Id Trinity | TRINITY_DN48502_c5_g1_i5 |
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Name Transcript | Ll_transcript_338746 |
Sequence | AAATATTGAAATTATTCAGCTGAATCTCGAACAAGGTATATTTCTCTCTCATCGCACTCCAAACACTCTCTATCTAACTTTCTCTCTCCAAAATTTGCAC CGAGAAAACCCTAATCTGCGACATAGACCGTGTATTATGATTCAATTCAATTCAATTCGCTGTTGAATGTGTATTTCGCGAACACTTATTACTTTCAATC CTTGTTATTATTAACGATGGAGGTTTCCAACGACGATTTCATGGAGGTGGAGATTGGAAGCTCCGTGGAATCGTTGCAGAACTTTTTGGCTTCGCAGAGA GATCTATTTCATAGCCAGATCGATCAGTTTCAACAAATTGTTGTCACGCAATGCAAACTCACCGGTGTTAATCCTCTCTCTCAAGAAATGGCAGCTGGTG CTTTATCAATAAATATCGGAAAAAGACCTAGGGATTTATTAAACCCAAAGGCTGTAAATTACATGCAATCAGTTTTTTCTATTAAAGATGCCATTAGCAA GAAAGAATCTCGTGAGATCAGTGCTTTATTTGGTATCACGGTGAAACAGGTGCGTGACTTTTTTGCTAGTCAACGTTCAAGAGTAAGGAGACTAGTTCAG TTGTCAAGAGAGAGGGCGTTAATATCTAATTCTTGTGAAGAATCTCATGATGGACAGATAAACTCTGATGATCCTATGAGACCAATAAATCCAGTTCCCT TGAACTCTGTTGGTCCCATAAATGCGGAGGAAGCATCTTGTTCAACACAAGAAGCAACTTTGTCTGGTCTAGATGGCTTAGATAAACAGTTTGTTGATAA CATTTTTAGTCTAATGCAGAAAGAGGAAACATTTTCTGGGCAGGAGAAATTGATGGAGTGGATATTGACTGTGCAAAATTTTGTAGTATTGTTGTGGTTT TTGACCAGAGGTGGTGTTATGATTTTAGCAACTTGGTTGAGTACAGCAGCTATTGAAGAGCAAACAAGTGTCCTTCTTCTTATCTTAAAGGTTCTTTGTC ATTTGCCTTTACATAAAGCCCCTCCCGCACAAATATCAGCTATATTGCAGAGTGTTAATAGACTGCGGTTCTACAGAACTTCAGACATATCGAACAGGGC AAGAGTTTTGTTAGCAAAGTGGAGCAAATTACTAGCAAGGAACCAAGCAATAAAGAAACCTAATGGTGTTAATTCTTCTAGTGATGGTAAAAGAGAAACA ATGCTTTCTCATAGTATTGGTCAAATTATGGGATCTGAATCATGGCATTCAAATGTTGATGTTCCTGAAGATATTCTTGCTCTCTCAAATGAATGTTCCG ATAATCTCAGGAAAATGGAACCACTGCAAGTTTTGAAATTGTTGCCATCTTGCTCGGATGATTCAAATAAGAAGCCTGGCCTTGGTTTATCTTCATCGCG TATCCTTGGATCCCTTTTGTTGATTTGGTTATATCTTTTTTCAATTACTTTCTTTTTCTTCCCTTTTAAGTTGTGCAGAGTGCTGATCAACAAAACCGTT TAAGTAGGACATCTCAAATCACAGATACAGGAAATTAAATGCTTTAAATAAAACTTTTGAATGGTACTCTGGAGTGATGATGGAAGGCTCATTAATTTTT CTTCAACCAAGCATAACTACTATTACTTTGGTGTGATAGCCAAATGATTTGCTCTCATCACTTCACTGACTTGGAAATCTTTCTATACACACTAGCTGCT TATGTTACTTTATCTCTGGCTATTCTAGATTGGTATTCTGATTATATTGAAGTGTTTGTGACTCAAATTCCTTGTGTGCGACAAATTTCTTTTGCTGCTT GGTACTGTGTAGCTTCTCACGAGTTCTTTTGTCACACACTGATTTCTTCAGCACTGGAAAATTGCCAATTGTTGAAAGTTCAGTGTCAATACTTGATCCC GACATAACTTGTGCTGTATACCTGAAATAATCTGGCTCAAGGATAGAATTAAATTGCCTGAAGTTCATGCTAGTTGTTGTTTAGGGATGCTAAATGTTGG TTATATCTCTTGTCATATTCTTTAACCCCTGACAGAATTCCGCGAGCGCAGAAAAGTGCAATTGGTGGAACAGCCAGGTCAAAAAACAGGAAGCAGAAGC CCACAGGCAGCAACGACAAGGCCTGTTACTCAAGGCCGTCCCATGTCTGCTGATGATATCCAGAAAGCAAAAATGCGTGCACTATTTATGCAGAGTAAGT ATGGGAAAACTGGTCCTGCAAAAGAAAGTAAAGGAGCAAAGATTAATGGTCTGAATAAACCTCAGACAAATCAGGCAAGTATTTCAGCTTGCTCTTCTAA AGTTCCTCTTCCACTCAAAATTGAAGAAGACAAGAAATCTCCACCGCTTCCCTCCAAAATCACTAGTAGGTCGGAAGCTTCTTATTCTAACCTGAAAATG GATTTGAAGGAACCTCTCTGGGAGAAGTGCAAGAGGGTGCAAATCCCATGGAAGACTCCAGCAGTGACTTCATTTTTTCCGGCGAAAAGCTCAATTGCTG TTAAACTCCATTAAAATACATTAACCAGGATCCAGAACCTTCATTGTAGACGCGACAATAACATTGCCAGATGCCCAGATGTGCAACCTCTATGCCGTGG TTCCTCCGCCGCATCACACCCCACCACTGTGGTTAGAGTAGTCCCCAGATTGGCACCACTATGAACAGCCCCCACTGCCACTAGACAATAACTGCTCTGC TGCGGCTATAGCTGAAAAAAACGGACACTCATTGGAGAAGTGAGAAGAGAGAGAAACTAAAAAAATTCATGTGTTCAATAGATTTTTTTGATGAACCCGC TGTGGGAAAGGCTTGGGTGTTGTTAACGAATTTTTAAAAGACTGTCAGTGTTGGATGGTGCAACGTATGAACCACTTGAAACCAAAATATAACTCAAATG ATGAGTTCAGTGGTTTTTCCCATTACTATCTGAATTTCATGTAAAACAATTAGAGATGTATTTTTCCCTTACACCTTTGCCATGGCTTATGGGAATAAAA GTACATATGTGGATAGATTTGGTTTGGGCGTGATCCAATATTAATCTAATGTTGTGGCATTGTGTTGTAATGACTGAAGCAAAAAGGAATTTCCGTGCTT TGCTGAATCAAAGCAGGATTCTGATTTACTTACCTATAGTAGTGACTTACATTGTATGAGGTGCTTCAGGCCAAATAAGAAGTTGCTATTATACCATGAA TTTCTTAAAACATTGCCGGAGTTAATTCACCATGGGCATTCTCGAGAACGCTCTTATCTTCTCCATATGATATTAAACGCCACAGTCAAATATGTTACAT GTCAAGTATCTTTTATGTTTTAATTTGTAACCACAATCACTGATATGGGTGGATAGTTGGTTTTCTGTCTGTGGTGTGAAGGACTGTGATTTTACTGATG CCGTCTTTGCATGTTTTACTACAAGACAGCATTGGCTATGGAGTATAGTTGCAAGTGTTGAGCAATGTTTGAAGGTTTAAACTCAGTGGATATGTAATCA CAATAAGAATTACAGCACTGTACTTGTCCATTGTAAGACTTGATTGGCACGATAACAAGGTCTATGACTTATTTTTTTAAGTGATCATTGATGGTAGCTG GAGAATTGGTGTTGGTCAAAATAGCAAAGAGGTTGATGTGGAGAAAAACAGAAACCGCAGGGATAAGGAAACTATCTACCAATCTATCCAAGAGATGCCA TCTAATCCGAAGGAGCCATGGGACATTGAAATGGACTATGATGACACTTTGACACCAGAGATCCCTATTGAACAACTACCAGATGATGACGGTGATGGTG CCGAGATAGAAATTGACCCTAATCAGGTTGCAATTCATGATGTTCAAGTTCAAGGGGTAGCTACCACATCTTCAAATGGTAATAATAATGCAGTTACTGC TGAACCTGATTTAGAGCTTCTTGCTGTGCTTCTAAAAAATCCAGAGTTGGTATTTGCCTTAACTTCTGGACAAGCTGGTAGCATAACAAATGAGGATACA GTGAAGTTGCTTGACATGATCAAAAGTGGTGGGTTGAACTTGAGTGGTTTAAGTGAAAATAATGCAAATGCAAATACAAATACAAATGACAATTATGGCA TGAGTGCAAAGGCCCCAGAGACAGTGGAAGTTTCTCTCCCATCCCCAACTCCTTCAAGTAATCCAAGAACGGTGCGTGATTTGAGTTCATGCTGCAACTA TTTGTCAAAGGTCTTATCATCATGTCTATGTCTCCTATTACAGTGCCATGCACACTCCACTTTTTCCATATCGGTTTATACATGTTGAGAGTGGAGAGCA GATAGCACTTGTAATATTGGGTTGTTGGGGAAAATGTGTTTTTCATTAGTGGCCCAAATTGATGTCTAAATTAATTGATTTCCTTTCTCTTCCCTTGTGT TTTTGTTAAGATATTGAACGGTCAAGTTCTTGCATCTCACGTAAAAAGGAAGTAATCTATATTATCAAATACCCTATTTAGTTTACATTAAGTAGGTGAG CTTGATGTAACGATAAGGTTGTTAAGTGATCATGAGGTCATGGGTTCAAATCTTAGAAATAGTCTCTCCGCTTGAGGGGCTAAGGCTGTGTAACATTTAC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_161598; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_338746
Blastp | Homeobox protein LUMINIDEPENDENS from Arabidopsis with 60.2% of identity |
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Blastx | Homeobox protein LUMINIDEPENDENS from Arabidopsis with 60.68% of identity |
Eggnog | homeobox protein(ENOG4111YQX) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT4G02560) |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0001964) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019440851.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |