| Id Trinity | TRINITY_DN48766_c3_g3_i8 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_420580 |
| Sequence | GGGTCCAATGGAATATCCTGCAAGATGTAGTCAACTGCAGCGGGCAGCCTCGTTAAGCAGGTTTCGTCAGAAGAAGAATAAGCGATGCTTTGATAAGATA GTTAGATATGATGTACGTCAAGAAGTTGCACTCAGGTGTGATAATTCACAAGATGTAGACTGGACTTTTTTAACTTAACACAAACCTATTTACAGTTTGA GATTAAAAGTTGATGCTGCTTATATGACATTCTATCATGTGAATGATGATTTGGGCATTTGCTACTATGCTTCTTCAAACCAATGTATTGATACGTACTA TAGTAGACATGACATAATATGATTGAACAGCATGGTAGATGATAGATATATGGTAGCAGCTGGGCTATGGGTTTCCTCAGTAGCATTCTCAAATAGCATC CTTCCTCAGTATGTTGAATGCATAATACATGGAATAAGTTGTTGGACACATAATACAACAATAATTTATACCTGCTAGAGTGAAAGGCTGAATATTAGTC TTTGGATTAGCATGGTGTATATACTATGTATGTACATTGGTATGCATACTGTATAGTTTTATCCATTGTATTAACAAATGACATGAAGTTAAACAGATAT TAACTGCCTTTCTTCACCAGAACTTTTCTTGGAATTGATATTCATTTTTTGGATGCACCGAAGAAGGAAGCTTTTGCCGTCTCACTAACTTTCATGTTAC CTATGTTTCACTATTTTCTGTTGCTCATCATTGTAACTGTTTAGTTTTTGCTTGTGTCATTTTGTACTTATTTGATGTTTAACTGCAGGATGCACCGTAA CAAGGGTCAATTTATTTCATCTAAGAAACAAGATGGAGCTAATAGTAGGGGTACAGACCAGGAGTCAGGGCAGGATGATAGTCCATCCGAAACTGCATGC ACACACTGTGGCATTAGTTCAAAATCTACCCCAATGATGCGGCGAGGGCCAAATGGTCCAAGATCACTATGCAACGCTTGTGGACTTTTTTGGGCAAGTA GGGTATGTATTTTCTCCACATGGTTTGTATTTGGAATTTATATATTTTTAATATGTACGTTCATATACCTAAAGCAGCTCAAATTGAAATGAAATTTACT CTTATTTCACAGCCACATAATTTTCTAAGTCTCCTGTGTAGCATTTTCATTTTAATAAAGCGTACAACATGAACATGTGGCTTATCTTCCTGCTCTGTAT GCTATTTTGCTGTATGCATGTTAAGTTGCACATTTCTTCCAGCTTTTTCTGTTTTTTGTTTCTTATGCATGCACTGCTCTGTTCCTTTGCTGTATTGCAA TTTTAAATGATACTGTTAAATGAATTTTAGCTTACAGTTGGTTTGAAAATATTTAAGTGATAGTCGTTTTGACTTTCATGTCCAAAATGCTGGTTCTTGA TTCTGTTTCCACTTCCTGCTACATCGTGGACTTAATTGCATGGAAACATAATATTAAGTTACCCAGGAAAGTGAGAGAATCTAACATTGTATGTGGTTTA TTCTAGCACTAATTGAGAATGTCAAAATCTTACGGAGTCTTGATATTGCATATGCACTTGTTAGTGAAGTATCTTCTTAGTGTCATTAAGGGGTAATTTA ACTTTCCTTTCTTCTCAACTTCACATTAATCTTTTGCCTATAGGGAGGTGCAACTATTTTCTCTGTGAGCATTTAGTCAAATTTGCTCAACTAGGAATCT CCAATTTGGTATCCACTGTAACTGCTTTGTGGTCAGTAGTCCCACTTTTTGACATTTGTATTGTGCAGGGTGCTCTGAGAGACCTTTCTAAGAGAAACCA GGAACTCTCTCTTATACCAACGGAACAGGTTGGTAAAAGTAAGTACTCAAACTGTGGGACTGCCATCCGTGCACATAACAATCTTGTTGCTTTCTCTGTC AAAGATAACCCGGATTTGGTATCAGATTGTTGAGTTATCCAGTCAAAATGCCATAGTGGTTGCATGTGGCATAAGTAGAGGCTTCCATTCATATTGACCA ATAGAATGAATGTATAGTTATAACAATGGTCTCATCAATACAAGAGTTTTATCTTTATATGTATGGATCAGTGGCATTAACTGTTGATCTCTGAATGTAT AACCTGGAATTGGGACATTTGACAAGAGAAACAAAACGATTCTTGCAAAGCCATAAATCAACAGATACATTTATAGAAGGTGAAGAGACCTTTAAC BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_163835; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_420580
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | GATA transcription factor 25 from Arabidopsis with 75% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_003544834.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |