Ll_transcript_420871

Id TrinityTRINITY_DN48773_c1_g3_i4
Name TranscriptLl_transcript_420871
SequenceTTTGAAGGTAACAAACCTCCCTTCTGAATTTTTCATTACTAATAATTTACTGATAGAAATAGAAAGGTAGAAGGTGAGGTTAAAGTGAGAGTGATATGTG ACTATGTTACATTCAGAGTTTATATAGAAACAGAAGTAACTCAAAACCTCACAGAACCTTCTCTTCACTTCATCAACTTACATGTGAGAATAACAAGTAA TAGTGTAACAGTACTAGTGTTAGGTATTGAACTTGATGTCTCTGCCATTATCATCAGACCTTCCAACAATGGAAAAAACCTCTGAAAACTTTTCTCATAC AACTAAAGCCACTGGGAGCAGTGGCTTAAACCTTAAGGCTACTGAACTAAGATTAGGCTTGCCAGGTTCTGAGTCACCAGACAGAAATGAGAATAATGTT GTGTACCCTTTAAGCATGCACAACAAGTGTTTGGTTTCTGGTGCCAAAAGGGGTTTCTCAGATGCTATTGATGCTGGTTCTGGCAAGTGGGTTCTCTCTG GGAATGGTGGATCTGAGATGGGTTTGGGTAAAGATGGGAACTTGTTCTCTCCTAGGGGTGTTACTGCTGTTAAGGCTCTTGTTGGAGCTGAGTGTGCTAA CCAACAAAAAGTATCTGCTGTTAAAGATAAAGTTCACTCTTCAAAATCATTGAATGAGAAGAAGCCTCAGATATCTGCTACTCCTGCTAAGTAGCATCTT CTTCCTTTATCCTTATTCTTCTTGTTTGTAGTGTTAAATTTTGTTGTTGCTATATTATGTTTTTCTTGTAAAATATTTGTCTAATTTTGTTGTTGATGTT GGTTCATTTTTTGGTTGTTGTCCGATTCTGGTTTATAGTTTTCTTATTTATGTGTGTGCATGTTAACAAATTGATGGAAATTAAAATAAATTATACTGTT GATTTTTTTGTTGCTGACTTGCTGGATTATGTTTCCCCGGACAATTATTTGTCCAGTTTTGTTGTTGATGTTGGTCCTTAAGTTCTGTGATTTTTTTTTG TTGCCATGTCTCTCAGTTTATACTTTTCTCATTTCTGTGTGCATGCTAACAAATTCATGGAAGCAATAAGTAAAGGATGTTGATGAGCAATTCGGGATGG GATGCTCCAAAGAAAGATGAAAAGGATTATTTTCCCTGAAAAAAGTTTTACTTGGTTAAAATTTATTTTTAAAGGGTGAAGAGATTCTTTCCAGGTGAAA CTTTGAGATGTCAAAGCCTGTAACTATTCTTATTGCTGATTATCTTTTCAGGTTAGCCTGTAGTGTTAGAGAGGCAATTGTTAACTCTATTCTACGTGAT TTAAACAATATTCCTATGCTGATCATCATCTAATGCTTGTTTTGGGCATTCCATAGTTTTTCTTCTCTATCATGGTTGTCTTTGATTTCATTTTGTATAT GATTTTGGATTGAACATGTGTTAGTTAATGCTTGTTTTGGGTGTTCCATAGTTTTTCTTCTCCATCGTGGTTTTGAAGTTATAATCAGAGATCTCTACAA AGAAAATTTTATATCTCAAATTCTCAATTGAGTTTCCTTTCAAACTCCCTATTATGTAGCGTAATTGTTGAGCCTTCTTATGTGAATCAGGGAACAGGTT GTAGGATGGCCACCAATCCGTTCTTTCAGGAAGAATTCAATGGCTACTCATCCTCAAAAGAATGATGATGATGATACAGAATCCAAGTCTGGTTGCCTTT ATGTAAAAATCAGCATGGATGGTGCTCCTTACTTGAGGAAAGTGGATCTCAAAATCTTTAGCACATACAGGGAACTATCTTCAGCACTGGAAAAGATGTT TAGTTGTTTTACAATCAGTGAGTTTTTTTGTACTTGTAAATTGCAATAAGTGATTTTGATGAGACAAATATGAAGAATTTATACGACCAGATATAGCATC ATTTTAAATCTAGGTGATGATTAAATTCAGATCCTAAGTCTTTGAATATCACAACCTCGGTTAGTTAGTTCCATCAGCTGAGGAAATTTGTAGTAGTGCT ATGAATAGGTCTATTAGTTCCTTACCGATGGAACATTCTCTGTGTTAAAGATACTGTCATAAGTGATCTCTCCAAAAAGTTTAAGCTGTTAGGTGAGATA ACACAATCAACCTTATTATATGTCTAACACGAGTTTGTTGGATGGAAAAGATCGAAAGCTAGACCAGTCATAGAGGCTCTCATGATGGTGTTATGTCATG AACTAACTTTCCCAGAAGCTTAAGCTGTTAGGGGAAGGATGAGTGACTTTAACATAGATTCTGATGTTTTTATCAATGACGAGTGCAGGTCAATGCGGTT CTCATAAGTTTTCTGAAAGCAGATTGATGGATCTCCTCCATGGTTCAGAATATGTGCTCACCTATGAAGACAAGGACGGTGACTGGATGCTAGTTGGAGA TGTTCCATGGGAGATGTTCACTGACTCTTGCAAGAGATTGAGGATAATGAAGAGTTCTGAAGCAATTGGACTAGGTTTGATTCACAGACTGACACATTAT AATCTCTGCTATGAGTTTTATCATATTTGGATTCTCTTTTCCTAATTTGTACATGTGATCATTGATGAGTTTTCTCAATTCAAGAACTAAATATAAAAGA AAGCATAGATTATAATATCTGAATTATTTAAATAATGGTATATGAAACTTAAAGAGAAAAGCATGTTATATATCTATAGGCGTTGAATTACATGCCAATT TGTGCAAAAAAATCCTCCAGACAGAAAATGAGCTAGGAGTTTTTATGTGTAAACTATTGTTTATATAGCATTACATGAGCTATTGATGGAATTTGTGATC TCTAGCTTCAAATCTTTCCTCCAATATGATTACACTATATACAACTCCATTGTCTATTTCATTTTACAATTTTATATGAAATCTTTCCTTCATTTTACAC TATATAGAACTCCATTGTCTACTCCAAATTGCCTATTTACATTCCCTACTAACCAATCATGTTTTTATTGTTCAATTGTACAATATTATGAGATGTCTAC CATCTTTTGAAGGTTTTAATACAAGGACAAAACTTAGGTGTTGTTCTTTAGGTGCTTGTGTACTAAAAATATAACATGTCTAACACTTAACATGTGTAAC ACTATCACACATTTTATATTCTGTTGGTGAGCTATGACACATCTTCATGTTCTTATAGTGAACACTGAACAGCATGACAAACACCTAAAGATCAGTTTTG TCTTTAATACTATCAATAGCAATGGGAAAATTTATAACATATGTAGCATCTTTTTTGCTCAAATTTAAGCCTCAATCTGATTCATGCAGCACCTAGAGCC ATGGAAAAGAGCAAAAGTCGAAACTAGCACAATGCTGTTGTCACAGAAAGATCCAAACTCACATTTAAGCACATCATATGATACCAGAAGCAGGGCAGGA GTTGGGGCCTCTCTTCCTTGCTTATGTATAATTCTACATATGGGATTTGAGCTTCATAGACAAGCATTTATTAGGCAAAATATATTGTTGCAGACATTTA AGGTTTTCTTAGGTTTGTTTCCCTATCATTTCTCTTAATCACTGTTGTTGTGGACTTCATAAGGCTAAAGCTATGTTTGTATGTAAATTTTGTATTTAAG TAACTTATGCAATATCTCTAAAGTTGATGTAAGTTAGCATTTTAAATTTCATGTCGAGGAAAAGAAAATAACACCATACTTTGTTTTGTTTCATAAAGAA GCTTTATGGTTTCCCAACTTTTTTGGTTCATGTCATGTCATGCCATGCTTGTTCCATGATGTAAAATAAGTCTTATTTTGATGTTTCAAAAAAAA BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_163883; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_420871

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_420871
BlastpAuxin-responsive protein IAA27 from Arabidopsis with 49.02% of identity
BlastxAuxin-responsive protein IAA27 from Arabidopsis with 64.77% of identity
Eggnogauxin-responsive protein(ENOG410YEX5)
KeggLink to kegg annotations (AT4G29080)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019457845.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;