Id Trinity | TRINITY_DN48987_c2_g1_i1 |
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Name Transcript | Ll_transcript_437061 |
Sequence | CTTTTTTTTAACTTGTTGGTGTTATTCTTGTCGTGTTTTGTACTTGGATTTCGCTTTGGTGCATTTTATTTAATTTTTGGTTTTTTTTTTAAATATTGGT TGAAATAAGGATGCTTCTGTGATTGAGATATTATTTTAAATAAATAAATAATTGGATTTTGTGTACTACTTTGATGTTTTTGGCATAATGTGACCACTGC AAATATTGGATTAGTTTCTGTTCCTTTAATTGTATTATTTCATTGTGCAGGTCGAATATATTAAATGTTAATTATGAGATGCAAAACAGTGGAATGCATC ATGAGGAATTGTAGAATATGTTGAAAGTTTCATTGTTTTGATGTGTGATAAAGAATAGGTTCGATTGGAAGTGTTCGGAGTTGGGTTTATTGTGATATTC TAAAAAAATAACGAAAACGGGGGCGCTTTGTTGTGTGGCTGCAAGGCCACATGGATCAAATGCAGGCAGTGCAGACTGGTCCGTGGGTCCAAATGAGCCC TACTGGCGAACTAACACGAGTTTTTCGCCACCACCATCAAGATGGGATTTCAGATTCCAGTCTGAAGGGCTTCCATATAGTTTGAATGATGGTGCTCAGC TCTATGTGTCTTCGACGTCTTCAAATGGTAAAGACAGTGGGCGTTGGGTTAGAGGCAACCACCTATACGACCTTCACTATTCTGCTTCAGAGCATACTGA GCATGTCAGAAGTCCATCTGATCTTTCTCGGGGTCCTCAGTGGACTCCTCCTGCAATACAAGAAATAAGTGTTGCTGATTATGAAAGTAGGACTGGTCGA GGTAAACTCTCACATCTAAACTTTCAAATATGACTTTATAGACCAGTTTTCGGTTTTTATGCCCAAGATATGACTTTATATATTCTTTGAAAGATGTATA GTGAACTTGTTCTGTTTTGTTATATTCTTCAAACTTTTTTTGCATGTGTTCTTGCTTATTCTTTTACACAGAAAAACCGGACTCTCAGATAAAGGGAAGG CAGTAATGTGACCGTTTCTGCTTATGAATACCCTTCCGCCAATAGTGTTTGTGTTATAAGATTGTTTTTACATCATTTGAAGGGTAAACAATGTAAAGCC ACCTTTTCAACAATGATGCATGAAAGCAGCATAAATTAAAAATATAGTTTAAGAAAAAAGGAAAAAGGAGCACTAGACTATGCAGATTATGTACTGATGA TACAGAGTTTAGGTCATGATTTTGGATAATGATGCATGAGGCAGCAGAAATTCGACCGCTTTTAAATGCTAATGCATTGTAACTGGGGTTTGATTGCTTC CACTTAAAAATAAAAGGAGACTTCAGAAACTAACTACTAACTTCTGGTTAGGTAAAAGATGATTGCATATAAGGTATTGAAGCCTTTATAACATTCAACC TTAGTAGAAATGTTAAAAGCAAACTAAGGCTTTTTAACACTATAAGGAAAGCCCTGATAAAATAATATAACCCAAAATAAGACAAGATGTTTCTGGTTGA GTGCTCAATTATGTGTGACCTTATTCTGCCTACAGTATCCTCAAAGGAAGTATATTTGTATTTGATTTTATCTATGAGCTGTAGCTAGTTAATAGTATTG GGTAGATAATTGCTTACCATTATATTCTCATGTATCAATATCTTTGCTATACGTAAGTTACTTGACTTGCTTCTAAGTTCTAACATATTGGACTAGGTAG TCAATTGTGGATAGTGGAGAGTATAGAATTATAGCGCGATAGCAGGACAATCGCTACACCTGATAAAAATATATGTAATTTATAGCCTACACAAATACTA AAATAGATCATATAAATACACATTCCAAATTAATAATTAAGTTAAGAGTATTGCAGATTCTAGAGGTGATCGAAGTCGGAGTCCATAACAGAGTTATATC TCACAAAATTGAACCATGTGAATATGATCAAAATTGGGTTTAGTCAGTTTGATAAGAGAATCAATAAAGAGACGACAGGGCAACCAATTAGAGGCCAAGG AAAAAATCATGTTGAGAAAGGAATCAAAGGATGGGGTATGTTTGTGAATTAGGAAACCTTGCGATTTTGTTCTATGCTGATGAAGAACGTGTAAGCAACA GAACATGTATACTGGAATTAGGAAGAAGAAAGAAGAAAGGTAGAGCCTAGCAAAAATCGCATAGTATGTGTTAAGTAGGAGAAGTTTAAATTACCTAAAA CCCTGGGGGGGGGGACCTGCCGCCTATTAAAAAATGGGGCAAAAAACACTTTTCCCCTCTAGAATTCGGGTTCCACTCGCAACAAAACATGTAGCGGGTC ATGACCCGCGATTTGACCTGTGATTGTGCCACTATTTGACCTGCTATGGGTGCTACGGCCATCTGCACAATTGTCCACTGTGGTGTCAGCGGAAACCTCT TAAAACCTGCTACACTCCACTATTGCACGCTATGGACTACCTGGGTATGGGAAGTGTTGCTCAGAAAAGAAATGCATACTCAACCCTCTTCGTGTGTTCT GGATTAGCTTAGCATATTTTATATTCAAAACAATTATATTCAAAACTCTTCGAGAGGACTTTCTAAAATATGTGTTTATTTCTCTAAAACTAAGTGTTGT CAGACATGCTTTTATTGCTTTTGATTAAAAAATATTCTTGTTCAGTTCCTTTGTCCTCCATTGCTCAACCATTTGTTGAACATTGAATTTGCCCGATATA AGATTAGCACCAAGTGGGATCATAAAGCGGATTGGGCTAACAGAAAGGGAGGAGTCAGCCGTTCTGCCATTGATTACAGGAAAACTTTTCCAAAGCTACA GCCCTCACTGTGGATTCAAGACACAACTATGTATTTGTTCAACTATTGATCACACACTTTTATTGCTTTTGATCAGAAAATTTGTGCTCATTTAGTTGGT GGTACAAGCCTATAATTATGCTTATAACATCTAGGTTAAAAAATGGCAATAACATACTTTTGGCCATTTTGTTTATAGAGCTACGGCCTCCTTCAAAGTG GTAGAGAGCTAAATTAGTATCTCAGTGAACCTACAGGTTTTCTGTAGGAAGCCAACAAAAGGGAGCCCATACATTAATAAATCTGACATCACAGTACAGA ATTGAGTCATATTACTTCCAATTCTGCCTCCAAACATCAGAATATTATCATTTTCTTTTAATTTGTGAGATTTGTTTCAAAATTCAGACTTTCCTTTCCC CTAATATAATTCAATTCCTTGATTATTGATCTTAGTTTGCCTGTTAATTGTGTCTGTGTATATGTTGGGTGATGGCTACAGTTAAATCGCTGCAATATTA CTAACAGTAGAGCTGTTGACTTGGTGGTTTATTCTTTTATTATAAGCTTGTTAATTCTTACTGTTACTTCCTAAATTTCTTCCTTGACAATTGTGCCTGA TAGATCCTCATCCTTCTCTGGGCCTGGCATCTTCTAAATCTAACAAAGAGGGAACTTCCGAAAATCCAGATAGTGAGGGTTCAACTTCATTCCGGTCTGA GAGTAGTGAATCCGAGTCTGCTACAAAATCGCGCTTATCCTCACAGAGGAATTTCTCTAAACACGGTTCATTCATCTCCAAACCCATTCATCCTTTGTTC TTTCCTGACCTTACTCCATCTAAGGAAGCCTTTGACCTTGCAGTTACACCTTTTTCAGAGTTTGGTGCTTCCACTCCGCTCAGAGATGCCCAATGCTGGA GTACTGCCAGCAGTAGTCTGGATTTTGCTGATGTTACTGAGTCATTTGAATCAGAAACACCTGATCGCCCACATATTACCTCAGGTGGATTTCGATGCAG CTTGTGTGAAAGATTTCTGTCACAGAGATCACCTTGGAGTCCCCGTCGCATTATGAGAAGTGGAGTCATGCCTACAACTGGGGTTCTTGCTTGTTGTCAT GTTTTTCATGCTGAATGTTTGGAGCAGATGACACCGAAGACATGGAAAAATGATCCTCCTTGTCCCGTGTGTGTCAGACGGGAGGAGGAAAATTCACCTG ATCAACGAGGTCTTTTGCGACCGGGGAACAGTTTTCCTAGGCTCAAATCATTTACTGAGGATGGACCTTCAAGACCTTGGGGCTGTACACGGGCAAGTGA TTGTGCTGTAGGGGATCTGCATGCACCGACATACAATGCAACATTCCTACTTAATCGAAGTCGCATTAAAAAGAACATTCGTTTGAAGGGTAATGAGGAT TTTCCAGGTAAGGTGAGGAAAAGTGGGCCATTTCCATATTCTTCACAGTTGTTTAGAAGCTCAGCTGACCCAGAAGCAGTTGCAGGCCCAAGCATGAAGA GGTAATGTGAAATGTCTGCATATAGAAGCATAAAGTTGTAATTTACCTGAACATTCTTTCCTTAACTGACCCACTTTAGTCAATTGATAGTTATAACATG GATTGTAAACCTACCATCGTTTTGTATAGATTGATTTGTTGTATGTGTATTGAAAAGTCTCTATTGTATGTGTATCAAAAGATTACTGCAACTGCATGTC TTGATTTTGGATCATTTTGCATATTGTCCAAAGTTATGGACCTTGTTAAATAATTTTTTTGCAAGGTCCTTAAACTTCTGCAACCGTTTAAGGTGCTGCC ATTTTATCACTACAACTTTTCAGâBLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_165602; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_437061
Blastp | - |
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Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019455156.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |