Ll_transcript_285026

Id TrinityTRINITY_DN48860_c1_g1_i14
Name TranscriptLl_transcript_285026
SequenceCTCTTTTCATTTTTCTCCAACACTTTTCTTCTTCTTCATTTCAACCTTCAACGTTTCATTTATATGCTAATACTTTCAGATTTCAATTCAATTCATGTTT TATACTAAACATGCTATTGCTATTCAATTTCAGCATTTCAATCTTCCTCTGCTAGTTCCACATGATTCTTCAACCACCTTCTGCGAGTTTCCTATTCTCG CACATTTTCTCTTCTACCCTCTGTCCTTGCACCAATCAAGTTAATCACTTTGTTTCTTTCCCTTTGTCCCGAAGAAGAAGACGAAAACGCTTCATTGCGC ATTCTGGGTGTAGGAATTCCCGAAGAAAATTGACCCTTCGTTTCTGTGCTATTCCACCAGATAGTAGTTCCAACCGAAATTGGAACACGGAATTCGCAAA TTCAGCTAGAAGGGGTGCCAAAAGTATCGTTTTTAATCAGATTAGTAATGAAATTGACGAGGATAATGATAGTGGTGCGTCTCGTTCTCAAGAGTCACAA CAGATTCAGTTAGGTTCGAATTTTACCAATTTTCAAGAAGACCCTATTGTAGATAAGTTAAGAACACAATTAGGGGTGATTCACCCAATTCCATCGCCTC CTATTAACCGAGATGTGATTGGTTTGTTTGTGTTCTTTTTCTTTGTCGGCGTTGTGTTTGATAAATTGTGGACTTCAAGGAAAAGGAACAAAGTTAGGAG TGAAGATAGCTTGCGCAGCGTGTTGACGCAGGTACCAACAAGCTCCTCTTGGGTTTTGGAAAAGGATTTGCAGAGAAAAGAATCAGTTGAATGGGTGAAC ATGGTGCTTGGGAAGTTATGGAAGGTTTATAGAGGTGGAATCGAGAACTGGATTATTGGGCTGCTTCAGCCTACTATTGATGACTTGCAGAAACCTGATT ATGTGCAGAGGGTCGAGGTTAAGCAATACTCATTAGGGGATGAACCATTGTCTGTTAGGAATGTAGAACGCAAGACTTCTCGCAGTGTGAACGATTTGCA GTACAAGATAGGCCTTAGGTATACTGGTGGTGCTCGCATGCTATTAATGGTTTCTCTAAAGTTTGGCACTATGCCAATTGAGGTGCCTGTTGTTGTTCAT GATTTTGACATTGATTGTGAACTTTGGGTAAAAATGAGATTAATACCAACAGAACCTTGGGTGGGATCTGCTTCATGGGCTTTTGTTTCTCTTCCAAACA TCAAGTTTGAATTGTCTCCTTTTCGCCGGTTCAATTTAATGACAATTCCAGTGCTCTCAATGTTTTTGATTAAACTTCTTACTGAAGATTTACCCAGACA ATTTGTATACCCTGAGAAAATTGATTTGGATTTCCAAATGGGAAAGACAGTTGGTCCTGTTGCTAACGATGTTAAATCTGGAGAGATGCAAGATGGGAAA AAAAAATATGTTGGCGAACTATCTGTTACCCTTATGAATGCTCGAAAGCTTCCTTATCTCTTCCATGGCAAGACAGATCCTTATGTTATTCTTAGTCTTG GAGATCAAATTATAAGCAGCAAAAAGAACAGCCAGACTACTGTCATTGGGCCTCCTGGAATGCCGATTTGGAATCAAGATTTTCATATGCTTGTTGCAAA CCCGGAAAAGGAGAAGTTACTTGTCCAGGTTAAGGACTCACTTGGGTTTGCAGATTTTACTATAGGTACAGGAGAGGTATGTATTATGTGCCATGCCATA TTTGTTTTCTGATCTGTTGTTTAAGATTGTATTGAAACTTCATTTGCCATATACAATTCATGTATTGGATAGTAGGAAGTTGAATGAAAAAATGGAAATA TAATTTCGTATTTAGCTCTAGTATATATGTCCATGTGTGTGTGTTTTAATTGATAAAATTTTCAGGTTGATTTGGTATCTCTTAAAGACACTGTACCAAC AGACAGGATTGTGGCTTTACAAGGAGGTTGGGGAATTTTAGGAAAGGGTTCTTCTGGGGAGATACTACTACGGCTAACATATAAAGCATATGTGGAGGAT GAAGAAGATGACAAGACTGAGATGGATGCCATTGATGTAGATGCTTCAGATGACGAGTTGTCTGATTCAGAAGAAGCCAATGTCATTGATGAGACGAATG AAGGAGATCCTATGTACCGAACTGATAATGAGTCATTTATGGATGTATTAGCAGCATTAATTATAAGTGAGGAATTCCAAGGAATAGTGGCATCTGAAAC TGGGTCTACCAAAATTTTGGATAATAGCTCAAATACAGGCTCCAAAGTATCAAAGTCTACTGTTGCCAATGCTGAAACAATTTCTTCTACTTCTGACAAC TCTGAAGGTTTTGTAGGGTCAGCATTATTTTGGTTTGCTGTGATTACTAGTATATCACTATTAATTGCAATCAACATTGGCGGTTCAAGTTACTTCAATC CTTGAGATGAGTTGGCAGTAGATAATAATCAATTCTACATTGGGAGTTTATTAATATTCTGGTGATGGAGGAAAGCATATAGCGGCGCACATGATTTTTG GCTTTGTTTTATGTGAGCCACAAATTTGAAAAATTCAGCTTAAATACCTTGTTTATATGTTAGAGTTTTGGACCCACCAAAAATAAAATAGAATCACAGA TTTCTTGTTTCTCTCGCCCGAATCTGATTGATGTAAAACATGACAGAGAATTTCTTGCATAATATGAAATATTAATTGCATTGCACCAATCACATCATTG TTGATAGTCTATGGTTGTTGTTAGTTAATAACCACTTCTTTTTCTTCTATGATTGTCCCATGTTAAGGATACTTCACAAAACAATTTTTTATGTGAAAAA TTAATGTATCACCTCCCAGGATGTGAAATTTGATGATGATGTTTGGATGGTAAAAACTGAC BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_164596; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_285026

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_285026
BlastpSynaptotagmin-2 from Arabidopsis with 23.19% of identity
BlastxSynaptotagmin-2 from Arabidopsis with 23.4% of identity
EggnogDomain-Containing protein(COG5038)
KeggLink to kegg annotations (AT1G20080)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019450948.1)
PfamC2 domain (PF00168.29)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;