Id Trinity | TRINITY_DN48548_c3_g1_i3 |
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Name Transcript | Ll_transcript_337667 |
Sequence | ATTTGATCTACATTAAAGTGGTTTGTGACTCCAAATGTTGAATTGAGGTACAAAAAACATAACACATAAATGGTGATCATGCTGTCTTCTCACTCTCCTT TCTTCCAAATTCCAACTCTTTTGATCCAACCAAGAAATCATCATCATCATCATCATCACCAAATCACTTTTCAACAAAGCTTGTTCACTTGTGTGTATCC TTTGAGGACAAACCTCCACAAATGTTTCTTACAAAAGCAGTCCAAAGCTGAACAAGAACAAGAACAAGAAGTATTTGAATTTGAGAGGTTGTTCTCAAAT CTTAACCAAGCCACTTTGAAGAGGGAACCTGGTTGGTGCATTCTACACTTCTTTTCTCTTCTGTACAACTACTGCTATTGTGAAGTCTGTGTCCTCAAAA GTCCTTCTTGTTTATTATTATTATTATTATTACCATCTAAACTCTTCAGAGTAAAAATCTCATTTTGACAATTTAATTTATTAAAATTGTTTGTCTGTGT TGATATTTGATATTTTCAGGAAGCTTAACCAGTGCAATTTTCCTGGTTGCAGGCACTACGGTGCACCACTTTCGCTCTTTCTCTTTAGTACCAACCTTGT GTTTTCCTACCTGGTCTGCATGCATGTGTGACACCTTAGGGATACACCATATATGTTATTTGTGTTTTTAATCTCAAGATGTGATTTCAGACTTACTACC ATAGTTTCTCCTTTAACCTGTTAATCTCCTCCACTTTTAGGCTCCTATAGTCTAGTAGTTTTTTTTGTAAGATGACTATATACATATATTACACTCTTAC ATAAACCTGGTTGTTTATTATGTTGAATGTGTATGTGCATCAGATCAGTCTACCTCAAAATACACTACTTTATGCTTTACATAATCAGCCACAGCTATTT TTGTTATCACATACCAGTCTTGGTATAAATATTAAGACATGCCCTTTGTTTTTGAAGAAAATTCAAGATGAATCTGCTCACAAGTGAAGACTATACTCAA TATGCCCTTTGTTAAATTTTGCTATTCAATATTCATAACTGCAAAACTTGTTAGATTATGTTTATTTGTATTCATTCTAGCATTATTTATTGTCACAATT TCCCTCAAATGTAAATAAATATCACAGGTAGGTGCAGGGATCCTTGCAATTCCTGCAGTGACACAAGAGTCTGGCTTTTTAGCATCTGCAGTTACTTGCA TCATTTGTTGGTTATTCATGGTTGTGACAGGTTTGCTTGTTGCTGAAGTGAATGTCAACACCATGTGTGAACTTGGTTCTGGTGGCGTGTCCTTGGTAAT ATATTTTTATGCATGGATCATGGATATGTAGAAAAAGGATGCATGGTATTAGCAATATATTTTTAGTAACTTGATCTTGATTAAGTTCAGGTATCTATGG CCCGAAGAACTTTAGGGGAAGTTGGGGTTCAAATTTCATGGTAAGTTCGTAAATCGTCTTTGTAAAATTTTAAGCATCTGGAACTATGGGAAAAATCAAC ATGCATCATATGGCTATAACCCAGACGCACTGTGTGAACATGCTATACTTGATTTAAGGAGGCATTAATTGCATGGAAAAGAAGAACACTTTCTGTCTCT TGTGAGACACAATGCTGCAACTTTCCTTCCTTTATAAATTATCACCATGAACATGATTAAATTATCTAGAAACCATCATTCCTTGATAGCCTTGAAACTT TCCTTCCTTTATAAATGTACATATAATTTTAGCTACTTCTGTAAGAGGTTATGATCTTCTGTAATTACATTTCATTCTTGAACAGGTGTTTAATAATGAT ATTCATTTTCTTGCAGCTGGTCATACATCTTCATCCATTATGCCCTTCTTGTTGCCTATATGGCACGTTCTTCTGATATATTGACAAATTTTCTTGGCAT TCCTATGTACAAGCTACTAACTCTGCCTTGCATTCTCCCTAAATTTTCATTGAACTTATCCGTCCTAGTTCTGTCGTTATGTGACCCAATTTATGTGTGA TATTCCAAGCAAACCTTGAAAGCTTTTTAGGCGCTGATACTAGCATTTTGGTCACAGATGGGGGAGTGCAACTTTGTTTTCATTGATTTTTGGAGGCATA TGCTTCTTTGGAAGCCAGCGCTTTATTGGTGCAGTTAATGGAGCTCTAGTTATTGGTATCATCAGCTCTTTCGCAATTCTTGTGGCAGTTGCAAGTGGAG ACCTACACTTGAGTGCTCTTTTAAAAGCTAACTTCGAAGCAGCTCCGATGAGTATACCAATTGTTGCACTCTCATTTGTTTACCAGAATGTGGTACCTGT TCTTTGCACAAATCTTGAAGGAGACTTGGTAAAAGTAAGGAGTGCAATAATCCTAGGAACTTGTATACCTCTTGTTCTGTTTCTCATTTGGAATGCTGTG ATCTTAGGAACTGTCAGTGACAATGTAATGGGCCTAGATCCAATACAACAACTGCGATCTACAAATGGGACAGTTGGAGTAAGTTTATGACAACCTCGAG CAATTTTCAGCCACAACTGTATGAAAAATACTTTAAAATATAGGGGAGTAATTTATTGACCATATTGTTTCTTATTTTATTTTATCCTCCTCAACCAAAT CCTGCAGCCTATAGTTGAGGTGTTCTCACTTCTTGCTATTGCTACATCTTACATTGGATTTGTTTTGGGTTTGTCAGATTTTCTCGCAGATTGTAAGCAT TGTATCTCTCCTTGTCTTTACCTTTTTGTATGCTTCACCATGCAACTATATTGCACATCTCAAAGACTAGCAATTGACTTGAATCCACTTCTTTTTATTT TCCTATTATTCTATCTCTATGACTTGTTTCCCAAGTATTCAGATTTTTCTGATGTGAAGTTGTCACTTGTTGGTATGGAATATAACTCATCTGAATGATA CATCTATTGCTTCACTGTGTTGATTTTCAGTGCTGAAACTCCCAACAACAAGTGAGAACAGGCCACTGCCATATATACTAACTTTGGTTCCACCACTGAT ACTGTCGTTGTTGGATCCAGAAATATTTTTTAAAGCCTTGGACTTTGCTGGAACATACGGAGTGTTGGTCCTTTTCGGAGTTATTCCCGCTGCAATGTCC TGGTCTGATAGGTACTCAAAGTCATCTCCATCAGTGAACCTACCTGAACTAGTTCCAGGAGGGAGGATCACCCTACTAATGGTGCTTGGAGGTTCAGGAT ATGTACTTCTTTCTGAATTAATTGAGAACTTTCAACACCTTTAAAAACTCATGTGGTTTTTTTCTTTCAAGTCATTTAAGTTTCAACCATAATTGAAGCA TATTTTACTATCTAGAGAAAAGGAAACAGTTTTTAGAGAAGGGTCATGTACATATTATCTTTTCCATTTTGACCTTCATACTAAGTTGTTGAGGAGTAAA CTTTGGCAATTTATATGGTCATGATATTCTCACAGCATTTTTTTACC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_162006; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_337667
Blastp | - |
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Blastx | Tyrosine-specific transport protein from Shigella with 28.19% of identity |
Eggnog | amino acid transport(COG0814) |
Kegg | Link to kegg annotations (SF1953) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019460267.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |