Ll_transcript_436787

Id TrinityTRINITY_DN48917_c2_g4_i1
Name TranscriptLl_transcript_436787
SequenceTGGTGATGCTGTAGAGGATTTCGAGGCTAAGAAGATTCATGGGTTGTTGTTTAAATTTGGGCTGGAGCTGGATGTTTTTGTTGGAAGTGCTTTGGTTAAT ACTTATTTGAAATTTGGGTTGGTGGGTGAGGCACATGGGATGTTTGATGAATTGCCTGTAAGAGATGTTGTGTTATGGAACTCGATGATTAATGGTTATG CGCAGATTGGAAGGTTTGAGGAGGCTCTGGAGGTGTTTCAGAGGATGGTGGAAAATGGGATAGTTCCTTGTAGATATGCAGTTACTGGTGTTTTGTCTAT ATTTTCAATGGTGGAAGACTTTCACAATGGAAGGGCTATTCATGGATTTGTTATAAAAATGGGTTATGATTCTGGTGTTGTTGTTTTGAATTCGTTGATT GATATGTATGGGAAATGCAAGTGTGCTAGTGATGCCTTGAATGTTTTTGACATGATGGATGAGAAGGATATATTTTCATGGAACTCAATTATATCGGTTC ATGAACGGTGCGGTGATCATTATGGAACTTTGAGGCTCTTTGATAGAATGCTAGGAAACATGGTTCAGCCTGATTTGGTTACAGTTACTGCAGTGCTACC AGCTTGTACTCATCTAGCAGCTTTGATGCATGGTAGAGAGATACATGGGTATATGATTGTAAATGGATTGGGGAAGGATGGAAATAGCAGCGATTTTGAT GATGTTCAATTGAACAATGCTTTGATGGACATGTATGCAAAATGTGGGAACATGAGAGATGCTCGTGTGGTTTTTGATCATATGAGAGAGAAGGATGTGG CCTCATGGAACATCATGATCACAGGTTATGGAATGCATGGTTATGGTGATGAGGCATTAGATACATTGTCTCGAATGTGTCAAGCTCAAATGGTACCTAA TGAAGTCAGTTTTGTTGGATTGTTGTCTGCATGCAGCCATGCTGGCATGGTCAAAGAGGGCCTTGAGTTTCTGGCAGAAATGGAGTCAAAATACGGTGTT TCTCCATCAATTGAACACTACACTTGTGTGATTGATATGCTTTGTCGAGCAGGGAAGCTCATGGAGGCTTATGATTTAGTACTAGCAATGCCTTTTAAGG CTGATCCTGTAGGATGGAGAGCTTTGCTCGCAGCATGCCGTCAACATAAGGATACAGACTTAGCTGAGATTGCTGCAAGTAAGGTGATTGAACTTGAGCC GGGTCATTGCGGAAATTATGTATTAATGTCAAATGTTTATGGAGTAGTTGGTCGATATGAAGAAGTATCAAAGATGAGACATACAATGAAGCAACACAAT GTGAAGAAGAGACCAGGGTGTAGCTGGATCGAGCTCATGACCGGTGTTCATGTTTTTATAACTGGTGACAGGACCCATCCCCAGACCGACTATATTTATG CTGGTTTAAATTCATTGACAGCAGTTTTACACGAGCATGGGTATGTCCCTTTGATCTAGCATTTGGTATTCAGAGAAAGTCTAGCATGAATGCATGAAGA CTTTATTATTGGGATGGATAATGTGTTGAAAAGTATAGCAATAAAGCCTTTTCTCTTCTATCTTGCATTTCAGAAGTTGCAGCCTTTGCGTACCATTCTT TAGTTATTTAATGTTGAGAAATGTTGATTAGAGGATGGAGAGCATAGTTATCACAAAAACGTAATGGTAGTTCAGTGCCACTGTTTATATGCATGACAAC TATACTCACTTGCATGAGTGTATTGGCTGACAAATTACAAGTTAATAATTCTACATTACCAACCGCCTATTCTCTGCAGTGTTGTTCAGTTTCTAACATT CCTTTAAGGGCCTATTTTGTTCATTAAATCAACTCATATTAAGCAGTATAAGAGGGTGAGCATCAACGAAACAATAAGGTTGTTACCTTGTTATCTAGAG TTCGTTGGTTCAAATCTCCTTAAAAATGATCTCTCTACTTGTGGGGGTAAACATCTTCTGTCCCAAGAGTATGTACTATTTTATGTGTCACTGGTTCTCA TTGGTCAGAAAATTATTTTATTATTAAATTTTTATTTTAAATATATGTTTTCAACTAATCACAAGTATTGGGACACAGAGTGACACAAAAAATAACACAG CAGATTTGGTCCCTACTTGCGGAGGATAGGGTGAGAACCTTGATGTTTGTACTCAATATGGCAATAATTCTTGAGTTGTCTTTTTCTCTTCTTTCATTTA TCTCACAAGAAGTTACCAAATCCTTGTGTGGATAAGTTCTTTATTTTCGTATCATAAATCATGTATTGAAGAATTAATAATTGATACTTTGATAGTAACT ATTTAGATACCCTTTTTATAATTGAAGTGTTTAGATTAACTGTATTCTTAGGATTACTTGTAACTGAATATAAGATAGTTAGTTGTATGAGATGACATTC TTGCATTAATAAAGGTGTGG BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_165064; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_436787

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_436787
BlastpPentatricopeptide repeat-containing protein At3g14730 from Arabidopsis with 53.93% of identity
BlastxPentatricopeptide repeat-containing protein At3g14730 from Arabidopsis with 53.93% of identity
EggnogPentatricopeptide repeat-containing protein(ENOG410Z7Z7)
KeggLink to kegg annotations (AT3G14730)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019441753.1)
PfamPPR repeat (PF01535.19)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;