| Id Trinity | TRINITY_DN48949_c0_g1_i26 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_436574 |
| Sequence | CAGCAAATACCTTAAACTCTCCGACTACAGAACACATCATCAAACATCACACATCACACATCATTACACATCACATATTAGACGTGTTAGTGTGGTAGGT CGCAAGTGAGTTCTAAATAGTAGATATACTAATTCTAGTAATTGTGTTTTCAGCACAACTTCGTAATTGACGGTGACATTGTTCAGTGTTCTAGTTTTTT CCGGTTCAGGAGAATCGTCACTCACTTTTCCTTTTCTCAAAAATTCGAAGAAAGGGGAAAGGAAAAAAAACAATTTTGTCACTCAAACAGAACAAAAAAA CCGAATACTATACATGGATTCATTGCTTCTTGGATCTTTTCCTAAACCATCTTCACTTACTATTGGTGGAAATTTCTGGAGGAGTAAAACTTGTGGCAAG AATTACTATGCAAGTATGTCTCTAACATACCCCTCTCCCTTTTGTCGGTATCGGGATCGATTCATGATATTGTTATGTGGCAATGGGCACCAAATTAGAT CCGATGAATTTAGACTTGCAAACTCTTGTGTCATAGCAAAGCAAAGAAAAAGGAACATCATGGAAAATACGGAGAGGAAAATCATGGGACAAACTAGGAA CAGTATTTCACTATATGCAGTATAATTATAATATATTTTCCACATTTTTTTCACACCAAGAGGTACAGATATAGTATTTATGAGAGAGCTCTTATTCAAA TACCAGAACTTCACATACATATATTTTGACACCCTACACTATTCAGTATTTACTCACTCTATTTTTCATCCACTTCGGAGGCTACATTTCCTCTCAAACA CAGAGTCATAGAGACTTATATTATGCTCTGCTTCAACTGAAGAATTCAGCTTTATAGTGCTCCAAAGCTGTGTGAATGCATGCAAAATTTCAGCCAATGA AAGTTTTGCAGCAATGCCTATGTCTTAGGAGTTAGAACTTTCCAATTTCCTTCCTGAAACCAAAGTTATTGTGTTGCATTAAATGTCTTGTACTCTTGTC TGATGGAATTTTTTTTGTCTTTTCTTTGACAATAAGTACATATGGCTGGACCCCACATATTTTACTTTATTGTTTTCTGCAACTACTTGAGCATCTCAAT CTTAGTATCTTACATTGTTTTCTGTCATATCATACTCACTTCATATTATGTTGCAGTCTAAGTAGTTGAAATTACTTTCTGTTAGTAACCTGTCTAATAT TGTTTGCTGTTAATTTGGAACTTGCCAATTCCCTTCCCTTTCATCATCCCATTTTCATGCCCAAGATTTGGTTACTATTGTTCTTGTTCTTCACACACCT TTGTTAACTCTTAATTCTTAAATTTTATACACCTTGACATTTTTTGTAAAAGAAATCACTTTTACCCTTTATGGGCAGCACAACATAAGCAACATAGTGT AGCTTAACTTCATAAGACCTTGGAGTTGATTCTGATATGTTATGGCAAGTGACACCCAGACTTTGAAATGTGATAAAATAAAGAAATCGTTTTTGCCTCA CAGTAGTACACTAACAGGAAATGTTGAAAAATTCTCGGTGGTGGTACAAGCATGGTTGCATTATAATTCTTCCCCTGTGATGAAAAAGGTTGTCGATGAT CCAAACTATTGCATTATCAATTGGTAACAAGCATGCTTTGTGGTGTTAATTGCGGCGGGGCTACATTTTTCGTCATTTGAGGAGTGAGCATTGATGATAA TGATCTCAATCAGTTGACTCTCCTATATCTATCTATATTTGAGCACAGTATATGTCTTGGTAGAGTAGCAACCTACACAATTTCCTGGAACTTGGATATT GATTATTAATTTTCCCTGTAAAATTTTCATTCTAAAGCAAGAAACAGTTTCTACTTTTTTGTTCTTCAAAGCACCACTTATAGTCGGCTACTAAATGCGT CATTTGGTACTTTAGGTTCTTATGCACCAACAGTTTCTTGGCACAAAAGGAAGATCCAAAAAGAGCATAACTTTTTGAGGTTTCAACAGCTAAGTTTGAA CAATCCATACAAAGGCATTAAGGGCGGGTCTACATGTCAAGGATGTAATAGAAAATATGTTGTGAAAGCGGCCTCTGAACAATCTTTTGAATCTGAATCT AGAGGTTTAGATCCAAAAAACATCTGGGACTCTGTCAAAAATTCCTTGGATGTTTTCTACAGGTTTTCCAGGCCACACACGGTTATCGGCACAGCATTAA GCATAATTTCTGTGTCTCTCTTAGCAGTGGAGAAAGCATCAGATTTATCTCCACTATTTTTTACTGGCGTTATGGAGGTAAGATCTCAAATACAATATTT CTCCTAAAATGGTTAAATGCTTTTCTTCCCCCACAACTTCATTAATACTATGAGTTTTTATGTTTCAGGCTGTTGTAGCTGCCCTGTTTATGAATATTTA TATTGTTGGTTTGAATCAGTTATATGATGTTGAAATAGACAAGGTAAGAAAGTCGGTAATAGAAATAAATGATCTGAATAGCTAATAAATTTGTTGGTCG TCTTTGAGCTTCTGGATTATTCGAGCAGAAAGAAAAGATGAAAGAGGCAGAATTGCTGTATGGATCAATGGAATTACTAAAATTGGCTATTCAGATACCT ATGCAGACTATGTTTTATACAAACATCTTTGTGCTCACATGGACAACCTATTGTAGCCTCTGATTTAGTAAAAAAAACAAGCAACACTGAGGAAATATCA TAGGGGTTGGCTTATTATTGACCTGTGCTACATGTTTTACTGCAGGTAAACAAGCCATATCTTCCATTGGCATCCGGGGAATATTCCTTTCATACTGGTG TCCTCATTGTTGCGTCTTTTTCGATTATGAGTTTTTGGCTTGGCTGGGTTGTAGGTTCGTGGCCATTGTTTTGGGCTCTCTTCATCAGTTTTGTGTTAGG GACTGCTTATTCAATTGATTTCTCAGGTGCCCTTATTGAGATGGAAAAGATTTGCGGTGCTTGCAGCAATGTGCATTCTGGCTATTCGAGCAGTAGTAGT TCAACTTGCATTTTTCCTTCACATGCAGACTTATGTATACAAGAGGCCAGCTGTTTTCTCAAGACCGCTCATTTTCGCAACTGCATTCATGAGCTTCTTT TCTGTAGTTATAGCATTGTTCAAGGACATACCTGACATTGAGGGAGATAAAATATTTGACATCCAATCATTTTCAGTACGTTTAGGTCAGAAGAAGGTAT TCTGGATTTGTGTATCACTTCTCGAAATGGCTTATGGAGTCGCCCTCCTGATGGGAGCAGCATCGCCTTGTCTATGGAGCAAAATTGTCACGGTAAGTTG CTTATTAAGTGTATAGTTGACTGTTGCAAGTGTGATGTATTCTCCTCCGGCTAAAAGCAGTTATTAGTTGTATACAGCAGTTCTTAGTTCTATAACTACC GGAAGGGGTGGGATTTTTGCTTTATAAAGCAACTCTTTCTTCTCATGCCGCCTTTTTACTTATATTGGTTAGTTAATATCAACATCTGACTATTGCCTTT CTGTATGCCTCCCGATGTACCGAACTAAGGTGCTCATACACCAATGCTAGTTTGGCTTTGAGTTTACTGGAATAAAGAAATATCTTCTAGTAAAGCTTTT TCTGTTGCATAGAACAGCCCAACTTTATATCTTCGTGATCTTGATATTTGGTGTCAGATTAAAATTGGTCTTTAAATGTGGCACTTCAGGAGAAAGCTTA GGTCAATAATACATATCGACATGATATGGAATTTAACTTGTTTGATTTTTACTCTCTGCAAATGTGTTAGTGTGTGGGACATGCAGTTCTGGCTTCGGTT CTATGGTATCGTGCAAAATCTGTAGATTTCAGCCGCAAAGCTTCCATAACAGAATTCTATATGTTTATCTGGAAGGTAATCACAAATCTTAGACACTGTT TATCGATAGCTTGAAAATTCATTTTAGCCAGAAGAAATAGCTATATAGTTTTCGCTTGTTCTGAGAAATAGCGATTTTGTAACTTCTAATAACCTCTAAA TTCCAATTGAAGTACAAAACTGTGGCTATGTGCATTAGTTACATTGAAATCCATTTTTGTACCTGTTGTTCACAGCATTTTGATCATTAAAGATAAAAAA GCATGTGAACTTAGTCATACATTGGTCTAATTTTACCTAGTGGAATAAATGCTCGGTTGTTGCTATTGTGATGAAAAATTCAATGCTACTCAATGAACAG AACATACATTGTAACATTGACATGAGTTAATGGAAGTTTATATGTATATTTATTTTCAAATT BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_165310; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_436574
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic from Arabidopsis with 74.19% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019454430.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |