Ll_transcript_286195

• Id Trinity: TRINITY_DN48804_c7_g1_i3
• Name Transcript: Ll_transcript_286195
• Sequence: CTGAAGTCTCATAAAAAACCCTACTCCATCCCCTCTTTCACTTCACCGCCTCATTTTCACATCTGAAACCCTAATTACTCTGCCACCATGCCGCCAAAGT TCGACCCCTCCCAGGTTGTCGACGTCTACGTCAGAGTCACCGGCGGTGAGGTCGGTGCGGCGAGTTCCCTCGCCCCTAAGATCGGTCCACTCGGTCTCTC CCCTAAGAAGATCGGAGAAGATATCGCCAAGGAAACCGCTAAGGATTGGAAGGGTCTCCGTGTAACCGTCAAGCTCACCGTCCAGAACCGTCAGGCCAAG GTCTCCGTCGTCCCCTCCGCCGCCGCTCTTGTTATCAAGGCTCTCAAGGAACCTGAACGTGACCGTAAGAAAACTAAGAACATCAAACACAACGGTAACA TTTCTCTTGATGATGTCATTGAGATTGCTAGGGTTATGAGACCAAGGTCGATGGCGAAGGAACTAGGTGGAACTGTTAAGGAGATTCTTGGAACGTGTGT ATCTGTTGGATGCACTGTTGATGGAAAGGATCCTAAGGATTTGCAGACTGAGATTGATGATGGTGATGTTGAGGTTCCTCAGGATTGAGAATGAAGAGGT TCATGAATCTCTGTTTTCTTAATCTTGTGTTTGAATTATGTTTTTTCTATATAATTTTGGGGAACATTGTTGAACTTTTTTGTTTAATGTTTAATTACTG CTTTGGATAATTTAGATTATTTGGAGAAGCCACAGTTAATGTCGCTTACAGCATGATATAATTTTGTCAATTTAATTTTATATTATGCTTCAGTTTTTAA AGCCCTTTTAAATCGTTCCATGAATTTTCTTTTGTTCTCATTGTTAACTTAAAATTTCGGTACTGGCATAGCTTGAATTCCTGATTCACGTTGCATTCCT TTGTGACTGTGCTGATGCTGTTTTGTGTTGGAGGATAATATGTGGACCCTATGCCGTAATGGATCGAGTCCTGAAACTGTGACCTTCGAAAACTACCTCA TTGATTGTTCCCGATTGAAGTTAAAACTTTGATTTTTACCCTTTTTAACCTGTCGTCTGATTTATATTACTCATACTTGCATTCATTATCACAAATTTTT AAAATTTATTTCCCTTCCAATTAGACACTTTCCCATTTCATTCTATCTAAAACTCTAAAAAAAAGCTTAGTAATAAAAACTGGTCCATTTATTGGTAACT ATGGGCATCCATCTCACATTACCTTAATAGTTTGGAGATTTTAAATGCTAGGAAGATTGGTTCCCTAGTCATTTTTTGTTGCTCTGTTAGCCATTGATAG TTTATATATGGCTTTTATGTTATTCCCTTCTTTATCTGCTTAGGTATGTTTGGGAGTTGAATTTAAGACATTCATCTTGTCAGTGAATTTCATTACTCTA AAGCATTCCATTTGCTCCAGGTAAGGTACTGAACAACTATTAATGTTTTCCATTAAACAACTATTAGGGTTGAAAAAACACTTGCTTCATTGGTGAGTAA TGAAATCACTGGTTATATTCTCAGAGAAAACTGAACTTAAAATGCTTTTTTTGCACTATTAAATATTACATCTACTAAACTTGGAGATAAATTGAAGGGA GAAAAAAATATTCTAAATTGATAAGTCAGTCATCGACTTATAATTAAGAGAACAAGTTGTATATATCCATGATATATGATTTGATCTATTGTTGAAACAT TATCTACATTCATGTTTAATTATTATTGTCTCCAAAATATAAGTAATACAAATTAATAGTGGATGATACGCTGACAATATAAATTTTTTTATATTGTCAG TGTATAGATTTTAAACTCTTCCTATAAAAGTAATAGAAATAAATAATGGATGAAGTATTGATTATTTGTAAATTGAGAATATATATAATTAATCTTAACA TGATTTCTATTAAAAAAGTTAATTATCATTTTGATTAATTGTAAAACTTTCACACATCAAGGGACAATAAACGTAAGACAATATAAGATCGAAACAGAGA AGGAATTATTGGAGATTGAGAGGATTAAAAGTTGAAGAATGTGTAATATATATGGTGTATGATAAGCCGACATTGTTAACAAAGTAGGGTCGTTTGACCT CATTTTTATCTTTTTGGTGTTAGTTGTAAATATTTACTATGATAGTGTTACTTTTTGAATGTCGTGGATGGGAACCACAACTTCCATGGAAGTCGTGGAT GAGAAATGCGATTTTCATGTGGGAGTCGTGACTAACATCCACGACATTCAATGGTTATGTGATGGTGAGAAAGTTGTGTATGGGAAGACGAGTTTCAGTG AATGTCGTGGACCCCACTCATGACATTCACTTTCTATAAATAGAAGCCCACAATATTGTTGATCGACAAAGCGAAGCTGAAGGTAAAAAAAAATTAATAA CTAAGGCATTTACTTTGTATATTTTGTTATTTGTTGAAAGTTTTGTAACATTTTATTTTAATGCAGATGATGATTATTAGAGACATTGTTACTCATTTTA GTGAAGATGAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_164077;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_286195

FPKM

• PAB: 1.2
• PNAB: 8.6
• PS1: 4.3
• PS2: 5.2
• PS3: 4.9
• PW1: 4
• PW2: 3.1
• PW3: 2.6

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_286195

• Blastp: 60S ribosomal protein L12 from Prunus with 92.17% of identity
• Blastx: 60S ribosomal protein L12 from Prunus with 92.17% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019414002.1)
• Pfam: Ribosomal protein L11, N-terminal domain (PF03946.13)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;