Ll_transcript_286071

• Id Trinity: TRINITY_DN48850_c2_g1_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_286071
• Sequence: CACACCCTCAATGTCAATAAAGTTAACTTCTTACATGAATGATTTGATCATGTTACTACTTTGCTAATCCCTACCACATTCACTTTATAGAGATAGCATA CTGCCAAACCTTAATCAACCCCACCACTATCTTCAAACCCTATTTTTTCCTTTGCTTCCAACCCAACAAACTACACCAATATTCTCTTTCTTCCTTTTGG TTGCAGCAACAACACCACACCCACTTTCACTTCACACCCTTTATTCCCTTCATCTTAGGCCTTAGAATCTTAAGACCCTCTTAAACAATGAACTTGACAC TATTTCCAAACTCTTCAGTTTCATGCTTCAATACACTCTTGTTCTTGTTCACACTCCTTCCATTCTATGCAGCAGCAGGAGCAACATCTGTTTATTTTCT CATTCCAAACCAATCTACAACAACAACAACAACAACAACACCATCAACAATCCCTGCATTTCCTGAACAAGCCAATGCTGAAGGGTGCCCTCTAAGCCTC TCAGATGAACACTATGATGGAATAAAGAAAGCATGTGGATCCACCAAAGATGGTGCTGCTAATAAGAATCTTCACAAAAGTAGGTGTTGTCCTGTTCTTG CTGCATGGCTCTACTCAGCATATTCTGCAACAGCACTTGGACATGTTTCAACATCACAAGGCCATACAACAACATCATATGACATGCCCCTTTTGCCTGA TGATTCTGAAACATGTGTTAGTGACTTAGGGAAGGCTTTGAAAATGAAGGGAATTGAGCTTATGAAGCCTAATGAGACTTGTGATGTGGTTTATTGTTAT TGTGGTATTAGGCTTCACCCTTTGAGTTGTCCTGAATCATTTTCTGTTGCCAAAAGTGGGAATCTTGTTGGAGATGAAAGTGTGAGAAGATTGGAGAGAA ATTGCTTGAGTAGTAGCACTAATGTTGATGGATTTCCTGGTCTTGGAGGGTGTTCTAAATGCTTACATAGCCTTTATTTGGTAAGTTTCAAGCAACAAAA AGTTCTCTTTTTTCTTTCTCTGTCTTGTTTTGCTGTTTTTTCTTCTCCTTTATCTTTGCTTCTGCTTAGTACTTTATTATTGGGAATTTGATGGATCTTG CTCAAACTTGAAGAAGGTCAAGATGATTTTCTATATTTTTTAAGTACATCTTTATATTTAACAAATTGTTAAAAAAATTTATAGAATACATTATTATGTT TAAATAAGTTTTTAGTTAGGATTTAGGAATAAGGAGTTTATCAACGATTTAAGACCTGCTAGATAATGAATAGACGAAAAAGTCAACGGTAAATTCATTA GAGTGACATTTGTTAAGTGAAGTAAAGATGCACCTTAAAAGGGAATTAATTTCTTACTTACACACTCTGATACCCTTTGTTATGAAAAAAAAATAAGTTT TCAGATGACTTCTTTCTAACAATGATATCATTAAATCTTAAAACTTATTACAGGGACACATAAAGGCTTGTATCAGTCTTTACTAACAATAATTAACTAT GAAATTGTAATTTATCCTATCATGAATCTCAATACTTCTTAAATGAAGAAGTTCTGTTTTGCTTTCCTTTACTTTGGATACTACTTGCTATAATGCTATT GTTATCAATGTTGGTGGACATGGATCTTGTGTCCTAAATCTTGTCCCAAAGTCTGTACCAAATCAATTTCAGTGTGACACATCAGTTGAAAAATTAAAGA TAATTGATTTTATTTATTTTTTCTTCATTCTCATTGACTTGGTATACAGTTTGGGACACACTTGGACAACAGATCCCCATCCCAATGTTGGTACAATGCT TTACACGCCTTAAAAATCGTGTAGTTCACGAACGTGGACTGAACCATTATTGGTACAGTTTAGTCACATGAGAATTAGTGAAAAGGCTAATTTACTTGAA TGAGTCCAGTATTGAATGAAGATTGAGAATGTCTAAAGGTTAAGCATAGTTAGCATACAATACTTTAAAATTAATACAAGTTTTATACCCAAAAAAATAA TGAAAGAAGTTTTTAGAGTATTGGTATACTAAGGCAATTGAGTTAGTAGTATTCATTTTTTTGGGTCACCGTTTAATTAGTCTTTTTTTGCTAATTCTCT TTGGATAAACTTGGTTGCAAAATACTTTATTGGGTATTTTTTTTGTATCAAGAAGCTACATGACTTTAATAGTACAGTGTTCTTGTTTATTACAAGAAAA GTCTTCTTATTTCTTAAATGTAAATGACATCAAATGTCAATGTAGTTCATGTTCTTAGCCTGCCCCAGCCATAAATGTTTATTAGTTCACTTTGTTGGCA CACTTGTATTTTTCATTATCACACGCTCCCTTGAAAATTGACTGCATAGGAGTAAAACTAATAATATCCCTCTGATTCTTCTAAGTTTCACATATTGCTT ATTACTATTTTTATTTTTTATTTTTTCACATAATTATTAGCACTATAAGACAACATCTGTGGCAACTTTTGGATTTATCGTTCCTGGTTCTGATATACAG TTTGCAAATTGCAGAAATGTTGTCGATAGTGCCTATTTAGATTTATAAGATCCATGCATCTATATTTTAAGAATTTGATTTGATTCATCAAAATCTCTGT TTGTTGTATTTGAAGATACTAGTTTGTCTTGTTGCTTCATATAAAATAATTTAATAATGTTACATTATTAAGCTTTTATGCTTGCATGATTTTCTTGGCA AAACTTGAATCATATCTTTCTAAGCCAAAAATTACAACCCCAATAATCTCAAGCATTTTTGTTACACCCTTATTTGACACAACTACAACTCAAGATACAG TGATGGTAAAATGATGGAATTACCTTCATGCCGTAAGAATTTGCCTTAGAGTTTATTTGTGGGTTGAGTTTTGAAGGGAAAGAAAAGAAAAAGACAGACT TCAAGAATATCTTACAAATGTATTTCATAACCCTAAAGTTTCATTTTCCTACAAAATCTAACTTAGAAACTCACCCTTATGTAAAGAAGTATAGATTACA ATAGCAGCATATACCTTATTTAAAAGGGTGTAAAAAGGGATGTAGTTCACAATAATGAAGATGAACAATATAGAAATAATTATTTGATTGAATGGATGGT GCATCCACCTTTTGTCTCATCATATTTTATATGTTGTCATGGGCTAATGAAAATTTTACTATTATTATTATTTTTGTTTCATTATCATTAGTACGGAACA ATGTATAAGATAAAATCTGGGACAACATATTTATATTTTGTTACACCAACCACAACTAGGATGTAGTTTAACATGCTTTGATGCACCAAACAAAACAACT TTATACCCAAACATGTGCAGTTTATGTTTAACACATAGTAATTGAAATGTTGCTTCTATAAGCAGCTTAAAAAGAAGACTTCAAATTCAAGCAAAACAGA AGACAGAACCACCAAGATTCACAACAAAGACTGTGAACTCATGGGATTAACATGGCTTCTAGCTAAGAACCAAACAGCTTATATTCACACAGTTTCTAGT GTTCTTCGTGCTTTGATGTTAAGCTCTGATGGCTCTGATCCACAATCTTGCACTTTAAACAGTGATGGAATGCCTCTTGCTGTTGATTCTTCTGAAATGT TTGATCAATCTTCATCAACCAAATTCCAAGCACCAATGTTTCTTTCTTTCTTATTTCTTTATTTTCTGATTGGTATGCATTTCAATGTATTATCACCTAA CTCAAATTAGAACAAAAGTAGTACTAATATCAAACATGGCATTTTGTAAATCTGAATTTCTCTCCGTGCTTAGGAATGTAATTTTTCTTAGTTATTAATT GGAAAAGGAGAGATTATTTTGATTTAGCTTACACTATCAGATAATCTTTTTTATACCTTACCTGCCTATCTCGAGAACAAAGATCTAATATTACATACCA TGTTCCAAATTATGTCACGTGTCAATGATTTGATGACAATGAAATAAAAACAAAAAATAATAAAAATT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_164495;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_286071

FPKM

• PAB: 1.5
• PNAB: 15.4
• PS1: 9.8
• PS2: 8.4
• PS3: 6.5
• PW1: 9.5
• PW2: 14.5
• PW3: 7.5

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_286071

• Blastp: Uncharacterized GPI-anchored protein At4g28100 from Arabidopsis with 39.36% of identity
• Blastx: Uncharacterized GPI-anchored protein At4g28100 from Arabidopsis with 39.36% of identity
• Eggnog: NA(ENOG410YB0S)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G28100)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019424164.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;