Id Trinity | TRINITY_DN48630_c0_g2_i12 |
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Name Transcript | Ll_transcript_370031 |
Sequence | GAGAGTGAGTGCATGGAATTGAAGAAGGGAATGGAGTGAAGTGATGTGGTTGGAGAGTGAGATGAGTTCAATAACACTCCAACAACACTCTTTCCACACA ATGCGCATAATCACCTGCTTTCTCCAACCAACACATGCACATGCCACAATTCTTAAATTTCTTAGCTAAGCCTATTATTATAGGATCTAATTATTTTTTT TAACATTGATGCAGTTTGATGTGGCCTAATGCGGTTAAGTTGCAGTCTACAGTAGTCCAATGCGATTGTTACAGTCCGTTGCGGGTCGTGTTACTGTAAT TCGGTATCACACCAGATTATAGTGTGACGCAGTTGCGGCAGTCATAGCTACCGCAATATTGCGGCCATATCACATGATTCGGTTCACAATTTAATACACT GATGTACATAACATATAAATGATGACAGTGTATATATATTAAATTCATCATCTAAAATCTATATATTATTATTTATATTACATTTTTTAAATTATATAAA ACTTTTAAACTTGCTACATCTTTTTCTGAGTTAAGAGTGAGATGGGTAAAAATTGACCATTACATATTGAATAGTATTGAGGCTCCATAGTGAAAGAGAG AAAGAAGAGGTGTATCTATCAGAGAGAGAGTTTGAAACAAAACCGAAAACGCAAAACACAATGTCGTTTGATATACCAAGAGATGAGATAAAGCAATTAC AGATCTCACTGCGAAAACAAGCCAATCTGTCATGGTACCAACCACCTCAAAACGACCACCGTTTCGTTCTCCCAAAGCTTCCTTCAATTTCTGAAACCCT AGCTCACCTTGATCCTTCTCCGCCTTACCTTCGATGCAAGAATTGCAATGGCAGACTCCTCCGCGGCTTGAACTCATCTATCTGCGTCTTTTGTGGGACC CACCCTCATAAGGATCTTCCTCCTGATCCAATCAAGTTTAAGGATGCGTTAGGGTATCGATGGTTACTCGAATCGCTGAACCTCGATGGATCGGTAAATT TAAATCAATCGCTTTGGAACACTCTCTTAATCAAATTATGCTTATTAAGTTTTTTTCAATCTGGACTAAGCTCCTTGCCACTCAGATTGGTACTTTATTT GTGAAGTCTGAAGTTGAATTTTGGTAGTGTGAATTTTTTTCCTTTTGAAAACATTGGTAAAGATAGATTTAATGATATCTGTTAATTTTTCTGGAAATCA CTTTGGCGTCCGACTAATTTGAGTTGAGCCGAAAAGACCCATTTAAAGGGAAATATTCTCACAATACCTATTTTTTCTGTTTCACAATAGTCAATCTAGA GAACTTGCTTACGGATGATCGAGTTCATTTCCTTTCGTTTTTAACTTTGATGGTTTGATACCTCAGGTTATGATTTTTTTTGGTATGCTGTATATTGGAG TGTTAACTTTGTACACATTGTTTTGCAGGAGATGGTGGCACCATTGGTTGAAGAAAATGCATCAAACAGAGGGAAGAGTGATTCAAAGGATGAGATTCCC TTATCTGAACTACTAGATTTGGAAATTAGATGGCCTACCGAGGCTGAAAGAACTCCACAAGGTGGCAATTCAGATTCAGCAGCATTCCAGGGGAAAAGCT CGTTGAATTTGACTGGGGTTGATATTGAAAGTTATTTTTATCATAAGGAATCTGATTCTGATGTGCCTGAACAGAACTTGGGTCCTGGAAGAGAAACTGG TACTGCTTCAGATAATGCTTTCCAAGCTAATGAAAATCTTAGTTTGTTTCAGAGTGTCCAAGCCTCGGAAGCGGCTACGGGGTCTGCAAAAGATCGGAGT GGTGATTTCTTTTCTGGTTGGGATGCCAACTTTAAGTCCGCTGGTCTGGTTCATGAAGGGTCTAAATCATTTGATCCTTATAAAGTTAATTTCGATACGT TATCTGGGTCCTGGACAGATTCTGTTGGTGTAAAGAAGAGTGATGAATCGAATCCTTCTGCGTCAACTGAAAATGATTGGTTTGAGGCTGGTGGATGGAG AACTTCCAACTTAGAGGTACCTAGCCAGACCACGAAATCAGAATCAACCATGAATCTCAGTGGTACAAAAACAGAAGAAACTGCCAATGTTTCTTCTACT GGAAATTCCGTCTGGATGCAAGATGACCAATGGCAAGGGAGCAATAACAAGGTAACTGGTATTGTGGCTTCTGGTGGAGCCGATGATTCATTTGATGATG CATGGAATGATTTTACTGGCTCAGTTAGTGCACAAGATTCTTCTAGTATTATATCCTGCTCAAAGATAAGTGGGCAGATTGGAAAGTCAGAAAATACTGC TGATCTTGACCAATGGCAAGGAAGCAATAACAATGCAACTGATACCACTGGTGTACAGGAAGCTGTTGATTCATTTGATGTGTGGAATGATTTCACTGGC ACAGCCAGTACGCAATATTCTTCTAATAATACTTCCAACACTGACGTAACTGACCAGGCCGGGAAGATTGAATGGGCTGAAGTTCCTAATGATACAAAAA CATCTGAAAGTGCTACTGGTTCATCTACAAATTTTGACTGGATGCAAGATAGTCAATGGAATAGTAACAAGGAAACTAATATTATTACCAGCAATGATTT AGATGATTCGTTTGATGAATGGAATGATTTTGCTGGCTCTGCTGTTACACAAAACCCTTCCAGTAGCATTTCCAACTCTGAGCTAAATGGCCAGATTGGG AAATCTATAGTTACTACTGATCTAAACAAGACAAAAACGGCAGAGGGTGCTAATAATCCTTCTGCTGAAAGTTTTGCTTGGATGCAAGATGACCACCAGT GGCAACTTAACAATAACAAAACAGATACTGTGCCTATTAATGAAGTTGCTGGTTCATTTGATGTTTGGAATGACCTTTCTAGCTTGGCCACAACACAAGA TCCTTCCAGCAATGTTTGGAAACGAACTCCAAATCAGGCTTCTTCTGAACAGACCTCTGAAACAAATTTGCTTAGCTCATCAAACAACTCACATGATTTC GATTTTAGTGGGCTTTCACAACATAATTTATTTTCAGGGCAGTCCAGTAGTCCCGTGAGTTATCTTCCTGCAACCAATGCACAGCCTGCAACTGCTTCTT CAAGCAGTGTTGCGGATGTGGATGCCACGAGAGGAAACTCAAGAGGTGATGCGTCTACTACAAAAGTTGATGCAGAAACTTTGATGTCACAGATGCATGA TCTCTCCTTTATGCTAGAGAACAATCTTTCAATTCCCCGGAAATAAATAAAAATGGCAAACTGGTTGTTTTTAAGAAATTTTTTATAGACAATGTATTCT CTTCTTATTTCTTACCTTTTATCCAGAATGTGTGGAGTACACAAATCCTAGGCACCAAACAGTCGTTAAGAAAGTCAGCCTTCAAAGTTAAACATTCAGA ATTAAATAGGTCCCAATTCTCAGATATGCATATTATATAAGTCCAAGCAAAGGGAAATTTGAATGAGCAACAAAGTCTTATTATACAATAGGACCCCCAA AATGAGGAGTTGCAAATACTAGAAAGACAGGCATACAACTACTTCCTTACATCTAATTGCTTGGAATGCTTCCTTCAACAGAAAGTTGGATACAAAAAGA AAGCACCTTTCTAAAGGAGCATGGCTGTATGACCCATTTTAAAGGGATGTTGGTTTCATCAAATGCTAATGTTACTCCCATTGATAATGTTGCAATATCA GGTGTCCCACCTTGACAATCAAAGATGCACTATTTTCAATTGTACTCCCTCCTTTCCTTCTTACTTGCCATTTTTTAAGTTGTTCATATTTATTGTTTCA AACTTCAAGTTAATATTAATTGTTTCAAAATTGAAGACAGCTCATTATTACAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_162774; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_370031
Blastp | - |
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Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019461683.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |