Ll_transcript_420657

• Id Trinity: TRINITY_DN48748_c5_g1_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_420657
• Sequence: GCTTTTCCCAAATATTTCTGTTATGTGCATGAACAATTCTGAATCAATCATTCATCCGTTTTTGCGTTATCATTGCTAATTTTGCGTGCATAGACTGTTC AGTATAGTTGAGGAAGAGTGAATTTATCCGAATTGTCTAGAGACCTTTTTGACAAAAATGTTTGAAGGGTTTTGAAGAAGTAAAGAGGTCAAAATTTCTG TGGAATTGTGCAATATTTGCTATTCTTCGGTGCATATGGTTGGAGAGATGCCCAGATATTTTAAGGTGTTTTGGTGTCTTTAGCATTGTTGTGAGATAGA ATAAGGTTTTTGGCTTCTCTTTGGTGCTCAGGTGGTCTTTTTAAAAGGGTTGTAGTTTCTGATTTACATAAGGATTGGGCTGCAATCGGTCATTGCTATT CGTTGTAATTTTCTGTTTTAGTAGTTTGCTGGTGCAGGATATCTTAACCTCACCTGTACCTTTTTCTTAATGAATTTCTTTGACCATAAAAAATGGACTG AATTTATTATGAAGCCTCCTGTAGAGTAGAGGAAAGACTTTATAAGGAAATTGACTCATAGGAATTTGGTATGTGGCTATTTTGGCAAGGCCTGAATTTT GTTTTCTAATATATACATAATATACTTGATGCAGTTTAAGTACTAGTGTAGTGCAACTTTTATGTTAGCTGATTGTTTGGAACTGAGAAATACTGATGGT ATTAAGGTAGAAAAATGGTGCTCGGATGCTTACCGCAGAGGAAAGTCCTCATAGAACAATCAGATTAATAATACTCAAAATGAAGCATCGACTAAACTCT GAATTTATGTTTTTTTACTTTGGGCTTGAGGTCTGTTTTTCCCTTTCTGTCTCCACATAGGAATGACATGCTTGTGACCGAGGTACTTAGTTCACATAGA TGCAGGGAGCATGATCAAGGTGACATATTTGCTTTATAATAGCAGCTTTTCTTGTTATTCCTTTGTCTCTGGAAATAGAACCTAGCCTCCAGGTTATGAT AATTAAAATGAAATGTTGACTATGTTTGTGTGACAAAAATAACATATTGGCATATTCAAATCGGGAGATTGATATTTCTTGCACAGTTCTACATTTTCAA CCGTTTTGTTTACCGCTCTGCTTGCTGTCCCAGATTTCATGTCATTGAACTAACTGTAATTTTTATGTTATTTTTCCTTGGCGAATTTGCAGAAGGGTGC TTTCAGTGTTGCCGCGAAGATGAATGCACCGGTCGTACCTATTACCCTCATTGGAACTGGCCAAATCATGCCTGCAGGAAAGGAGGGTATCGTGAACTTC GGTTCAGTGAAAGTTGTTATACATAAGCCTATTGAAGGAAACGATGCTAACATGTTATGCAACGAAGCTAGTAAGACAATAGCAAGTGCTCTGACTCAAA CCTGAGAAATGTTCTGCAAAATAGTTCCTTTAATTTCCATTACATGATGAGACTCAAAACCCATGTGCCTTGAAGTCAATAGGAAAGGTATGAATCAGAT ACATACATTTTACCTGTTTAGGGACCATTAGTACCCCTATGAAGCCCGATACTTAATACGACACGTCACAGATACGAGGATACGAGAATTTTGTTTTAAA ATTCCGAGGTTGAGTAACTGTACAGAATTATGTGGGTTTGATCAAAATGAGCATAAGAATATGCAAAATAGAATGAATTTGTAGGTGTAAGTGGATGATG TTAATACTTCATACTTGTTTTAGGCTTTTATTAGGAAATTGGTACTTATGAAATCATTTACACGATGCACGACGCTTTGGTTCAAGTGTTACATGTTTGA TTCCCCTTAAACAAGGTCTCGGGTTTGAGTCTTGTGAATGGAAAAAATACATGCTGGGAGAGTTAGACCCACATACATGTTGATGTTCTCAACTTGGACA TGATTGCCTCCAGTGCGAAGATACTTGTAGAAAACCAAAAAAATTTACATGGTGCACGTTTTTGCAAGAGAATGTTGATTAAGTATTATAATATCTACAG TTATGCTAGCCATGTATAACCAATCTTATGCCAAATTTGACTAAAAGCTTAGCAGTTTTTTAATATCTATAGTTGATAATATTTATAGTTGTTAATGCTC TATATACTAAATTGTATGTGTAGCAAAACTTTAACCACAACTATGTGAATGTGTTTTGAAGTTTATCATTCACTAAAAAGGAATATTCTCTGGGAAGTTG TAAAACTAATGCTGCTAAAGCTAAGTGTAGGATTAATATAGTGATGCATAGTTCCAAAGGGATTCAAGGTTATTGTGATTTTAAAAAGATTAATGCTC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_163683;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_420657

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0.1
• PS1: 0.2
• PS2: 0.3
• PS3: 0.3
• PW1: 0.1
• PW2: 0.1
• PW3: 0.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_420657

• Blastp: -
• Blastx: 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 1, chloroplastic from Arabidopsis with 59.72% of identity
• Eggnog: Acyltransferase(COG0204)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G30580)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019417020.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;