| Id Trinity | TRINITY_DN48937_c3_g2_i6 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_437032 |
| Sequence | CAAAAACTTTGTATCCACATACTCATAATGATCTTACTTCATTTCTCACCCCTCCTTTTATTTACTTTCCTCATCTTTCCCTATATTTCTACCCACCTTC CCTTTTCTAACTATATAAACACAACTGGGTTGGGATGTGAGATCTAAGTCTCAAAGGCTCAATTTTCTGCTCAAGCCCTTCTCATACTTTTCCACAGCTT TCTTGAACTTCTTATGCATTTTAAAGTTCTCCATCTTCAGAATTTAAAGCCCTAGAAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAGAATATGGCAACTTAGGCTTTGTA GTTCCTACTCCTTGACCCTTATCATTTCATCTCATCAATATATCACGGGAAGATGGTGGGAAAGACTCGCTTTACCAGAATCCAACACTCCTGTTTTCAG TCAGAAAAGGTATTTCTACAACAACTCTTTTTCTCTTGGGTCCAGGATGATGAACAGTGACAATGTATGTTTTTTAAACAAAAATAAGAAAAAGCACATG ATAAAGAACAAATTTAATAATACACAGGACTTTAAACTTTAAACTAGAATTAGGTGCACTTTCCCATTTACTACAAAACTGATTCATTCAATCAAACTGT GAAAAAAAGAGTAAATGTTTGCAGAGAAGGTTCCTCTCTTTTCCTTTTATCATTAATAATAATAGTTCTTCATGTTGCCCTTTTGGTTAGGTGAATCCAC ATCTTCTCCTACATTTCTGTGAAAAAGGTTAACCTCTGTCACTGCATGACATCATTTTTTTAACCACTCCTCTCTTTCCTGACATCATTTGGCCTATTGA TTGATTCCTTGTAACCCCCTCTCTCATGTTTGGCTGTCTCTTTCTCTCTACAAATTCATGTTGGCGCTGAAATCATGGGTAATTTATCATACTTGTTGTC TCGTGTTCTTCACTTGTCACTAGATTTTCAACCGTATTACAGTTTTACACATCACACATATACTGACTGCATTGTTGTGCAGAGCTAAATAATAGTAAAT AGAAACAATTCAGAATACAAGTATAAAATCAACAAAATTTTCACCTAAACACACTAAACTTTTCGGTGTAGCAGCAAATCTTTTGCATTAGTGAAGCAAG AAAATCATGAAGATTGTGCTTAGAGATAAAGTTTAGAAGCAGAAAAAGAGAGAGAGAACCTTTAGCAAATAGAAGGGATAAAATTTAGATACAGTATAAA GTTTTAGCCAAAGGGAATGCAACAAGTTGTACACATAAGAGTAGGACCACCTAAATTCAGATTTAATCAGCAGGCAGGCACAGAGGCATGGTACTTCTGT GCTTCTTTCTACAAAGAAAATACATCATAAAATATATACACCATGTCATTATTAATTGCTTATGCAAAAATTTATATATAGATAAGCTTGACGAGAAAAA AATTAAGACACTAACTGTATGCATAGTGAAACCTTCAATGACATGAACTGAATCCTGGGCCAAATTTCCTAGTACGGGTATACATTGCTTTTGAGCATTG ACATCACTGTGGAATAAATATTATAATATTATATATACAAAGGAAGGAAGAAAAAAGTGTGGTAGTATATTTCGTATGTCTGAGGGTAAACAGGAACATT TCATTTGCCATGCAGTGTAACTTGCCCTCGTGATCTTTCTGACCATTTTTACTATATTAACCTAAAATCCACTATGGAAACATTTTACTCAATGCAATAT TGTCAATGAAACTCTGGCACCACTCACGTACGTACCTCAACAAAGGTATATTGGAATGTTCAGATTAAATTTGCTTTCAATGCTAACTAGAAGCCCAAAA TACTGTTTTTAATTACTGCGTTTCTAGAAATAATTAAAGTCTTTTAGCATCAAAGTAAAAAACCTACCCTATCTTTAAGAAAGGAAACTTATAAGTTATA AGCATAATGTGCATGAAGCTAGCAGAAAATATAATCACCAATAACCATTTACAACATTACAACCCAACAAAGTACATTACCATTAGGTGAAATTAAAAGG GAATACTGCAAGCTAGATAGGCACAAACAATTAAAAAGAAGTACGCATACTTAGTTCACGTGATTGAGTAAAAGTTTGTATAGGTTACATTATCCGAAAA ATCAATAAACATAATGGGAAAATTGTATTTGATGTTTTTGGTTTTTGTATCTTATCCGTTAATTGTTCTGGGAGAGATTAAAACAGATTTTCTTGGGTAC AAAAAATAGATTATGAGATGCAATGTATATAGTATAGAACTTTTATTTGTCATTTCTCTCTGTAATTTAACCTTTCTTTATTCCTGTCCGTAAGAATAAT AGTTGTTGTTTTTTTAAAACAAAGCCATTCACCTCATCTACATATTGAAACTCCAATCCAGTAAACTAGTGAAGTAGTCAACCTCTCTCTAATATAACCT TTCTTTATTCCAATCCAGTAGTAATAATTAGTTTGGTCTAATGGTTATGGAAACGGATTTAATTAATAAAGTGAAAGAGATTAAGAATTTGAGTTTTACT TAGAACAAAATTCTAACATTCTAAAATTTGCCAATAAAATAAGAATTAACTTACAATAATTAGCTTATTGAAACTCCAATCCAGTAACAAAGTCATTAAT GTTCTTTTTAGGTGTTAGCACCGATTATGTTCTTAATCCAATTGATTATAAAAAAATTCCAAATAAAATAAAATTAAAGATGTAAGCTGTAATAAAAAAA TCCTTGCCTTTGATTTCTACTTTATCTCCAAAGATGTTTTCATCTTTACCATATGGGCCTTGTGTAGAATGTATAGAATGGAAAGAAGAGTAAGTATAAA AATTTGAAGCGGTTCTCTCCTACTTAGAAAATTGTGCAAAACAAAAATTCAGTAAGAAGGTGGATATCGTCCTATAAAAATGTATCACTCTATGTACTTC CATTCCATTTATGATTGGTCAGAAATATAATTAATCATTATTTTTTTAACTTAGATACATTTTTTTTCAACTAATAACATGTGATGACACATGAAGGGTA CACTTTGTGGATGTGCTCCCCAGTAAGAAGTGGTCGGTAAGACATATTAGAGTGTTCGATCTCAAATTAGAATATACACCATCTCTAATTTTTTTTATTT TATTTGTATCATCTAATTGAAAAAACAGATAATATATTTTATATTAGTTGAATATAATTAACTTGAGACATAGACTATAAATTTGTTAGGACATATGTTC TTCAAATTAAACTAGAAAGTGATTTAAAAAACCTAAAACCAATCTAAACTTCAACTTTTTGGTTTAGATTAGATTTTTAAAGAAAAAATTGTATTGAATA ATTGATATTTGTTCTTATTCTTTTTCTGGTAAGCAAAAATACTTCAAAAATTAAAAAACAAGTTAAAAATAACAAGTAGTACTCATATTTACATAATATA TGTAGATCTAGTATAGCCTTATAGTATTAAATAAACTCCTTAATATTCAATATATATTATCCTTGATAAAAGATCAATATTTATATTTTCAAATATTAAA ACTAAACCTAGTTAGAAGATCATCATTTTAGTGGCAAAAGATTGTCTCTTACGGGAGATGATCTGTTTGCAATTTAAATTTTGGAATGAAAGTAAAGAAA ATAGAAGGTTTTTAAATTTTTTCACCAATATATTTTAGGATTCTCAAGTCCTTGATTTATTTTCTTTCCTATCTAAAACTAAACTAGTAAATAGATCTTA AGTTACCACTTAAATTCTCCAAAGATGAAATGTCCATTAAGCTTAAACTCCTCAAGATGAAGTCTAATAGGACGACTAATATGATATTAATATCAAATTT CAGGTCAAAAGTTGGTGTAAAAACAATGATGCAAAAGGACCTCTTGGGATTTGTACATATTCTTCAATAATTTTTTATAAAAAAATATAGGTGAGTTTGG ATTTGAGGCCCCACCAAAACTATGAAAGGCCCCATATTTCTATGAGCGCTTTTTTGAGGTGAGATATTAATTAACCTGTCAACAATTTTCATTCTTTGCA AGTAGAATTTATGGCCATGATCTTGTGGACACTGAGATAAATACTTACCAGCTGGATCAATTTCCATGGAGAAAAATAGATACAAGTAATAAAGGTATAA AATACGGATAAAGATCTTTTGTCTCAAACTCTGTCCCAAATTCTGTCCTAAACGAATAGCAACATGCCACGTCAGTTAAAAAAATTAAATATTCATGTTT TTCTTTATTCTGATTGGCATGGTACATT BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_165220; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_437032
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | - |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | gma-MIR396b (MI0001786) |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019462641.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | MIR396 (RF00648) |
| GO | - |