Ll_transcript_369329

• Id Trinity: TRINITY_DN48664_c3_g1_i15
• Name Transcript: Ll_transcript_369329
• Sequence: GAAGAATTGGATTGTGCTTCAGACAGATGTTTCATAGGGAAATGGCAATGGAATCCGTTATTGCAAAACAATCTGAGGGTAATTCTAAATTCTCTGTTTT AATTTTCTTATTCATAATAAGGTTGTCTTCATGTATTTTATAGAAAAGTAGCAAGATTGTAATGGTAAAAAGTAATGGTTTTGTAATGGTAAAACTTTTG TAATTTTGGCAATTTCACAAGCCTAATGTAATCCATCTGTTAATCTGGTTCAGTCTGTTTAAAAAATTAAATACTTAGAAAATCTTTTAGAGACCAAAAA AGAGTAATTCTTCTTCATCGATATTCTATACTAGTATAAGGTTTTAATAAAAAAAATGAATATGAACTAAGAAAACTACACGAATAAATCATAGTCATAG AACAAAGTAATTTTTAAATTATACTTCTTTTGTAAGTTAAACAAATATAGAGTCCTTTGAATTGGAAATCCTCTTTGGTCTCCTCAATATTGTCCTAGTC GTCCTCTAGTAGTCTAGTCCAAAAAAGGGTTTGTGTGTCTTGATCCCCCTTGATCCCTTAGCCGACGTCACCTAGTTGGATTAAAGCTTGGTTGTTGTTG TGTTTCTTGATCCCTCTGGGTTGTTTTCATGTAAGTCTTACATTAAATTCCCAACCCATTTGTTGAATATAACTTCATTTTACCTTGATAGACCCATTTG GAATTCTAAAGCTCCCTCTAAGGTTAAGTCCTTTACTTGGACAGAAGTGCTTATTAGAATTAATACCAGTAACATGTGGTTTGTAGGCCCATAAGCCTAT TTCCCCTGATGTGTTTGTTACGTGCGGTGTGAGCTCAAAACCGGTTCCCCATATATCTTCCACTGTTCCATAGCCTTTTCTCTTTATTGAATGCTCAATT TGGTATTTTTGGAGAGTGCTGAGTTTGCCCGGGAACTTTGGATTAGTTTCTGCAAACTGCTTTGCTGGTCTTGGGAAAGGGAAAGAGGGTAATGTGCAAC TCGATCCACTTTTTGGCGTATTTAGTTGGAGTCAAATTATCACATCTTTAAGTAAACATCCTTGGAAGTTGAGCTACTGTGGGATATGATTAGGCGTTTG GCTTCTATTTGGTGTAAACTATAAGGACCATGTTCTTCCTATTGTGATTTCCTTCCTAACTAACTCTTTGCAATCTAATATTCATCTTAATGTATTTTTT CTTTTATCAAAAAACAACAACCTGGATAGCATGTTAAACGTCATGGGCACTTAACATGCATATTCCATAATTGTTCTAACTTTAAAAATGGGTGGCCCAA TACATGAAGCTCTACTTACTGGGAGGATTTGGGAAGGGTGTGATGATATGTCGATATGCATGCAGTCTTGACCCCTCGAGCGGAGAAGTTGTTGTCAGGA TTTGACCCCATGCCCTCCTAGTCACTAGGCAATAACCCTTACCATTGCATCAAGGCTCACCCTCCCATAATTGGTCTAGTTGACCAACATAAGATTTTTG TTTTTTAAATTTTTGTTGAAGAGACCAACTTGTCCTGACCCATCTCAAAATTTGGGTTAAGAAGGTTGATTATAATTTGTGGTTTTAACAGGGCAGGGTA CGGTCAACCTGATGAGTTCATAAACCTTATTTTTAGCTCTAGCCTCTAGGTAACAATTAGAATTTTGACGTTTCCATTAAACTTAAGAGTGTTGATTGAT CTCTATATTCAAATTGCCACTTAAGTATAATTAGTGAGAAATGTGTGTACCTTTTCATCCTACTGGGTAAACTTCATGCAGGCAGGCATTTGTCATTTGT AGCGGCATTCCGAATCTGCAATGTTTTTCATAATTGCATTAATCTCGAGACATTTCTCTTTTCAATCTTGTCATGCTTTCAGGAAATGGCTTTACAATCA ACGATCATGAAGAATGGGAAATGGCAACCAGATGGGCTACAGCTTTCGTGTTTGGACAAGCTTTATCCGTGGTTTCTCCTGAAATGGCATATGCAAGTGG CACAGTGAAGATGAATGAAATATATGAAGTAGGAGAATTATTTGATTTAGGGATCCAATTATTGTACTTGCTATTGTTATTGGGTTTGCTAGGGGCTGGG ACATACTTCGTGATTCGCCAAGTGCTTGTACGCAGAGAACTTGACCTTTCTGCCAAAGAGTTGCAGGAGCAAGTAAGAAGTGGTGATGCAGATGCGACAG GACTTTTTGAACTCGGCGCAGTAATGCTGCGGAGAAAATTTTATCCAGCTGCTACGAAGTACTTGCTTCAGGCAATCGATAAATGGGATGGCGATGATCA GGATCTTGCCCAGGTTTATAATGCTCTTGGTGTCAGCTATGTTCGCGACGATAAGCTCGAAAAGGGAATTACTCAATTTGAGACAGCTGTAAAGCTTCAG CCGGGCTATGTCACGGCATGGAACAATCTCGGTGATGCCTATGAGAAGAAAAAAGAATACAAGGCTGCACTGATGGCATTTGAAGAAGTCCTTCTGTTTG ACCCCGACAACAAGATTGCTCAGCCGAGGAGAGATGCTATGAAGGAACAAGTTGAAATGTATAAAGGAGTTCCACTCAAATCGAAAGAGAAAAGATGAAT ACCATTGTATCAACTCACTGCACTTGTCAAACATAAATACTAAGTTTCTGATATGAGAGGAGCAGTACTATACACCTTTCAGATGGATTGAATGATGATT CAAATTGGCTGTTATCAAAGGAGTTCATTTGTTCCTTTTTTCCGAAAAATGTTTACCGTTACCATGTTTGTTTGTATAAGAAAGAGATTGGAGAGGGAAT GATGTCATTATGTTGCTTAATGCAATTTTTTTAAAATGAAACAAATAAAATGATTATTGTGATAACTGATTGTTTGTCAAGCATCATTATAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_163067;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_369329

FPKM

• PAB: 0.4
• PNAB: 1.8
• PS1: 1.1
• PS2: 1.6
• PS3: 1.2
• PW1: 1.3
• PW2: 1.8
• PW3: 1.8

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_369329

• Blastp: Tetratricopeptide repeat domain-containing protein PYG7, chloroplastic from Arabidopsis with 76.47% of identity
• Blastx: Tetratricopeptide repeat domain-containing protein PYG7, chloroplastic from Arabidopsis with 76.13% of identity
• Eggnog: Photosystem I assembly related protein(ENOG4111J4M)
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019461390.1)
• Pfam: Tetratricopeptide repeat (PF13432.5)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;