Ll_transcript_436952

• Id Trinity: TRINITY_DN48983_c4_g1_i13
• Name Transcript: Ll_transcript_436952
• Sequence: TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGGCGCAAAAATCATGACCAGTTCCTCTGCTTCCTCTCGCAAGGTTTTCTCTAACACCATCCCTTTTTCTCTTCTCA TATTCTATATTCCTCTTTCCTTTTTTGTTTAATTTCTATAATCGTTGGGTTCAGAATCTGAGCAAGATTGCATGCAATAGGCTTCAGAAAGAGCTCGTTG AGTGGCAGGTTAATCCCCCAACTGGTTTCAACCACAAAGTCACCGATAATCTCCAGAGGTATCATCTCTTTCCCAATTTCATCACCCAAACCCTAATTTT TCATTCCCCTATTTGGGTTTATCCACTGGTTGCTTTTGGATGTGTTTTTCTGGTGTCTTGTTGTTCATGTTGATGCTTAAAGGCTCAAACTTGTTTCGTT TTCCTTTATTCATTCATGATTTGGTTTATTGTTCCTTTTTTTATGCATGCGCCTCGTTGTTCTGTTAATTTTTTGTGTTTATTTGTGGAAGGTGGGTTAT TGAAGTGACTGGTGCTCCTGGCACACTTTACACCAATGAGACCTACCAGCTTCAGGTTGATTTTCCTGAGAATTACCCAATGGAGGCTCCCCAGGTGATA TTTTTGAATCCGGCTCCCATGCATCCCCATATCTACAGCAACGGCCATATTTGCTTAGGTATGTACGGGGTTTCACGATGTTAATCTTCCATGTGTTCAT TTACTGTGTTTTATGGTCTGCTCCTGTAAATTAATGTTATGCCCCGTTTTTATGTTTGTTATTGCCCGACTTTTTATTGCATGGTTTTGGTATGTTTACA TGTATGTTTGTTACAATTACATTAACTTTTATGTTATCCATTCTAGTGATTTTAGTGATGAGCTCTTCATTTCCTCTAATTTGTGTTTGATTTTACTTTG AAGTCATGGGCTGATCGCATTCATAATTACAATTACTTGCTTATAATTCATGGGAAAGAGGATGGTTATGTGTTTGTCTACTTGTTTATGTGTCATTGGT GCCTGAGAAAATAAATTTACACCTTAAATTGGAAAGAAAAACTATATATCCTCCAAAAAAGTCATCCTAGTTATCAACTTAATTACTGAAAGAAAAATCA TTATATGCATTTAAGGAATTCTATCGTTCCCTGGTCAAAGATTTGGTTGGATGTGGGATCTACTCCATGAGGAGCGGTATGGGTATAGTTCTTATCATCA TGAGTGATGACCACTCTTTTTGTACAACTAGGGATGCTTAAAGCCACTTCGCTAACTGGCGTTCCCTGCACTTATGTGATCTTGAACGCCATTACATTTT AGTCCAGTTCTTATTCTATTAAGTAGATAGGACACAGTTGTTAAAAGTGCAATCCTGCCTATATAATAGTATGATTTTACAAGTTTGGAAGACTGGAGCA ACCCCAATCCAGAACAAGCTCATTTCTGCTTTAGTTGTGCTGGGTGGAATTGACCCAGAGTTTGTACTCCAAAATGGTTTAGGCTTTCTAAATATTTTAT ATGAATGTTTGACTTAGATATTTACATGGTTTGGTCAATCAAATGTTTTTTCCTTTTCCTCTGTAAATTTCTGTCTGGAATTTATTCTTCTTTTATGTTA TAATGATATGCATTTGAAGTAAGGTAACCATGGAGAGTGAGAATAGTGGTAGTTAGAGATGCATTGCTATTTCCTTCATTCATGCCCGTGTAGAAATAGA TGGTAATTTTCTCTCTATCACTCCCTTGGGGGGTTAAGGAATTAAGAATAATCAACTTTTGTTTACAAACTGCTTGATATTGTCAGTATGTGAAGTGTAT GAAAGTTTGATGTTTGAAGAGATTTACTTGACATGATAGATAAAATATTCTTATTCTCATCTGCACCCTTGATTTTAAAGTAGGAGCACCAGTTCTGAAG TCCAATCAGTTTTAGTGTATCGTACTTTATAGGTGGTCAATAATTTAAAAAGGAAAAAGAAAGTATGATTGACTTGGTGCTGGTTTTTGCTGGTGAACTG ACATTAATATGCTTTGGATGATGCAGACATATTGTATGATTCATGGTCCCCAGCCATGACTGTTAGTTCTATATGCATCAGTATCCTCTCAATGCTTTCA AGTTCAACTGTAAAGGTGCGAATTTAGTTACTGAAAATGTTTTAATTTCCTCATATTTTAAGGTCTCAAACATGCTTCTTATATTGGCCATATAAGTTTT CTGTTTAACCATGGTTTGAATATCTGATAAATGATGGAAGCCATCCATATTGATGATTATGTAAGATTCTATATGTGAACTTGTTATCACTTTGAATTAA CAACTTCTAACTTGATTTCTTTTGCAGCAACGCCCTGAGGATAATGATCGCTATGTGAGGAACTGCAGAAATGGCAGATCTCCGAAGGAGACAAGGTGGT GGTTCCATGACGATAAAGTATAACAACTACTTTCTCGAACAAGTGAACAAAATTAGAGTAGAGAATTATGTTTTTGAAAGAAAATGGAAGGAGACGTGGG GAAAAGCTTTTTCGGAAACCTGAATCCCTTTAAATTTATGCATAAAACTCTCCTGTAAATTGGCATTACCTGGTATTTGTAAAGGAAGACAAAACTGTGT CTAGAAGGATCTCAAAAGAGTAATCAAACTCAGAATACTGTGGTTATCTCAGGTATTTAGGTGTGGATATTATGGATACGTTTATCATCCCTCACATTTG ATACCACGGTTTGGTTAATGCTTTTCTTTCTTGAGAATTATGTTCTAAATATCCTCGAATTTGCAATATCAACTTATCGAGTCTCAAGATTTTAACTGTT TCTGCC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_165575;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_436952

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0.3
• PS1: 0
• PS2: 0.2
• PS3: 0
• PW1: 0
• PW2: 0.4
• PW3: 0.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_436952

• Blastp: -
• Blastx: Probable ubiquitin-conjugating enzyme E2 16 from Arabidopsis with 82.76% of identity
• Eggnog: ubiquitin-conjugating enzyme(COG5078)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G75440)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019422424.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;