Ll_transcript_362092

• Id Trinity: TRINITY_DN48486_c2_g3_i4
• Name Transcript: Ll_transcript_362092
• Sequence: AAGATTGTTGATGCTCGATTCAAAACTTTTGGGTGTGGCTCCGCCATTGCTTCTTCTTCTGTTGGTAATTATTTAGGGTTCCGTATCTGTTTCATTTTTT TTATTTGATTTGTGAATTTGTGTAATTCGTTTTGGTTGTTTTTTTGTTTTTGTTTTCAGCTACTGAATGGGTAAAGGGAAAACAAATGGAGGAAGTTTTG TCCATTAAAAACACGTAATTATCTTCCTTTTTATTTAACTCTCCTTGCCAGAATTTTACAATTGGTATGGGTATGCGTATGATTCACTTGTTTCATCATT TTTTACATTAATTTTTTATAAGGATTTTTTAGTGATGAGGCAGATATATGGTACACAATAACATGAATTCGATAGACGATACGAAAGGAAAATTAGAGAA TTATGTATCTATGGTTGTAATTGTGTTTTATGAGTGATTTTTATGCTCGTTGGGTGCACAATACAATCATGAACATGATGATGTTCTCGGAATGCCATTA TTTAGGTCTTTATCTTCATTACTGGATGTTTGGATGGATGGAAAAGGTATGAGATAGATGAGAATGAGGATAGCATAATATTGTATTGTTTGTGAGTTTT TTTAATAATGGAATGGAACAAAAGCATTACTCCTAAACCCTCAAAATTGAATTGGGGGTGGAGCCAATGGAATGAAAGGTAAGCCCTTTCTCTTTCATTC CCTCCAAAACTCTCAAATATACCATTAGTCCAATACTCTTATCCATTCAGCTTCACAGCAGTGCAATATATCTATTTTAAGTTGTTATAGAAGACAACAT AGTAGCTTATATGAAAATAACGTTTTTTTGTGACGTTAATGTTGCAAAATGTTTGTTCTTTAACATATATATCTTCTGCTTTTCATCTCCTTCATAAATG ATCACCACTCCATTCTCCGCTTATGGGTTAGTTCTGAATTATTTAAATATTTTGCTGTTTTTGTTTTGGACTTTTGATCCATATCATAGCAGGATTAAGG CTTGGTTGTTGTTGTTTTGGATTTTTGGTTCCTATCAAATTTACCATCCCTAAGAGTTTAGTTCTGCCTGATATTTTAGCTTTGCCAATGCTTTCCTGAT TAATGATTCTGCTATGCTGTTTTTGAGTTATCGAAGTAACAAGTATTCAATGTTCTGTAGTGAAATTGCGAAGCATCTTTCACTTCCACCGGTTAAGCTC CATTGCAGCATGCTTGCTGAAGATGCTATTAAAGCTGCTGTCAAAGACTATGAAGCTAAGCGTGCTAAGGCAACAACAACTGCAGAGAAGGCTGCCAATG CTTGATTTCTTCCATGCCGTGCATCATTAGAACACCTTGGTTGGGTATTTCTTGCTGTGTGATGTAAATACTTGTGAGTTGTGACCCGGCCTATGGTTTG TTATCTGCATGGTTTTTTGTACTCTACTTGGTTGGGTATTCCGTGGTGTTTGGCCTTGGAGTTCAGTTTGTGTTATTGTTATTAGCAATGTTGGTATTTT TGGAAGTTTCACCATAAAATGAAAACAATGAACAGCATGTTGTATTCACTCTTATTTTTAATGGAATAATGTATTTGTAGCAATAAATCCCAGTTTTGGA TTCATACAGTTACACTTAAAATATAAATGGCATCAGTATGGAAGATGAGTCACTAACTTTGGAAGGGTGAGGGTTGAGAATGATACTCAAGTATGTGGAG CATCATGCTACTACAGTGGAATAAATTTTTACGGTGATTAACAATTTGGAATAATGTGTTTGTTGGCGTAATCCATGAGAGACTGCTTAGAAGATACTTC GGAAGCATCATTCACATAGCCATACAATCTGTTATTCTACGATTTAGTCAGAAACGATTCAATATCTTTTGTCAAATGAGGAGATTTCCCAAGTGAAGAA GGATTCATATCATTCTTATTTAAAAGAGCAAACTACAAACGTGAAGC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_161453;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_362092

FPKM

• PAB: 5.3
• PNAB: 1.5
• PS1: 0.8
• PS2: 1.4
• PS3: 2.3
• PW1: 2.1
• PW2: 3.4
• PW3: 2.5

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_362092

• Blastp: -
• Blastx: Iron-sulfur cluster assembly protein 1 from Arabidopsis with 93.75% of identity
• Eggnog: sUF system Fes assembly protein, NifU family(COG0822)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G22220)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_015946232.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;