Ll_transcript_338363

• Id Trinity: TRINITY_DN48549_c3_g2_i5
• Name Transcript: Ll_transcript_338363
• Sequence: CTTTGAGATAACAAAAATTATCTCTAAACAATTTAGATAATAAAATGTAAGAAACACTTGAATTTAATGGTTGTATTATATGTAGTTTATGTATTTATTT TAATGATGAGAGGTGTACTATATAGTATATATATAGTGAGAGTTCCATTCTACAATTGTATTATCAGCAACCATGGGTGAGTCTTGTCCTAGAATGCCCC TCACTCTCACTCCTGTTCAAGTCAAGCACTGCACAGAAGCAGTGACTTACTTGAAGGACAAGCTTATGAACAACCTTCACTTGATCCTTCAAGACTTTGC TCACTTAGAAGCCAATATGATAACACCATCTGAGATGAGGAGAAGATCCACTGTAGCACTTCTTCCTCTCAACTTCAACAAAAATCGATATCCTTCTATC TTATCATGTATACATATACATACTCTATTCTCACTTTCTCTATTATACTATAATACCAACTAATGTTACTTACGTACAGTATTCTAAATTACGGTTGCGT TTATCTTGATTGTGGTTGTGGTTGTGATACTTTTCGGGAGACTTTTAAATTACCATAAATGCAATTTAAAACATTATGTGAGTCGAATTACATGTGGGTT GAAAAGCAATGTTTAATTATTTGTTTTATTTTCACTTGGTTTAGTTGATGAGAACAGGGTTATTCTCAGATCTAGTACAGATGGTAGATCTGAAGCACAT GACTATATCAATGCAAATTATTGCTCCATTGAGGTACTCTCTTTTGTATATATTTAAATTATATATGTTTTATTAATTTCATATTACTAAGCTCTCATAA AAGATATTGGTCTTAAACAGCATGCTTATGCTTACTATAACCTATTTTCTCATATTTCAGCTTCTTTTTTATGAAAATAAGTTGTTTTATATTTGAGTAA GTTTGGTAACTAAACTTAAAGATTTTAAAAAGTTTCTTTTTGAAAAGAATCTTTAACCACAATTTATCATTAGATTGTTTTTTCAAGATTATTTCCATAA CTTTTTTATAATTTATAAATGTCCATATAAAATTTTGTGAAATAGATAAAATAACATTAAAATTAATATATTAAATTAATAATTGATTTATAAGTGACAT CTGTCACTTTTTTGTCGGTAGGAGGATTTAGCACAAGGATTATGTAGTTTTGTAATGTTATTATGTAAAAATGATCATCCTAAATAATTAGTGATTGAGG CTTATATAGGCCTCATCTGGTGGAAGTGTATCCCATTTTATAGCAACACAAGGACCACTGCCACAAACCTATGAGGATTTCTGGGATATGCTTATCCAAC AACATTGTCCTGTCATTGTCATGCTTACTAGGTTGCTTGAAAATGACACTGTAAGTACCTCTTACTTTCTAACTTCTACTACTTCCTCTTCAAATGTTAC TTCCTTATTTTCCTTTTCTTTTATCAGGTGGTGAAGTGTGGTGACTATTTTCAAACTCAGGATGAGCCTAGAATATTTGGTAGTATCTCCATTCTCACCA AATCAGTCAAATCTACTGAAAATGCACTCTTGCTGCGCCATTTGGAGGTTAAACATAAGGATTTAGAAGAGACATCCTTTGTTTTGCATATTCACTATAC TGAATGGCCTGATGAGGGAGTTCCCAAAGATACATTTGCTGTGCGTGACATTCTTAAAAGATTGTACCATTTACCACCAAACCTTGGTCCAATTGTTGTG CACTGCAGTGCAGGTATTGGTAGAACTGGAACATACTGCACAATTCACAATACAATTCAGAGAATACTTGCTGGTGATATGTCTGCTTTAGATATTGCTA ATACAGTATCTGTGTTCAGGTCCCAGCGTATTGGAATGCTTCAGACTCAGGATCAGTACATTTTCTGCTATAAAGCTATCATAGATGAGTTGGAAGACCT TGTATCTCAATATTAACAAGAGTAGAAGGATTCAATGCTGTACCAAAGGATCAGAGTCTGAAGCATTAGCATTCTGGAAACTTTATGAAATTTAATAAAG TTGTTATTCTCAATCTTTCATGTATAATTGCATGCAAGGTCCTCTTCCATTGTATTAATGGAACTCTATGGAGAACACAAGAGTATAAGACAAAAATAAA CTAAATTATAATGTCCTTTTATTTTTTTTTTCTCTTTCTTCTTACCCTGTCCATCTATTTTTTTTTAGGTAGATGTTCGGTATCTAAAAAATCATGTCTT CATGTATCAAACCAATCAAATCCCACCAAAATTAATTCCTTTACAAGTTTGCATGCTAGTTTAAAACTTCTATAATAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_162020;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_338363

FPKM

• PAB: 0.2
• PNAB: 0.5
• PS1: 0.7
• PS2: 0.6
• PS3: 0.2
• PW1: 1.2
• PW2: 1.6
• PW3: 2.9

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_338363

• Blastp: -
• Blastx: Protein-tyrosine-phosphatase PTP1 from Arabidopsis with 70.37% of identity
• Eggnog: protein tyrosine phosphatase(COG5599)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G71860)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0002464)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019442018.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;