATTAATCCTTATTATTAAGTTGATGTAATTAGTGAGTGTTCTTCTAAACCCTCATCTATCTGGAGTTACATGTAAAATATTT CGTTTACCTGTTGTATCATGACTAACAGCTCTTAGCTTACCTTGGACACTAGTGAATGTATTGGATCATAACAATCTATTATGAATGTAATATCCATGCC CTATCGGTATAAAGATTTATATAAAATCATTACATCATCTATCATTCATTTATATTATTTTTTGAAGAGCGAATGATGATTTAAGATGAATGATGGATGA TGATGCAATGATAATATATAAAATTCATAATTTGGTATAGTAGTTAAACTCTCGATTTAACTCGTATGATCGTTAGATACTACGAGTTTTCAAGAGCTAG CTAATGAGTCACATGCATACTTGAATGCGATGTCACCTCTGTTGGTGAGATCGTCGGGAAGACCGTAGGATCGTTTCGCCAAAGATCTTACGAGTTATTG TTTTTTTACTGTTTTTTGGCGAAAACCCTAAATTGTAAAATCTTAATCTTCTAAACCTGAATTGAAGGGAACTCATGGCCCAAAATTATTTGACCCAACC AAAATTATTTTATACCCTAAATTGCAAGATAAAAAATATACTATACTAGAAATTGATTTCCATATGTGAAAGAAGTTAAGAAGTTTCTCTCATCTTCATA GAGTAAGTTTTCCTTCTTCATCTTGATAACTAGTGAAGATGAAGAGGTCAATGAAGATAATTATCTTGATATCCTCTTACGTGATTTGATTTATTGATTT AGATATTATGTTATGATATTTGTTCGTGTTTTTTGATGTGAAACACTTTAGTTGATTGCATTGATATGTTAGTTTTGCAATCATGTAAGACCTAATACTT TAATATATATTTTGATATTGAAGTTTAAGTTTTATCAAGTGCTGCATATTAATTTTGTTTTATAGCAATAGAGAAGGCTGAAGTTTTTACTATTTTGTGT GTATATATATATAAATCAATATTTTGTAGGATCTTTTGATCTGTGTTATGATTATACGTTTTATGTTTTCATCTATTCTTTCTGATTTTACGTAAGATAT CGATCTTGTCAACTGTGGGTATGACATGCATTTTTTCTCCTATTATATATTGTAATAGCGCATGAAAGCTAAAATTTTATAAATCACATCATTTCAAGGA AAAAATGACAGTTTATAACACATCCTCATTTTTTGCCTTTACAATGGCCGAACAAATCCTGAAAACCTGTTAACATTTGGTTCTTGTATTGACATAAAGA TTGTGAACTCATTTTTTAACTATATTTTTTTCCCCATTTAGAAATAC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_161420; |
Additional information | - |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_362020
Blastp | - |
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Blastx | Protein Dr1 homolog from Arabidopsis with 78.57% of identity |
Eggnog | Down-regulator of transcription 1, TBP-binding (Negative cofactor 2)(COG5150) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G23090) |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0002891) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019417431.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |