Ll_transcript_437284

• Id Trinity: TRINITY_DN48941_c1_g1_i4
• Name Transcript: Ll_transcript_437284
• Sequence: ATTAATTAAGGGAGGAATTCAACCTCCACTGTATACCTCTCTAAAAATTAAATCAATGCTGTAAACAACAGCGATTCCCTTCTCTATTCACCCTTTCAAA AGTTACAAAACTCACCACCCTTATTTTCTAGGTTTTCCAATTCTCCATTTGAAGAAGAAGAAGAATCGATTACAGCAACATGATGATGATGAACACAATG GGCTTGTGTTTTTGCAGTGTCACTCCTATTCATATCAGCAACGCTCATGCTTCTTCTTCTTCTCTTACTCGTCCCTCTTATCCTTCTTCATCCATTTCTT CTTCTCGCTCTCTCATCAATTCTTCCTTCTCTCCCTCTCTATTTATTAATTGATTAATTAATTACATTGTTATTGGTATTAGATTGTGAGAGCAAAAGGT AAGTAATTCAATCAATTAATTAGGGTTTCAAATCCCAATCTCACTTTATATACATATGCAGTATGGTTTGGTACATGTTGTTGTTGGAGATTTACTTAGG GCTGAAATATCTACTGATAGTCCAAATGGGAAGCTCTATTCGTTCTCTCATGTTGGTTAGTTCTTATCACATCTCTCGGTTCCTATTCCATTTCTTCCAT TTTTTGTCGCGTTATTCAGATCCCTGAAGACTCTTTTGAACGCGTATTAGGCACCGTAATTTATCGTATGCACATATAATAATGAGGTTTTCATTTGTCT TACGGTACTTGATTGTTTAATTTGTGTATTATGATTGTTTAGTGTTATTGTAGGTTTAAAGGTGCAGGTAGACATAACTGTTATGTAGATGATTGCTGAA ATGTGAGAATGTTATTAAGTTAATTTTTCACGATTAATACTCAGAGATTGATATCAGGATTAAAGTCAACAGACTGAGTGTAACATTACTTGCACGATCA TGTGAATTTTGCACAATCCTATATTTTTCTTCAGAACTTGATATGAGTATGAAAATTTCTCTTTAGATGTTGACCTTGTGTTTAGCTATTTTTTGATGAG GGCTTCATGAATTTAAGTCAATTGAAAAATGATGAGAACTACAAAGGACCATGCTTCTATTAAAATTTTGACCATTGTTGTATTGTTATGTTGTGATTAT TTTTTTCTTTCATCAATATAGAAGACAGAGAATGGATCATATGGGGATGATTGAAGATATGTTGAAGGTGATTACTAATAAACCACCATGGGATGTGAGA AATCACAAAGTTTTGAATATATAAAATCTCACAACTAACTCTCTTAATTCCTCATTATGCAAATGATGGCGTCTGTGTAATGATATTTATTATTGAGCAC ACAGAACACCAACTTCTATAGAAGATTAAGGTTTTACTGAAAAAATAGAGTAAGCTCATTTCGTCTTAGGGAATAATATCTTTGTGGAATTTCTTTACTA GCTTTAACAATTTAGCAAAGCCCCCTTTTCAAGAGCTTTTGCTGCTGCAAAAACTTTATAGTGGAGATGGATTGTTATTCATGTCTTTATTCCATACCAT TGGAATGCTTGCAAAATAAATTGTTCCACTCAACATCAAAGAATAAATGAATCTAACCACGATTGGCACTCCATAGACAAACTCAACTAGTAATCAGTAG ATTATAATGTGGTTATTCAAGAACTCAATTGAAATATTGTAGTAAAATTCAAGAGAAGCAACCTTGCTATTTACCTAACATATTGAAGGACCATGCTTCA TATGCCTTCAACAACTACTTTCAGAAATTCAAGCAGAGTGGTGGTTCTTGCACCTTCAAAGGCGTTGCCATGACAACAGAAGTAGATTTTAGTAAGTGTC AGTGTTAAAGGTCCAAATTATTGTCTATGCAAAGATGGTATCGGTGATCAAGCACTTCAGAAAGCAATGAATTATGCTTGTGGTGTTGGAGCTGATTGTA CACCTATTATACAAAATGGACATTGTTTCCAACCAAACACTGTTAAAGATCGTTGCAATTATGCTGTTAATAACTATTTTCAAGAAAGGGTCAAGTTCAG GGAAGCTGTGATTTTAATGGAGCTACTACCCCTAGTGTAACTGCACGTCTGCACCACCTACTTCAGCATCTACATGTATTTTCCCTTCATGTCCTAGGTA TGATTCTTCTTGATTATGGGTCTAGTTTATTGTTGGGTGTTTCCACAATGTATTAAAGCTTTAGTTATATCTGTTCCCTAATCAATTAATCCTACACCCC TTTCAACTTTTAATTTGTAATTACATGTTATGGTAAAAGAAGAAGATGATATGGTTGATTCCTTTGATATATTTGCTTTGCCCATATTAGTGGAGTTAAC TCCTTCAAGCATAACTATTCAATCCAATCATGGATTTGACTCATATTAGTGGAACAAAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_165248;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_437284

FPKM

• PAB: 2.1
• PNAB: 2.3
• PS1: 2.3
• PS2: 2.3
• PS3: 2.5
• PW1: 2.7
• PW2: 3.4
• PW3: 2.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_437284

• Blastp: -
• Blastx: PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 3 from Arabidopsis with 56.9% of identity
• Eggnog: X8 domain containing protein, expressed(ENOG410YNCG)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G18650)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019428884.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;