Ll_transcript_421246

• Id Trinity: TRINITY_DN48778_c3_g2_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_421246
• Sequence: ATTAACTTAACAATCATAACTTAAATACCCAAGATTTTTAAAGATTATATAAAAAAGTTGGAGAAAAAGGCAAACATAAACTACTCTATGAATTAGCCAA CATACAAGTGGCAGAAAATGAGAAGATTCTAAGTGCTTGTTCTATTTTGACGCGGCTCTTCTATTCTTGCTTAATAATCATCAAGCACGTAAATAATCAC TTTTTTTATACGCGTCCCTTCTCCATTTTCTCTGCCCTATATAAACACACACCTTTACCACTTTTTTCCCCAACTCAAATTAAAATCAAAATCGCTCAAG TACAAAGCACCCCAAGAAAGATTTTGTCCATAGATATTACACACATTGTGGAAAAAGCTTCATTATTTCCTCTACATAACATCATATTCAAGAATTAAGC TTTTTCACTTCTTACATCCATTCAATCTAACTTTTTCAATTCAATTCTGAATTAATCACCAATGGCTCGTTCCTTCACTAACGCCAAGCTTCTCTCCGCT TTCATTCTTGACGGATTCTGCAGCTCTCTCACCAGACGTGGGTATGCTGCAGCAACTGCAACACAAAGTGCAAAAAATGGAGGAATTGGTTCAATGAGTA ACAAAATGGCACCCAAATCAGGGGAAGGTCCCAACAAGGTTTCATGGGTTCCAGATCCTGTCACTGGTTACTACAAACCTGAGAACATTAAGGAAATTGA CGTAGCTGAATTGCGTGCTACACTTCTAGCCAAAAAATTCAACAACTAATTTTACCCCACAATTTCTTTCACTAAAAAATGGTCTCATAAGTATTTAAAT AAGAGTAATTACGCATTTCAATCCCTAATATTTTTCGACTTTATTATTTTGGTCTATCAAATAATCTAAAAAAAGTTCAAATGTAATTCAAATTGGTCAT TTTAAGATAAATTAGTTCATTTGAGGTGTTGTAAAACATGAATCTGACTTACCTTTGGACCATTTTGCGTTTTTCAAAATTTGAGGGACCAAACTGATAA AATCGAAAAATATATGACTGAAATTAGTATTTACTATTTAAATAATTATACTAAGTTTTAATCTTTAGATTAAAAATGTATTTGGATGGGATTGGTTGAT TCAAATGCGGGTCTCTTAAGTTTAATTTTATGATTGGTGTCAAATGACTTAAGGAATCTTTTGGGTGATTCTGATGAAGGTCAGGGAAGAATAATGTTGA GATGCACTTTTATTAGAATGACCATAACCATTTGCAGCTAATCAAGATTCAAGGTCGTATGTATTCCAATTATATTGAATGAATATTATAATTTTTCTTA ATTAGTTTTAACATGATTGAAATAACAGTCTTCATATTCCAGCTTACACAGTTTTTAAATCAATGGGTTGTATGCTCAAGTTCCGTATGAAATGAACGAT AGATAAAAAAAATGGCACCCAAAGGATTAACAATAAAGTTTGGTGCTATTAATTCAAATACGAGCTTGATGATTCAATTTATATCAATTCATAGTTTTGA TTCTTTAGGTTATAAATATACTTAATACTTATTTGATCATGTTTTTAAAATAAAATTCTTGGAGAAATCTTTGCATGATTCTTACTTTGTATAACTTATC ATTTTTATATAATTGCTAGATACTATATATTTATATCGAAATTATTATCTCATGCAAGTTGTTATATTAGTTATTAGACATAGAGCTAATTCAATAAATT TATAATTCCCACTTGCGAGTATGACACTCGTTTCCAACATCTTTTTATCAAAGTATGATAATCCATTGCCAATTTTAGTGTCATCAATCATAAACCCTTT TGAAGAATAGCTTGGAATAATAATCATTAGTTGAAAGGTTATTATCCAACCAGTCTACCTGGATACGACAATCCATTTCCTTATACTTGTTCATTGGTGA TTTCTATACCAATTTGTTGATTAGCGTACACCTCCATTAGCTAGCTACTACCATATATGCTTATTATGTGGAGTAGATGTAGTAGTAATACTAGTTGATG TATTGAAAACAGAAGCGTAGCAAACGATTTAAAGGATAACTTGATATCAATAACGATGATTTGGGGGTGAAAATTTTGGTTTAGAGTTCAAATTTCATTT ATGAGTAGGGACTGATAAATATTTACAAAAATCTCGAATGACTAAAATGATTGTTTTTTCTTAGAGTTGGTGAGGGGTAGAAGATGACACAAAAATACAT TGTTTTGTGATTTAATTATTTTAGAAATAAAAAAATTCGAAATGACATCATTTTGAGTGAGTTGACAAAAATTTCCAGCATGGAATCGCCATGTGTAACA ATGTGTAAATTAACATCTCAAGTCAGCGTTCCGCTAATATTAACAGATGTGGGATAACAAAGAGACTAACATGAATCTATGCTTTAAAAATTAGGGATTA AAATGGCAATTTAAATTTATTAAGGACTATGAATGATTATAGGGCATATCAGAGTCGAGTTTTGTATTTACCCAACCTTAAACTTGTATTTCAGAACCCA ACCCTGAACACCCTGAACTCAGTGAGGTTGAAAAGACCGGAAACACGAAACTTTTATATTTTTTTCTTTTTCTTTTCCTCAGTAGGTAAACAAACATGCA TGTTTTATGCTAAAATCCTATGAACGCCAGGGCTATGTTCTATTCGGTTGAAAAAAGAAGGAAATAAAGTGAGAGGAAATTGATGTGTAATCCTCTCATA TCATATCAACCAACAAAAAGTGAGAATAATGTTGAGATGCATTTTTGTTTTCTCTACACTTTATTTTCATTTTCTATCATATCAACCAACAAAAAATCAC CATATTTATTACCCATTTCCTTACTGAATTTGATGTGTAATCCAAATATTAAAGATATTATTTTGTAGTTAGGAAAAGTTG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_163913;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_421246

FPKM

• PAB: 89.4
• PNAB: 0.6
• PS1: 1.2
• PS2: 0.2
• PS3: 0.9
• PW1: 6.9
• PW2: 4.6
• PW3: 1.3

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_421246

• Blastp: -
• Blastx: Indole-3-acetic acid-induced protein ARG2 from Vigna with 64.65% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019440749.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;