| Id Trinity | TRINITY_DN48986_c2_g1_i9 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_435704 |
| Sequence | AGTTAACCCTCCCCCGTCTAAGTTTTGTACTCCCAAACAAGGGAAAGGATAACCCTCCTTTCCCCTTCCCTTCATCCCCTTCCTAACCCTTTGATTCCTT TCCTTCCCTTCCCCTCACGACTCCCAAACAGACCCGTACTTTTCTCTGTTTGGTCTCTAAATATTTTTGCATTTGATAAGTAGCCTGACAATTAAGCTTA TTGCATTAGAAGCAGTGAGAGAAATTCAGTTAGTTTTACTTGATGCAACTGGAGAACCTAGTGTTCCTCTCATGTTACATGAACTTGCTTTTTTGCTGCA AACTTGTGGTAATTTTGGCATGTATGCCTTTATTCCCTTTTACTTTTATGCCTTGATAGCTACACTGACTCTATTTCACACATAAAGATGTATTTTATCC CCTTTAATTTTTTTCAATAAATATTTCATCATTGTTTAAGCAATGCTGCTACTAATTGTTGGCGGGAACGAGCATATATGTTGTACTTTATGACTGATTG TTGTGAATCCCTTGCAAGTTGCAACGTTTTTTTTCGTTGTTTGCAACTGTTTTGATTTGTAATTTGTAATACTTTTCAAATGTTACTTGTGTAAGATCTT TGGATTTGAGTTATTGTAATTAACCTTTGTCTTGGAATTTCCATAATATATTGAACATACACAATGGCATCAGTAAGAATGATGGGTTGAACCGCTCAGG AATGGCTGTGATCAATTAGCTTAGCCATAGTGGTTTTTCTTCTATATCCAAATCTTTTATGCCTCTCCTTCTCTGATTAGTTTATCTTATTAGATGTTCT CCTTTTGTAATTATCATTACATCTTGGAAGGAGCTGGTCAGAAACGGCTACGTGCTTGAGCTTTAGATTTCCTGTTCTGCACCTTAAACCTTGAGATCTT TACACTTCTCTTGCAGTTGAGCTGCATTGAATCTGTGATAGAGGGATTTGTGTTACTGAATGCTATTTTTAGATGTCAGCATTTTAAGCATGGTTAGTAT GATTAGTCCTAGTGTTGATGCCTACTGCAAGATAGCAAGTGCTGTTAGTATCTCTGTATGTTATATTTTCAAGAAAAATAAAGGAATTGTTTTGAGTGTG ATCAAATACAATTAGGAGACCAGTGAAAGAACTGCCATGTAGATAGCAAAGACCAAAAGTTTTCTTAATGATTATTAGTAGAGATCAGTGTGTGGAAGTT AGGTTTGATGTTGGTCTTACTTGGTCACTTCTTCCTTTGTATATCAATGATATGCAAGCGGCCTTGCAAATGGTCTTGGTTTGCACAGTTAATCAGGCGA TTGTTCGGGTCATTTTGGACCATTCAAAATCTGGTTCGAACGGGTTAACTAGGGATAACCCAAGTTAGTGAACCATACAGTTTCTTTAAAATAAAAAAAA ACATTTGCTAGAACGAGAAGAACATAATTTTCAACCAAGGCCCGTGATATGGAAGAGTGGAAGGGAACAATGTGAGAGAGTGAAGATATGTGCACTGTGG TGGAAGAAGTGGAGGCACATGGTGGTAGTCGGCGAGATGGGTTGTGTAGGGATCCGGGTTTGCACGAATGGAAGAATGAAGGATTTGGTACCTAGTGAGT ATGGAAGAAGAAGGCGTGTTTTATAATTGAAGAAGTACTGCGTTACTAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCAATGCTGCTACTTTTAGGTTT AGTTTTTTCAATTAACTATAATGTGTAGTTGGACAGGATCATTGGGCTTCTGTTTTTTATGGATGTGTTTTTATTATATAATTATATTATTATTTTATAT ATATGATGTGGTATGGTCCGATCAGACGATTTAACAGGCCAGACCTTATACGGGACCGCTTTCACTTTGACACCCAGCTCGAGTTTCATAACATTGTAGT ATATTATTCACCAAAATAAGTGGTCAAGGATTTTGGCTTATTAAATTGTGGAGACAATATATTAACAAATGGAAAAATCAATTAGATTTCCAGGTATTGA AGTGTCTATGATTCTTTAACTCAAGCATATGGTTTAACTACTTCCCGATGAACTATTTTAAATTTAGGACAAGTTGATCGGTTATATGGTGTGCCTTCAA AGGCTGGGGAGACATGAAATTGGATTTATTGAGAAATCACTTGTCTATCACTCCATTGTTGTGTTTCACTTTCGACTTTGCAACTTTTCTAAATAAATAA ATTTTTGATTACTTATCTCCATTTAATGTTCATTTTTTTTTCACGAACCTGTTTGTATATGTGCATTCAATATCTTTTGTAAAAGACATGTAAAAGAGAA AAGACTGTATACATTAACCCTCCTCATACCCTACTAGGTACATGCCTCGTGCATTGTGCCTCTCCTTCATAGAAATGAATTGTATAATGGCCAAGCTCAC CCCATTTTTCGCTCAAGCTCACCCCATTTTTTGCTCAAGCTCACCCCATTTCCTGCCAAGCTACCCGTTTTCCAGCCAAGTCACTGCCTTTTTGGCAGCT AACTTTTCTTTTTTGGTTGTCTTTTTTATGCCAACACGAGTGTGTTACCTTTCTAATTCTTTCACTCTTGTGTAATTCTATATTCTCATTTCTTGTTTTT TTAACTTGTAAAGAAAGTCCCCACAAAGACCAAAACTTGCAGTTCTATTTTTTTCAATCTAAATCATGTAGGGATGTTATAAATTAATGGTCGGCACTGC ATTCTTTTCTTTTGGGCAATTGATATGATTGTGTCTTTATATTTCCAGCCTCTTTGTTAACTACTACAATGTAACTGACCTAGTGGAGATATCAGATATG TTTTATAAAAATATTTGTTGTCAAACTTGTAATAATAGAGGCTTGACGTGTCTTCATGCTATGATGAGTGTGTCCTAGCCATATGCCTTTTAAGTATTAA TGTTTAAATGATTAAATGTATTAAGTTTTTGTCTATTTTTAGTTTTTAACATGTGGTGTGTTTACTAGAAACTATTTGCACTGTATCTTACCAATCTTCA GTATAGCAGCAGCTCCACAATATGCTACTATCCCACTAATATATCATTCTTCGGGGCTGGTCACTCTGCACTGTCCAGGATTGACTACTATGCTTTTGAT ATGACTTAAATCTTCATAAATATTACACACCTTGAGTTTTTTTGCTTTATGGATTATCTTTTTGCAGGTTAGAAGTTTGACGAACAACATTCAGGTGATA CTGGACTCAATGAGAGCTTCCACTGTTGTGGAAGTACAAGGTGACAAGTTAAGGAGACATAATGAGTGGGAGAAATGGGTGCCCTCTTCCAAGCTTCAGG CTGATTCTGGTTCAATATCTCCTGGTGGATCAAGACACGATAACCTAGCCGCTGATTTTCAAACTATAGCCCTGGAAAACGCAACTATCGAGGAAGGTCC AGCAGAGTCTTCCAATCAGTCTCAACTCCCAAATGGTGATGCTGCAAGAAACAGCAATTGAAACTATACTTACATAATCTACCCCACCCGAAATTTCTGG GCCTTGTCTTCTGTCCAGTATTCAGCCGGTCCCTGGATTCTAATTTTGTGTGTGTGCGGAAGGTGATGGAAATAGAGGCGGTGTGGGAAGTTGATTATTT CTACAGTCATAGCTCGATTTTGATAGTAATTTTGAGTAAGTAGTAGAAACAAATAAGAATTTTGAGGCTGTGTGGCTTATAATGCTTTAAATGTTTCTGC CGTGATTCCTCCAAATGTTATTCTTTTTCATCACACTTGGGAATGGAAGGGGCCACAAAGGATCAAGATTTTCACGTCAAAACTTTCATCTGGTTGTTGG TGTGGTTGCAATCATGATTTTCATGACTCCCTAAACATTGATGTTACGAACTATTGAAGGGGCCACAAGGGTTGTGGTTTCCATAACTCTCAACTTTTAC ATTTTGGTGTTTGTAGCTATGGTTTTTCTATTTACATTACATTTTGGTGTTTGTGGGTTCGATAACTCTTAAAACTTTTACATTTTGGTGTTTGTAGCGA TCGTAGGTTGGAATGAAAACCGTAATCCTCTCTAAAAAAA BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_165590; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_435704
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | La-related protein 1B from Arabidopsis with 51.22% of identity |
| Eggnog | La ribonucleoprotein domain family member(COG5193) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT5G66100) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019449481.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |