Id Trinity | TRINITY_DN48485_c1_g2_i1 |
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Name Transcript | Ll_transcript_363136 |
Sequence | GGAGAGAAAGGAAAGGAAGAATTGAAAGAAAAGGAAGAACTGAAGGAAGAGGAAACTAACATTATTGCACACAAAGAGCAATCTAGTACTGTGTCTTTTA GTGCAGGAGTGAAAGATCAATTGCAAACGGACGTTAGTCCTGAAAAGGATGTTGATGAAGTAATGAAGGGTAGTGAAAAGTTAGATCTCGGAGAACAAGA TGGAGAGGACTTTATTGAGGAAGACCCTGAGGAACCTCCCGATGAACCTGAGGCATTCGAAGAGCAGCATATAGAATATGAGGCAATTGCAAAACAGCGA CAAGTTAACAAAGAACATGAGATATTTGTGGGAGGGCTGGATCGTGATGCTACAGAGGAAGATCTGAGAAAGGTTTTTGAGAGGATTGGGGAGGTAGTCG AGGTCAGGTTGAACAAAAATTCTTCAACAAATAAAAATAAGGGCTATGCATTTGTGAAGTTTGCTAATAAGGAACACGCAAAAAAGGCTTTGTCAGAAAT GAAGAACCCTGTTATACATGGTAAACGATGTGGCACTGCACCCTGTGAGGATAATGACACATTATTCTTGGGAAATATTTGCAATACATGGACTAAAGAA GCTATTAAACAGAAGTTGATGGATTATGGTATTGAAGGGGTTGAAAACATTACGCTTGTCCCAGATGTTCAACATGAAGGGTTGAGCCGAGGTTTTGCAT TCGTTGAGTTTTCTTGTCATACTGAGGCCATGGTTGCATACAAGAGGCTTCAAAAGCCTGATGCCATCTTTGGCCATGCTGAGCGAACTGCCAAGGTAGC CTTTGCTGAACCCATACATGAACCAGACCCGGAGACGATGGCACAGGTGAAATCTGTGTTTATTAATGGTCTACCTCCTCACTGGGATGAAGATCATGTT 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AAATGCTTGAAACTTTTTTGTATCCCTGCTAGACATGTATTTCATCATGCTACAGGTATGCTTGACAACTTTGCATAATTTGAGCCATGATTGGTAATGT TTGACACAAAATTGATGATCTCTGCATTTTTTATCTTCTGGGTCCCTGTTGTGTTTTTCTTTAGGTTTCCATGCCATTCAGCTTTTGTGACATCATTCTA ACACAGGAACTGTGTAAAGTAGGATCAGCCTTTGGTGTTGTTACTGCCATGAAGGGTGTTGGTGTGGCCTCTAATGTGGTATGTTGAATATCAAAACCCA TAAAATTGTATTACTATACCGTTCCTGCAATTTGATGGGTTGATCTTAAGGTTCTTCAATTTAGCCATTTAGTTAAGAGTAAATTACACCGACATCCCGT GAGTTTTGATGAAATTACACAACCACCCCAAACTTCTCGGTTTAACAGTGTAAAAAAGTGAGAGATGGTTTGTGTAATTTCACTAAAACTCAGAGGGTGT CAGTGTAATTTACTCTTTAGTTAATGATGTATACATAGATAGTATAAATGCTGAAGAAATTCATGACAATAATGACAGAACAAATGGTCCCACCCCAATT TTAGTTTTGTATCAACGTTCATTCCTATCCCTTCTTGGTTAATTTCAATATATAAAGTTTAAATTAACCCTTTGATTTAGTTGTGTTAAAACAATGAAAA GTGTTACGGATATGGAAGCCTTAAATTAAGTTTTGCTGGTGTTGTGTCTTGGCCTTGAGACAAGCAAATTTGCCCAATCTGCATTGGAGTCTCATGTCCT GAAGGGAACTGGAAGATGGGAAAAGAAGACCTTTTCAGGGTGAACCCTTAAGATATTTGAGGATTCTGAATGCAGCATCTAGATGTGTCACTATTGGTTT CTGCATGAATTGACTCACGGCTCCAACAAGATAGGCAATGTCGCCCCCGGACTGCCGGATCCCATGAGTAAATAGAAAGTTGGATCTACGTTGGAACTCA TTTGAATTGCCCCATCTATCTTCTTGAGAAGTTTGGTTTCAAACTCGAGTTCCAACTAAAGTACACCATGCTAATGTGCCTTTGATGATCCACATCTCTG CAACGATCATTTGCATGGACCCACTTCTCATTCGATTTTTGGGAATTTGATGATCTATAAACCATCCCTAACGATCTATCACCTCATTTTTTAGCATGAT GAATCACTTTGTTGCCATTAAACTTTCCAGCCACAAAAAATAAGAAATTTAGCATATTTTGATCAATTCAAAGTGAAAAAGGGTTGCTGTCGTTAAAAGT GTGATAAAGTTGAGCCAAAAGGCTTTGATTCAAGATATGTTCATGAGGAAGTGGGATCATATCTTACCAAATTGTCCGATTTGTCTTGATTTCCGATTGA TGAACCTGAAGGAATCAAGTGCGTCCCATTGCTTTTCAATTCAAGCATTTAGTTAACGATGTATATGTACATAATACATAAATGCAAACAGTAATGATGC AATGTTTTCACGTTAATTTTGACTGAATTTTTTTCAAATTCGGCTATTTTATAAGCCCAAGTACAATCTTAAAGAGTTGTAGGAGTACTCAAACCCAACC ATTACAACATCATCAGTCTTTAAGAGAGTCAAGAAGAAGAAAAAAGCAGTAAATTAGGAACTTGTGTTTTGGTAATAATTATCGCATCATTGCATTTTTA TTGAATAGTTCAGGAG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_161442; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_363136
Blastp | Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q from Arabidopsis with 34.29% of identity |
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Blastx | Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q from Arabidopsis with 34.29% of identity |
Eggnog | RNA binding motif protein(ENOG410XTJ5) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT4G00830) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019423517.1) |
Pfam | RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) (PF00076.21) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |