Id Trinity | TRINITY_DN48613_c1_g2_i1 |
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Name Transcript | Ll_transcript_368821 |
Sequence | ATCCATTCCATTTCAAAAAAAATTGATGTTTAAATTTAAGAAATAATTAAATGATGTTATTTAATATAATTTTAGTAAAATATAACTATTAAATTTCAAT ATATTTTTATAATTAATTTACCACCATAAATTGGACCCTGATTTTAATAAGTGGAGATTTTTTTGGATGAAAAGTTATCAAGGGAACAATCATTAAGAGA AGTACTACATTAAAATGTAGACAAAAGTGGAGAGAGTGGTATATTGAAATGTGGAGAAAAGTTTAGAGAGTAGTTTTATCCTTATTCCGTCATTGTATTG AAAAACTAGTGAGAAATATTAGTATATTATACTGAAAATTTGAGAGAAAAAGTAGTATATTGAAATGTAGACAAAAGTGGAGAGAGTGGTATATTGAAAT GTGGAGAAAAGTTCAGAGAGTAGTTTTATCCTTATTCCATCATTGTATTGAAAAACTACTAAGAGATATCAGTATATTATATTGAAAATTTGAGAAAAAT TAGAAGAAAAATTAATAATGTTTGTTAAACTACATGAGAAACATGCTTAAAGATTTGAAAAAATACATATAACTTATCTTTATTTTATAAAATATCAAAG TTACAGAATAGTACTGGTTTGTGTTTGTTTGGTGTTTCAAATCTTATAAGGTAAAAGTAAATGTGGTCATTAAGGTAACAGAAGGGTATGGAATCATTGA ATTGCAGTTACTTCATGCTGGTCTTAGCTGGAGAATAGTTCATCAATTAATTTCTCTTTTCTGCCACTCCTTTCTTAATTATGAAGTTAATTCGATTCGC GTAGCATAATTGATAGGGTACATGATTTGGTATCCACGTGTTCTTCTTTGCCATTTACGCGTAAACTTTTTTTATCTAAATTAAACATATACACTGCACG CGTGCTGCATTCTATTGCTCCTGTAAGCTAATAATGCATGTTGTTGACAATGTTGAAATATCTCTTACATGACATGTTTCAACCTCTGACCACTTTTTGG CATTTTCGGTGGTCATAATGTCACACAGCTATGGCAATTGGAGACACTTTTATTACAAAAGGACACGTACCTCAACTACAGCCAAGCTCTAAGCTACACA AGCCAAGCTTTGAGCCAGAACCTACAAGGACTAAGGATGAAAAGCCCAATACGTAGGATGAGCTTCAGATTCCTCTACTATTTGCAAGAGAATTGGAAGA GACTTTGGGTTTTAACATTGTGGGTTGCCATAATGATTGGGTTGTTCGCGTGGAAGTTCTTTCAGTATAGGAACAAAGATGTTTTCCAGATAATGGGTTA CTGTCTTCTCACAGCTAAAGGTGCAGCTGAGACTCTTAAATTCAACATGGCACTTATACTCTTCCCCGTGTGCAGAAACACTATAACTAAGCTCAGGTCT ACTAAGCTGTCGTGCTTTGTACCCTTTGATGACAACATTAACTTTCATAAGGTACCCACCAACATCACAAGAAATCCTCTTGATTTTATTTTATTTTGTT GAGTACACCTCTTGAATATATAAACATTGATAGTGGACGCCATCAATAATTCTAATTCCAAATTGATTTTTAGTCGTGTGCCCTGACATTATATTTGTTC ATATAAACTTCGTGAATTTAACACATGCAGTGGTCGTTAGCAAAATTAATGGGTACCCTCAGCAAATTAGGTGAAAAATGCAAAGTATTTCTAAAATAAA ATGTGATCTAAATTCTAAAGTTAAATTTGTCAAAACAGTAATTTTCTTAATGTTTGGCGGTATTAATCTTCAATTCCACCATCAAAACATAAAGTTGTAA CATTGTAGAATTGAAAAATAACTTGCTTATAATGGCCAGATTTTTATATTGTTGATTACTCATAATGAAATAAATTAAATATTTGTAACATTTATTTTGT ATTAGCTTTATATATTTGCTAGTGAACTGATGATAAAAAATTGAAGATAATAGACAAAAGTTTTAAGAAACTTGAAGTGCACAAGAAAAATAACTTGCTT ATAATGGGTAGATTTGGTATTTAGTTGATTACTGATAATGAAATAAATTAAATCTATGTAACATTTATTTTGTATTTGCTAGTGAAATGATGATAAAAAA TGAAGATAATAGACAACTTTTAAGAAACTTGAAATGCATAAGGAAAACATTCTTCTCTCAGCCACAAAAATATATAGAAAAGGATGCCATAAACAATAAA TTTATGTGTACTTAAAGTAAATTATTTGATTTTCTGTCTTACTTTTGATACCTACAGACAATTGCTGCGGCCATCGTGATTGGTATTATACTTCATGTTG GAGACCACCTTGCTTGTGATTTTCCAAAACTTGTGCATTCGTCTGAACTACTTTATGAGAAGTATTTAAATGGCGTATTTGGTCATCACAAACCCAGTTA TATAGACCTAGTTAAAGGGGTCGAGGGTGTGACTGGAATTCTGATGATAATTTTGATGGCAATAGCATTTACACTTGCAACCAAATGGTTCAGGAGAAAT ATTATTAAGCTACCTAAACCATTTAGTAGGCTCACTGGTTTCAATGCCTTCTGGTATTCACACCATCTGTTTATCATTGTCTATGTCCTGCTCGTCGTCC ACGGTGTAAAGCTTTACCTGGTGCACAAATGGTACCTTCAAACGACATGGATGTATCTTGCGGTTCCAGTTTTGCTTTATGTAGCAGAAAGAACGCTCAG ATTCTTTCGTTCTGGTTTCTATACAGTACATCTTATAAAGGTGAGTAGGGAAAGTGAAACTATCGACACTTGGCCCTTACAACGGTTTTCAACGTCATTA TAAATATGGCTTTATTACTACTGTTTAAGTGTTTTGTATACAATTTGCCTTGGCTATTGGTGTGCAACAAAGTAGAAGGGTCTCAAAAAGTGAAAACTGA GAGGACCAAGGACTTCATGTCGCAGTCTATTACTTATTCTTATAATTAACCAATCTTGTAAAATGAACTTACGTTAACATTTTATTTTTCTCCTTATTGT GCAAAACATTTAGGTTGCCATATATCCTGGAAATGTTCTCACATTGCAAATGTCTAAGCCTCCTCAATTTCGTTACAAGAGTGGACAATACATGTTT BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_162589; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_368821
Blastp | Respiratory burst oxidase homolog protein A from Solanum with 80.77% of identity |
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Blastx | Respiratory burst oxidase homolog protein A from Solanum with 73.78% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | Link to kegg annotations (102579392) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019446559.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |