| Id Trinity | TRINITY_DN48936_c2_g1_i1 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_437623 |
| Sequence | TTGGAAATCCAATGGTTTAGATTTATCATTAATTCAAACTATTGAATTTCCAATGAATTGTAAATCTTTTAAACTTACTTTTGGAGTAACTTCATCATCC ATTTGTTTATATGCCAAATAACAATTACATGTTATCTGCTAATCTTCTTGGATGGATCAAATTATATATATTTTTTGTTATTTATGATTGTAATGTTATG ATGGGTTTAATGGCTTATATCAGAAGTTTGGTTAATCTAATTGGGTTTCCATTCATTGAAGCTTCTGTCTTTTATGATCGTTCAATCTTCTAGACATTTT CCTTCATTGTCACTTTTCTTTTGTTTTCAAGGAAAATTTGATTGCATAAACGTTTCTTCTAAATGTTTAAGTCATTAAACTCGTCAATGATATTCCATGT GTTCCAACTTCCAACTTCTGAGCAAGGTTATATTTGCCTGATATAAAATGCTTATTTATAAGATCATTATACATTTGTCGTCTGATTCAAGTTGATTCGT GAATAAACATCATTTAGAATAGATGATCTCTCTCGTATTAGATTGTTTGTATAAGAATTTTGCATTTGTTTATTTACAATTCCACCACCATTTCAAATGA ATAGCTTCATATCATAGGAGTCCACAAGGAACAACACACGATGGGCGATTTCAAATGGAACAGGAATCCATGTTCTCAAAGGACCTTGTCTCCCTATCCT ATCCAATGAAGGAGCAGAAAATAATACTTTACTTTTTTATAATTTTTTCTTTTAATAAAATTATATATTTTAATTAGTTTGGTACACCAATGAGGATAGA GGATCTCCATCGTTTCAAGTGAACTTTCCTCTCCAACTAACTAAACCTTAAATTAAATTACAGTGTGCTGCTATATTTATTGTACACAAGAAAAAAGCTT AAATATTTTCTTATTATTAAATAGCTAAATTATTCTTTATGGTTGTTGCTGAATTTTAAGTAAGTATTATTTTTTATTTATTTTGAGTAAAATTTTAATT AATTTTAGGCAATCTAATACAGATTGGCTTTCTCTCTGACTAATGATAACTTTTTTTGGTAAGTTGACCAATGGCAATTTAATTACTAATTTTATTCTTG AAACTAATATCATAATATCATAAGTCAATCTTTTTCTTGAAAAGTTATTCTAATTGGTTTAGATTTTTTAAAAGAATTTAATATTTATTTACAATCAGCA TAAGATTTTGTTTACTATCAGTGTATCATTTATTATATATGGTACTACTTTTAGTTTATTATTTATGATAATTTATATATAAACGATAAATAATAGCAAT GAAAAATATGTCATTTATACGATTTTAAATTAAGTTGTATAAAAAAGGGTTGAGATAAATTAATACTAACACGATTTGACTTTTGTTGATAAATTAGCCA ATAACAATTTAATTTCCTCCATCATATTATTAATTTTATCCTAAGTGAATTTGGGTTATGACATGATTATTTTTTTTTACTTTAATCACCACCATCAATT TCATCATTAAGATGTTGATAAATTATCAATTTCTTCCCTAAACTTTTGTTAGTTCTTTCCAATTGACTCATGACATTGTCATCAATGTTGTGCTTGCAAA AGCTATAATATTTGGATTACATTTTTTATTGAAAGATTGCCATTTATTTAATAAGAGCGTAATAATTTTATACGATAAATGCATCATACATCATATGAAT TATTTTTTATATTTAGATCAATGGATTTAACACATATAAATGATCAATAAATAATATATAGAGAATATAAAAACTATTATATTTCAATACATAATCTATT TTTTCTCTTTTTCAAGAGGTTAAACATCATTCTAAAGGGACTAGCAGATTTCATTAGAATGAAATACAATAATATTAAGATTATCAAAATAAAAAATGAT ATATTATTTTACAAAATCTTCCTACATCATATACATTATTTTAAACTATGCATTAATAAGTAATTTTGACTGAAATTATTTTCCTTAGATGTAATTCCAA AGTAATTGTTTACACGAATAATTAATCCTACATCAATATAACTTTTTATAACAAGAATTTATAACATCCTAAAAAAATTATAAATGCTAAAAGTTTTTTG ATGATATTACACAAATAATAATTAATTAATAGGTATTTTGTGACAAAGAGGTCCTAAAATTAAAACCAAAGGAAAACAGTGAGAGCTGCCACAGAAGGCC GAGGAAGAAAGCGTTGGATCGGAGAGTGATGTGGGAATCAATTATTTTAACGGTGATTGCCACCGCCGGCAACAACATCGGTAAAGTTCTTCAGAAGAAG GGCACAACCATTCTTCCTCCTCTCTCTTTCAAGCTCAAGGTTATTAGGGCATATGCTCTAAACAAACCCTGGATGATAGGTTTCCTAATGGATATAGTTG GGGCATTATTGATGTTAAGGGCATTAGCTCTGGCTCCTGTGTCTGTCATCCAACCAATTTCGGGTTGTGGACTTGCGATTCTTTCAATCTTTTCTCATTT TTATCTCAAGGAATTAATGAATACTGTTGATTGGGTTGGCATTACGCTAGCAGGTTTTGGC BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_165216; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_437623
| Blastp | Probable magnesium transporter NIPA9 from Arabidopsis with 82.88% of identity |
|---|---|
| Blastx | Probable magnesium transporter NIPA9 from Arabidopsis with 82.88% of identity |
| Eggnog | Pfam:DUF803(ENOG41124JW) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT5G11960) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019415859.1) |
| Pfam | Magnesium transporter NIPA (PF05653.13) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |