Ll_transcript_435712

• Id Trinity: TRINITY_DN48986_c2_g1_i12
• Name Transcript: Ll_transcript_435712
• Sequence: TTCTAGAGTTAGAGGGAGGCTGAGAAAACTACATGAACATGATTTATAATAGAACATTATGATGTTGTCTGATCCATGTTGCTAAGACTTCGTTGTTGTT TTTGGCATGTGCCTTTGATTAAGCTAGTCATTAGAGCTAAATAGTGGAACTATATTGGTGGAGTCCTTTGGAGCAGCCCCCGATTGCTCCCGAACTCCTT AGCCTTTTGGGGCTTCTATAGCAGGTAAGTTGTGACAGCAATAGCAAGAAAGGCACTACTATTCTATGTTTGCACTTCTTTGTTCTGTAACATTTATTTT TTGACCAAATATTGGCATCCCATGCATAATTTCACTCAAGCTCACCCAATTTCCACCCAAGCCATGCATTTTCCTCCCAAGCTACCCACATTCCTACCAA AGCTCACCAGTCACCCTCTTCCAGCCAAGCCACCCCCTTTCTGTCAAAGCCAAGTAGCCAACACTTTGTAGCTTCCGCAGTTCTTTATGCAACTCTCTTT TTCGGTTACCTTTCTATTTTTTATGGCAATTGGCCTGTGTTGACTTTCTAAATCTCTTAATCTTTTGGTATTTTATAACTTCTTATTTCTTTATTGTCTG TCTTTTTAACTTCTACAAAAAGTCCCCAGACCTACATTGGAACTTGTATTCCGTCCAACCTTTTTTAGCTATTGTGTATATTTTTTAATCTATATCATGT AGAGATATTATAGATTAAAAAGATGGCGCTGCATTCTTTTCTTTTGGGAAATTGACATAATTGTCTCTTTACATCTCCACCCTCTTGTTTTGGCATCCAA AAAACAGAGGAGACCTGATGAGGCTTTTGTTAACTATTGTAATGTAATTGTGACCTATTCGAGACTTGTTTTTATAAAAATAGTATATAATTTATTTTGC ATAATAGAAGCTTTAACTTGTCTTTAGGCTATGATGACTGTGTCTCAACCACATGCTTTTAAGTATTAATTAATGTTTAAAGGTATAAGTTTTGTCTATT TTTTTAGTTTTTGGCATGTAATGTGTTTATTATATATTGTTTACACACACTGCATCTTACTAATCTTAACTATACTCTCGGCAGTATTCTATACCACTAT AGCATTCTTTGGCGTTGGTCACTCTTTGCCACTTTTGATAATTTTTCATAAATACTACACACCTTCAGTTTGTTTTTGCTCTATGGATTGTCTTTTTGCA GGTTAAAAGTTTGACAGACAACATTCAGGTGATACTGGATTCAATGAGAACTTCCACTGTTGTGGAAGTACAGGGTGACAAGTTAAGGAAGCATACTGAG TGGAAGAAATGGGTGCCCTCTGCCAAGCTTCAAGCTGAGTCTGGTTCAATATCTCCTGGTGGATCAAGAAGCAATAATCTAGCACTTGATCTTCAAACCA TGGCCCTGAATGAACCAACAACTAAGGAGGAAGGGCCAGCAGAGGCTTCAGATCAATCTTAATTCACAAATGGTGATGCTGCAAGGAACAGCAACTAAAA CCTCTGCTTACATAATCTATACCCCACCCTATGTTTCTGGGCCTTGTACACTGTGTCCAGTATTCAGCCATATGACCTAAGATTTTAATTTATTTTTTTG GTGGTGATGGAAATAGAGGCTGTGTGGAAGTTGATTATTTCTACAATTACAGCACGATTTTGATAGTAATTTTGAATCAAGTAGTGGAAATAAATAAGAA TTATTCAGTTTTTAAGGTCTAAAGATAAGGAGAGAAATTACTGAGACAGGGAGACGAAAAAAAAGCAGAAATTTGATTGACGTGGATTTAATGAAGTTAT GGATTTGTATATAAGTATGCTCTGGATTCTCATATGTTTGCTTGTGGGTAAATGTTTCGTATTCAGGTTGCTTTTTGTGTGTTTGGCACTCTTCTGGAAA TCTTGTGTAAAATATCTTTTACCATCATAAGTTATTACTCATGATTTGTAAGGGGCCGAATCCGAAGAAAAGAAAACAGATGAATGGGATACCGGTAGGG GTGGCAATATGGGTCAGCCCGTCCTGACCTGTCCTGTCTTTGGCCCGTCAAAATATGGGTTGGCCTAACTCTTATTACTAAAGGGCTCATAATGTAAGCT CATACCATATTTGGC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_165590;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_435712

FPKM

• PAB: 2.5
• PNAB: 1
• PS1: 1.3
• PS2: 0.8
• PS3: 1.2
• PW1: 0.8
• PW2: 0.9
• PW3: 1.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_435712

• Blastp: -
• Blastx: La-related protein 1B from Arabidopsis with 37.66% of identity
• Eggnog: La ribonucleoprotein domain family member(COG5193)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G66100)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019453261.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;