Id Trinity | TRINITY_DN48903_c0_g2_i10 |
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Name Transcript | Ll_transcript_436294 |
Sequence | CTTTCTATATATATGACATCAAAAGAGGCCAAGTTCAAGAAAAAGCATGTCATTCTTGTGGGAAAGAGAAAATCTAAGGTTGCCATTTTTTTTCTTTTTA TCTTTATTTCTGCTCTGACATAATATCTTTTTATGATAGAAGTTTAGAATGAATTAAGCTGGGGTTAACAACTTAACATAAGGATATTCACCTCCAAATC TGTTGAAGATAGTAGATATGAAGAGTGAAAAATAAAGTGTGTGTGTGTGTGGAATAAGCATGGGAAGAGGGAGAGTTATTGTGGAGAGAATAGAGAACAA GATCAGTCGTCAGGTAACATTCTCAAAGAGAAGGAGTGGTTTGTTGAAGAAAGCTTTTGAGCTATCTGTGCTATGCGATGCTGAAATTGCTCTTATCATC TTCTCTAGTCGTGGCAAGCTTTTCCAGTTCAGCACTTCTGACATTAACAAAATCATTGAGAAGTATCGTCAATGTTGCTTCAACATGTCACAGACTGGAG ATTTAGTTGAACATCAATCATCACAGAACCTATACGAGGAGGTTTTGAAATTAAGAGCCAAGCATGAATCTCTTGAGAAGACACAAAGGATTTTTGAAGG AGAAGATCTAGGGCCACTTAGCATGAAAGAATTGCAGAGTCTTGAGAAACAAATTGACAGAACGCTCTCACAAGCACGACAACACCATATGCAAAAGCTG ACTGCACGAATTGATGAGTTACGCCAACAGGTTCAGAATCTGGAGGGGGTTAACAAACAATTGGAAGCCAAGGTTTTCCGATCCCTTTTAATTATTATAT GTCAATATATGTATAGTTGAGGAATTAATGCTATAAAAACTTCAAATAATTTACGGGCTCATACATAGTCTATCATTTATACTCATTTTCAAACATTTGC TCCAGGAAACGGATAAACTCACCCACACCATTGGGGAAGTTTCTAATAACTCGACCACGTCGGTTTGCAGTTACAACGATATTAGGTTGCATGATGTACA ACCCAAACACTTTGAATCTGGGACAGCCTTACAAACATGGTGTGCACTTTATTATAATTTTTAGTCTTTTTATTTTACTTTAATTTATAAATATGTAGAT GCATTATTCTCCTGGCTAAATTTAACTTGGTTTCTGCAACACCACATATAGTCCATTGCAATGTCTTGACTGCAGTTTTAAGTTTTGGCAATTGCATGTC TTGAAGAATATGTGTACATAGAGTATGCAGTCAACTATAAATAAATGTGTTATTGTCTATTTTTTGGTATAATATTATCTATTCAGATTGTTATTTTAAT GACACAAATTTATTTCTTAATTATACCTAATAAGCTAGTGTCTATATAAGCTTTGTCATGTGACCTACCCGGTGCTGATGGCCATATTCACATGCATCTT GTTAATATGAATATGGTAATGGATTTTTTAAGCAGAAAACTATTTTATTAATAAGAGAGAGACGTTTGATAACACTCATCTCAACTAAGTCAATCACCAT ATTTTGCAAAGAGTGGCCTAAGAAGAAAGAACTAATAGATAGCAGGTTAGTATTGTTGGAAAGTAAGTTTTACATCGCCTATCTCATCATTGTCTTGAGA ATAGTTTAAATATCTGTTAAACTACTTCTTTCATTACCAATTGATTCTGAGAATAGAATACGATGATAGCACGTTTGGTAACATGCATCTATCTCAACTT GTTTGTTTGTTTTATTTAAATAAATTGTTGTTGCAGTTGGTTTGGGCATAATCATCAGCAAGCTGGTTCAAATGTAAGCAGGAGTGACACAAGGAGCGAG CTAGGCCAAAGCAGTCATAACAATAACAATAACAATGGATGGCTGCTTTGAATAATATTCATGTTAATTACAAATAATCAAACAAAAAATGTTCATGTTA TTATTGCTTGTTATGTGTATCAACTAAATTATAAACTTGTACCAGTAAGTCTCATAAAAATATCTATAATTGATGGATTCCATTGCAATGTAGCCAGCCC AAAATTAAATTATATGTTTATGTAGACAATATAGCAATTCCAAAAACAAAAACTATTGCCATGTACCCTTATAACTAATCATTTAAGTTTGATTTTACCA CAGGGTTCTAAAATTGATTATTGATTGAACAATGGATAATTAATGTATGATTTCAATTTGAATATTTAAAATGTATTTAAAATGGGGCATGCGGTGCAAT GAGAGTTGAGAAATAGATAAGCTTTATAAGAGGGTGAAATTGATGATTAATGATTAATTAATTGGTGAATGGAATCTCTCTCCTTCCATGCCTGCATAGT AATAATAGTGATAAAGTAAAGATCTGATTTTGCATTACTCATCCTCTTTCTTTCAAACCAAATCCATCCTCCATGGCAAATATTACCCCCTCAGGTAAAT ATGATAATGGCACAAAAGGAGAAAGCAAAGAAACAAGCGCACTGGTTGTTTCCTTTGGTGAATTGTTAATAGACTTTGTGCCAACAGTGACCGGAATATC ACTAATTGAAGCTCCCGCTTTCAAGAAAGCCCCCGGCGGCGCTCCTGCAAATGTGGCTGTTGCCATCTCTAGGCTAGGAGGTTCATCTGCTTTTGTAGGG AAGGTTGGAGCAGATGAATTTGGGTATATGTTGGCTGATATTTTGAAGCAGAACAATGTTGACACATCTGGCATGCGGTTTGACTCTAATGCAAGAACTG CATTAGCTTTTGTTACACTTAGAGCTGATGGTGAGCGCGAGTTCTTGTTTTTCCGAAATCCTAGTGCTGATATGCTTCTTCATGAATCAGAGCTCGATAA AAATCTCATAAAGCAGGCTAAAATATTACATTATGGTTCCATCAGCTTGATTGATGAGCCATGCAGATCAGCTCATCTTGCTGCTTTGAGAATTGCTAAA GACTCTGGTTGTATTCTCTCATATGATCCAAATTTGAGATTGGCACTATGGCCATCAGCAGAGTCTGCCCGGGAAGGCATAATGAGTATATGGGATCAAG CTGATGTCATAAAGATAAACGAGGATGAGATTACATTTTTGACTGGTGGTGATGATCCTTATGATGATAATGTAGTACTAAAGAAGCTTTTTCACCCTAA TCTCAAGCTTTTAATTGTTACTGAAGGATCAGAGGGTTGTAGATATTACACCAAGGATTTTCGGGGCAGGGTTGCGGGCGTTAAAGTCAAACCTGTTGAC ACAACCGGTGCTGGTGATGCATTTGTTGGTGGCTTTATCTACAGCATAGCTTCTGACCAAAATGTTCTCAAGAATGAAAAGCGTCTCCGAGAAGCTCTAC ATTTTGCAAATGTATGTGGTGCCATCACAGTAACAGATAGAGGGGCTATTCCTTCACTACCTACAAAAGAAGCTGTCCTTCAATTCATGTTAGAAGCCAC TACAATATAAAAAAAATGTAACCATTTGTTGTTAAGCTTATATAGCTTAGTTCATGCTAAGCTTCTTGTATCTTCATGCTTGGTGTAATTTTGTGATATA ACACTGAAGGTTCAATTTGCATTGCTCGCTCAGGTTATAGCAGTTGAGCATACATTTTCATGTTTTGTAATAAAGCAAAGGCATTGATTTTAAAGATCCC TCACAAGCTTTGTGAGTTATGATTGTTATTCACACTGACAGACAAAGCTTATTTCATGGCAGGGCATTAAAAATGAACTTGTAAAGTATTGTCTTTTATT GTTAAGAATGAACTTGTAAACCAAAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_164941; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_436294
Blastp | Probable fructokinase-7 from Arabidopsis with 75.07% of identity |
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Blastx | Probable fructokinase-7 from Arabidopsis with 75.07% of identity |
Eggnog | pfkb domain protein(COG0524) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G51830) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019442167.1) |
Pfam | pfkB family carbohydrate kinase (PF00294.23) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |