Id Trinity | TRINITY_DN48591_c3_g1_i8 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_336652 |
Sequence | AAAATGTTTTAATATATTTTATTTTTTTCTTTAAAAATGTAAATATCAATAAAAAAATGAGAATAATATATATATATATAATATTATAAAAAATATTTAG GTATCTTGACCCTTACCTAAAAATATATTCCATAACTCTCAAGCTTTCCATTTCCATCTGAAACCCAACTCGCAAACAGGCGGATTATACATAAGGGAGC TTTTGGACTCCGAAATAGATTTTAGGTAGTGCAAGCAATGGTCCTCTGACTCGGAGGTTATGAGTTCAAATCTCGTAAACAACTCTTCCCTTGCGAGTGT AAGACTATCCCGGACCCATTAGTAGGTCAGAGACTTGTAGTGGGTCTTCACTTTTAAGGCAAAAATAAAGTATAAGCATAAAATGTTTAATAGTGGAGAA AAATAATACACAATTACATGAGCAGGAAATAGGGTGTGACTATAATAGAAAAAATTTCAACTTAAATTAAGGGCAACTTGCCTACACTGGCTTATATGTG TATCTGTCATCATTGTTTGGAAGAGGGTATATATAGTTTATTTGAGCTTAGGAGAATTGCTTAAAAAAATAGACTTATGGAAATAGCTTATCAAAATAAC ATGGCTTTCACATAAGCTCTTTTTAGACTATTTAAAAAAAAGTTTGTTGAACAATCTGTTTACCAACACACACTTGAGTTTGGCTGTTAAAGTTTTTTGT TCATCTTTCATAGATTTTTGTTTTAATAAATAAAATTACGTATGACACTTTATGTTTGCTGGACTTTTACTAAGAAGCAAAATCTGCAAACAAAGCTGAA GAAGCTATATCTTCTAGCTTCTCTAAAAACCATGGATTTATATGAAAAAAAACACTTTTGCTAATTGCTAAAAGTACTTTTATAATTGTAGTGAAACAAA ACCTAAATTCTAGAGTATTTTAAAATCATATTTTTAAAGCTCAAACAAAGGCCCTTAATACAAATCTTACCAACAAAGTTTTTAATTATGTGTAACGAGT TAGTCCTGAATCTTGTATCAACTTAGTCTCTAAGAATGAGAATGTTAACCAAATATGAACTTTTCAAATTCAAGAACTAACTAGTACAATAATTAAATTA AGGGATTAAACTTCAAGTAAAGAATAGTTTTAGGGACTAAGTCGTTTATTTGCCTGAACTAATAATGCTGCTTAGTTCAATTAAAAAATGGAGACATATT CGGTTGAAATGTTTTGTGATGATTTTTAATCTTGTTGGTATGATATGACTATTGTTATAGGCATATATTGAAGCTGAAAATGTGAGGTTGGAGCATGATT CTTCCCAGTTCTCAGCTAAGGAAATAATTATTAAAGTGGAATACAAGTATTGCCCAAATCTTACAATCATAGACACTCCTGGGCTTATTGCTCCTGCTCC AGGTCGAAAAAACAGGGCATTGCAGGCCCAGGCACGTGCAGTGGAGTCTCTTGTGCGAGCAAAAATGCAACACAAGGAGTTTATTATATTGTGCCTTGAA GATTGTAGTGACTGGAGCAATGCAACTACAAGACGCATTGTAATGCAAATTGATCCTGAGTTGTCAAGGACTGTAATTGTCTCAACCAAGCTCGATACCA GGATACCTCAATTTGCACGTCCTTCCGATGTTGAAGTTTTCCTTTCACCTCCTGCATGTACACTTGATAGCTGCATTTTGGGCGACTCTCCCTTTTTCAC GTCTGTGCCATCAGGAAGAGTTGGTTCTGGAAGTGATTCTCTCTACAGGTCCAATGATGAGTTCAAACAGGCTGTATGCTTCAGAGAGATAGATGACGTT GCTGCTTTGGAAGAAAAGTTGGGCAGACCATTGTCTAAGCAAGAAAGGAGCAGGATAGGTGTGAGCAAACTTAGGTTTTTTTTGGAAGAACTGCTACAAA AGAGGTATATAAGGAGTGTACCACTGATCATTCCACTTCTTGAGAAACAGTACCGGGGTGCGACAAGAAAGTTGAGTGATATAAATCAAGAATTGAGCAC ACTAGATGAATCCAAACTGAAGGAGAAAGGAAGAGCCTTCCATGATCTGTTCTTGACCAAGTTGTCATTGCTGCTTAAAGGGACAGTTGTCGCACCTCCT GATAAGTTTGGTGAAACACTACAAGATGAACGAATAAATGGAGGTGCATTTGTTGGTGCTGATGGTGTTCAGTTCCCTCCCAAGCTAATACCTAATGCAG GAATGCGTCTCTATGGTGGTGCACAGTATCATCGGGCCATGGCTGAATTTCGCTTTGTGGTTGGAGGGATCAAATGTCCCCCAATTACCCGGGAAGAAAT TGTGAATGCTTGTGGAGTTGAAGACATTCACGATGGGACAAACTACTCTAGGACTGCTTGTGTAATTGCTGTTGCAAAGGCTCGTGACACATTTGAACCT TTTCTTCATCAGTTAGGGTCTAGATTGTTGCATATACTAAAGAGATTGCTTCCAATCTCTGTTTATCTTCTTCAGAAAGATGATGAGTATCTAAGTGGGC ATGAGGTTTTCCTTAGGCGTGTTGCCTCTGCCTTTAACAACTTCGCAGAATCAACTGCAAAATCATGCCATGAAAAGTTAACCACCACTTCTCCCCAACT GCTATAAGTTTGTTGCTATATTTCTAACAAAAACATCCTTTTTTAACAAACAATACAAAACAATAAAACGATACATGATGTACTTCATTCTTAGTTTTCG GAAAATTGCACTAACCTCTCTAAGTGTGATGAGATTACTATCAACACGTCATATATGTATTTGGAAATTATAGCTATTCCTCTTATGTGTAAATTTCACA TGTACAGAAAGCTGTATGAAGGGTGCGCATGTGTATGCAAAATAAAAGTTTGAGGAGGGTATTTGGTGAAACCTCAAGGGAAAAAGCAATTTCATAGTCA AACCTGAAGAGGATTGTCATAATTTGGCCTTTTTAAATAAAAATTGGGTTAATTTGCAATGTATTGTTGTGTAAAGCTAATAAAATGTAGCAGGAATGCT CATATTCATGTTTGAAAATGTTGAAAAATATGGTTTCATCAATGTTTGAGCAAATATTTGTAAGAGGAGGGGTGGGAAAGAGCTTGTAAACTTGTTAAAC AATTCCCCGTGCGCAGAAGTTTTGTAGAATCAAATTAAACAGATGAGGACTAAGATGCATTTTTAGATTTTAAAATAGAGCATGATGTAATATTCTGACA ATGCATCATAATGTTGTGTTTTTCTCTTCATTAATTCATGATTGTGCATTTTTTTCTGGCTATTAAGGTATGTTCCCTTGATTTTATGAAAATGAAGTCA TACATTTCGTATTGAGTGCAACTTGCGATAATGTTATCAAACTAAACTTGCCAATCATGAATGTTACATGTTTCATCTTCACATGCTCGTCCATAAATTA TTCTTTTTCTTACTGTTTTCTAAACTCCACTTTTTCCATGCTGCTTTGCTGCAGATGTGCAGAGGACTTGGTAAGCACCACAAGATATGTTTCATGGTCT CTCCATAATAAGAGTCGCGCTGGTTTACGTCAGTTCTTGGATTCATTTGGTGGAACAGAGAATTCCAATGTTGGTAATAATCCTACAGAAAATGTTCCGT CACAAACAAGTTCACATGAGAAGGAAGACACAAAGCCACAACCAGATGTAAAGCTCAGCCACTTGGCCTCTGGCACGGATTCTAGCACATCCAATCAGAC AACAGAAACAAAGCTTGCTGACCTTCTGGATAGCACACTTTGGAATCGGAGGCTTGCACCTTCATCTGAAAGGATTGTTTATGGTTTGGTACAACAGATA TTTCATGGCATAAGAGAATATTTCTTGGTTTCCACAGAATTAAAGTTTAACTGTTTCCTTCTGATGCCTATTGTGGACAAGTTGCCTGCACTTATTCGGG AAGACCTAGAGTCTGCTTTTGAGGATGATCTGGATAGTGTTTTTGACATAACCAATCTGCAGAATTCACTGGATCAGCAGAAGAGAGATACAGAAATTGA GCTGAAAAGGATCAAGAGGCTTAAGGAGAAATTCAAAATGGTACATGAGAAGCTAATTCTACATCAAACCGCGTGAATACGTGATGTCAAGCCACCGCTG GAACTGTCGAGTATCAGAGTATCATTTTATTTCAATTGATGGAATGTGGTTTTAAAATTTGAGATTATTGATTTTTCATATCTCCCTCTTTTAGTCCTTA TCTAGTGGTTTATCTTAGGAGGAGGGTGAATATTGAATACATGTTCATTGTGATAACCATTTGCTGTAGTTAACCAAAAATCATGTTTATTCTGAATCTG TTCCTGTGCAAAATTAAAACACAATTATGTTTTTGAACATTCTTCTTCATTGTGATTGTGGGTTGTTTTCTT BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_162361; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_336652
Blastp | Dynamin-like protein ARC5 from Arabidopsis with 82.75% of identity |
---|---|
Blastx | Dynamin-like protein ARC5 from Arabidopsis with 82.95% of identity |
Eggnog | Dynamin family(COG0699) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT3G19720) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019429278.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |