Id Trinity | TRINITY_DN48740_c1_g1_i12 |
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Name Transcript | Ll_transcript_419429 |
Sequence | AAAGAGATGGCATGGCATGGCATGCGCATTTCTCAGTTTCACAGATTCAGTAGTTCATCACTGCTCTGTTGAGTGCTGACACAAACAAACTCTTTTATTT CTTTAGAAACGAAAATACAACAAGAGCAGTATAATGTAAGAGTTTTTGTTGTAATCGAGAAATAAGAAAATAGGGAAAGAGTATTTGCATATTATATTTG TCCAATTGTCCATAATAATTTTGACATGCAAATATCATTTTCATTTGAAAAAAAAGGATTCTGATATCATGGTTATTACACCATGTGTAAGGACATGATG GGTAAAAGACAAGGTTGTCTCTGAACCTAGGAATTCTTATATTTTAGCCAATCACATTGTTGGATCTTGTGTCAACTTGGCAGGGACACAACCAATAAGC TCCTACACAATTTATATTATAAACTATTACGGTTTTACGGTGAAGATGGTGGTCTTAAGGATGGGAGTGCATGAGGTTATGGTTTCGAGACCAACAATAC TAACATGTGGTTGCTGTTTAAGGTTACATATTTATAGTTTCAATAATGAGTTTATATAATAAAGAATATGTGAAGAAAAATGAATGAGTAACTTGTTTGT GTTTTTTGTTTTATCTTAATAAAATTGTATTAAGGGATTTAATCCCATATGTTTTTTGTTTAATTACAACAAAATTTCACCTTTGCTTGCATTGTTTGCA GTGTTAGAGGAACTATCGAAAGGTACAAAAAAGCATCTGCTACTTCCACAAATGCAGAATCTGTATCTGAAGCTAATACACAGTTTTATCAGCAGGAGTC ATCCAAATTAAAGAGACAAATCCGAGACATTCAGAATCTGAACAGGCACATTCTTGGTGAATCACTTAGCTCTCTGAGTCTCAAGGAACTAAAGAACCTT GAGAGTAGATTGGAGAAAGGTTTAAGCAGAGTTAGATCTAGAAAGGTATTATATAAGCTTAATTAGCATGTGACTAATTTAATTAAGCCATTTGGCATGT GAACCTCTAAAAGATAATTTCATTTTTTCCTAGTATTTTTAAAATAAATATGCATTATATATTTTCCTAGTATTCTATGGTTTGACAAACCCAAATTCTT GCAGCATGAAACTTTGTTTGCTGACGTCGAGTTCATGCAAAAGCGGGTACCCATCATTTCCTTTGATGTTATTAATTTTTGCTACTTTATCTTCAACAGA AATAATGAAAAAAAAACAACAACACAAACTCCTCCAAATTTTGTTAAAATAGAATACTTACATGGGTATAATACCTCTTCTAACAAATGTATACTTAACA CAATGTGCAGGAAGTTGAGCTGCAAAACCATAATAACTATCTGAGAGCTAAGGTATCTCTCATTACTTCCATAACTAACACACAGAGAGGTTAAGATATT AATGTGAAATGACATTAAATTTGAGTGTCATTAATTAGTAGAGTAAGATGAATAACAAGAGTATTGATGGATGGTGCAGATAGCTGAATATGAGAGAGCA CAACAACAGCAACCAAATATGATGCAGCAGGGAAATGTGTGTGAGACCATAGCATCACAACAATATGATAGGAACTTCTTCCCAGTAAATCTCCTAGATC CCAATCATCAATATTCACGTCAAGACCACACTGCTCTCCAACTTGTGTAAGTACTGCCTAGCACATGCACCTCTCACTCTTACAATTTGTTGTTAAATTT GCAAAAACAACTCGGGAAATTAATGAGTGGTGCCTTAAGAAAAACATTGGTCTAAGAAAAACATGCATAATGAGTCATTCTAATTCTCAATTTTTTGCTT TGTAATGGTACTTATTAGATGGGTCCTATATAATATTAGGGCTATCTTTTACAAGCTCTGGAAAGACTTTAATCCTTCTGAAAGGCTCAAACAAATATAA CTTGGAAGTGTGCTATAATGAAAAGATTAGGAAAATTTTTTGGACAGATAGATGAAAGGGGAAGTTATGTTACCTTTTCAGTTGCCTCTTTTGCTATACA AAAATAACAATATACTTCTATGGTCGAGTAAAGTCTATTAAGGGTTTTAAGAGCCCTTTCATTTCATAGTTGATTATTTCCCATCTCAATATTATAACCA TTTTGATATTTACTAACTTCCATTTTCACTTTTGCATGCAGTTGATGAGGTAGAAAGCCGCTGGAAATTCTGCTACAGCCTATCCATGATTTAATCAGTG CCTTTAGAATTTCCTTTATGAAGTTCTTCAAACTGAGATTTACCTAGAAAAAAGATACCAGCATTTGGCACCTATATACTTTATAAAATATTGTTTAACC TTTCATTAATTAAGAACTACTTTATATAAACTCCTAGCTAGTACATTTTATGTGTTTGATTGAACCTACTACTATAAAATATATGTTGAAATATGCACTC AGCATTGATTTTTTTTTTTTTTGGAAAGGCAACCACATGCATTTTATACAAATTTCTCCATTCCCCTAAATAATTCTGAGATTATGAATTAAAGTAATTG CAGATATTGTAGACTCTATAGTATTGAAGTCAGCAACTTCAATATAACTTCATTCTTAACAGTAGCTGCTAATTGCATAAAAATAAGCTAATATTAGTTC ACAAACAGTAATGCTGATAGGAAAGTTAGCCACTTTTTCAGATATTATTGTTATCTTAGTGATGAAGTTGTGTGGATTGCTGAGATAAGATGATACTAGA AATTGGATTATGAGGGTGCATACATTTTAGTAGTCCTTAAGAAGCTCATCAACCTGGCACCAAATGTTGAGATATATTAATTTAGCAGCTATACAAAGGA ATAATGCTTAGTGTGCATCACCTCACACATAGGTGAGGCGTCAAAATCAGAGTTTGAGTATACAAGTAATGATATGGAATCTACTTGAATAATTCATTGA AAACTGTACAAATGTGAGGTGATATATGTGTTGTAACATTATTATATACAGAAACTTTATGTTAAAAATTGTGCACTACAAAGCAAAATGTACATCTTTT TGGAACATATACCTTGGCGGGGG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_163621; |
Additional information | - |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_419429
Blastp | - |
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Blastx | Agamous-like MADS-box protein AGL5 from Arabidopsis with 78.05% of identity |
Eggnog | Transcription factor(COG5068) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT2G42830) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_014622400.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |