| Id Trinity | TRINITY_DN48987_c2_g1_i13 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_437075 |
| Sequence | ATTGATAAATATGAAAAAGTGGAAGAGGAATTGTGCAACACAACAACTCTTTTTTCTTGTTAGTGCGTTTTAGGGTTTTCTTTCACTGTTCCACTCTACT TCTTCACACACCATTCTTCTAAATTAATTCGCCTTTTTTAGAAACATACTTTAACGGACCCAACATCACAATTTCTCATCAAAAAAACGCTTCGTTTCAT GTCGAATATATTAAATGTTAATTATGAGATGCAAAACAGTGGAATGCATCATGAGGAATTGTAGAATATGTTGAAAGTTTCATTGTTTTGATGTGTGATA AAGAATAGGTTCGATTGGAAGTGTTCGGAGTTGGGTTTATTGTGATATTCTAAAAAAATAACGAAAACGGGGGCGCTTTGTTGTGTGGCTGCAAGGCCAC ATGGATCAAATGCAGGCAGTGCAGACTGGTCCGTGGGTCCAAATGAGCCCTACTGGCGAACTAACACGAGTTTTTCGCCACCACCATCAAGATGGGATTT CAGATTCCAGTCTGAAGGGCTTCCATATAGTTTGAATGATGGTGCTCAGCTCTATGTGTCTTCGACGTCTTCAAATGGTAAAGACAGTGGGCGTTGGGTT AGAGGCAACCACCTATACGACCTTCACTATTCTGCTTCAGAGCATACTGAGCATGTCAGAAGTCCATCTGATCTTTCTCGGGGTCCTCAGTGGACTCCTC CTGCAATACAAGAAATAAGTGTTGCTGATTATGAAAGTAGGACTGGTCGAGGTAAACTCTCACATCTAAACTTTCAAATATGACTTTATAGACCAGTTTT CGGTTTTTATGCCCAAGATATGACTTTATATATTCTTTGAAAGATGTATAGTGAACTTGTTCTGTTTTGTTATATTCTTCAAACTTTTTTTTGCATTTGT TCTTGCTTATTCTTTTACACAGAAAAACCGGACTCTCAGATAAAGGGAAGGCAGTAATGTGACCGTTTCTGCTTATGAATACCCTTCCGCCAATAGTGTT TGTGTTATAAGATTGTTTTTACATCATTTGAAGGGTAAACAATGTAAAGCCACCTTTTCAACAATGATGCATGAAAGCAGCATAAATTAAAAATATAGTT TAAGAAAAAAGGAAAAAGGAGCACTAGACTATGCAGATTATGTACTGATGATACAGAGTTTAGGTCATGATTTTGGATAATGATGCATGAGGCAGCAGAA ATTCGACCGCTTTTAAATGCTAATGCATTGTAACTGGGGTTTGATTGCTTCCACTTAAAAATAAAAGGAGACTTCAGAAACTAACTACTAACTTCTGGTT AGGTAAAAGATGATTGCATATAAGGTATTGAAGCCTTTATAACATTCAACCTTAGTAGAAATGTTAAAAGCAAACTAAGGCTTTTTAACACTATAAGGAA AGCCCTGATAAAATAATATAACCCAAAATAAGACAAGATGTTTCTGGTTGAGTGCTCAATTATGTGTGACCTTATTCTGCCTACAGTATCCTCAAAGGAA GTATATTTGTATTTGATTTTATCTATGAGCTGTAGCTAGTTAATAGTATTGGGTAGATAATTGCTTACCATTATATTCTCATGTATCAATATCTTTGCTA TACGTAAGTTACTTGACTTGCTTCTAAGTTCTAACATATTGGACTAGGTAGTCAATTGTGGATAGTGGAGAGTATAGAATTATAGCGCGATAGCAGGACA ATCGCTACACCTGATAAAAATATATGTAATTTATAGCCTACACAAATACTAAAATAGATCATATAAATACACATTCCAAATTAATAATTAAGTTAAGAGT ATTGCAGATTCTAGAGGTGATCGAAGTCGGAGTCCATAACAGAGTTATATCTCACAAAATTGAACCATGTGAATATGATCAAAATTGGGTTTAGTCAGTT TGATAAGAGAATCAATAAAGAGACGACAGGGCAACCAATTAGAGGCCAAGGAAAAAATCATGTTGAGAAAGGAATCAAAGGATGGGGTATGTTTGTGAAT TAGGAAACCTTGCGATTTTGTTCTATGCTGATGAAGAACGTGTAAGCAACAGAACATGTATACTGGAATTAGGAAGAAGAAAGAAGAAAGGTAGAGCCTA GCAAAAATCGCATAGTATGTGTTAAGTAGGAGAAGTTTAAATTACCTAAAACCCTGGGGGGGGGGACCTGCCGCCTATTAAAAAATGGGGCAAAAAACAC TTTTCCCCTCTAGAATTCGGGTTCCACTCGCAACAAAACATGTAGCGGGTCATGACCCGCGATTTGACCTGTGATTGTGCCACTATTTGACCTGCTATGG GTGCTACGGCCATCTGCACAATTGTCCACTGTGGTGTCAGCGGAAACCTCTTAAAACCTGCTACACTCCACTATTGCACGCTATGGACTACCTGGGTATG GGAAGTGTTGCTCAGAAAAGAAATGCATACTCAACCCTCTTCGTGTGTTCTGGATTAGCTTAGCATATTTTATATTCAAAACAATTATATTCAAAACTCT TCGAGAGGACTTTCTAAAATATGTGTTTATTTCTCTAAAACTAAGTGTTGTCAGACATGCTTTTATTGCTTTTGATTAAAAAATATTCTTGTTCAGTTCC TTTGTCCTCCATTGCTCAACCATTTGTTGAACATTGAATTTGCCCGATATAAGATTAGCACCAAGTGGGATCATAAAGCGGATTGGGCTAACAGAAAGGG AGGAGTCAGCCGTTCTGCCATTGATTACAGGAAAACTTTTCCAAAGCTACAGCCCTCACTGTGGATTCAAGACACAACTATGTATTTGTTCAACTATTGA TCACACACTTTTATTGCTTTTGATCAGAAAATTTGTGCTCATTTAGTTGGTGGTACAAGCCTATAATTATGCTTATAACATCTAGGTTAAAAAATGGCAA TAACATACTTTTGGCCATTTTGTTTATAGAGCTACGGCCTCCTTCAAAGTGGTAGAGAGCTAAATTAGTATCTCAGTGAACCTACAGGTTTTCTGTAGGA AGCCAACAAAAGGGAGCCCATACATTAATAAATCTGACATCACAGTACAGAATTGAGTCATATTACTTCCAATTCTGCCTCCAAACATCAGAATATTATC ATTTTCTTTTAATTTGTGAGATTTGTTTCAAAATTCAGACTTTCCTTTCCCCTAATATAATTCAATTCCTTGATTATTGATGTTAGTTTGCCTGTTAATT GTGTCTGTGTATATGTTGGGTGATGGCTACAGTTAAATCGCTGCAATATTACTAACAGTAGAGCTGTTGACTTGGTGGTTTATTCTTTTATTATAAGCTT GTTAATTCTTACTGTTACTTCCTAAATTTCTTCCTTGACAATTGTGCCTGATAGATCCTCATCCTTCTCTGGGCCTGGCATCTTCTAAATCTAACAAAGA GGGAACTTCCGAAAATCCAGATAGTGAGGGTTCAACTTCATTCCGGTCTGAGAGTAGTGAATCCGAGTCTGCTACAAAATCGCGCTTATCCTCACAGAGG AATTTCTCTAAACACGGTTCATTCATCTCCAAACCCATTCATCCTTTGTTCTTTCCTGACCTTACTCCATCTAAGGAAGCCTTTGATCCTGCACTTTCGG CTTTTTCAGAGTCTGGTGCTTTGACTCCGCTCAGAGATGCCCAACGCTGGAGTAGTGCCAGCAGTAGTCAGGATTTTGCTGATGTTACCGAGTCATTCAA ATCAGAAACACCTGGTCGCCCACATGTTCCTTTGGGTGGATTTAGATGCAGCTTGTGTGAAAGATTTCTATCACAAAGATCACCTTGGAGTTCTCGCCGT ATTGTGAGAAGTGGAGACATGCCTACAACTGGAGTTCTTCCTTGTTGTCATGTTTTTCATGCTGAATGTTTAGAGCAGATAACATCAAAGACACGGAAAA ATGATCCTCCTTGCCCTGTGTGTGTCAAACCGGAGGATGTAAATTCCCCCGATCAACAGGGTCCTATGCGATTGAGGAATAGTTTTCCTAGATTCAAATC ATTTACTGAGGATGGACCTTCAAGACCTTGGGGCTGTACCCAGGTGGGTGATTGTGTTGAAGGGGCTCTGCATGCACCGCCATGCAATGCAATGTACATA CTGAATCGAAATCGCATTAAAAAGAACCTTTCTTTGAAGGGTAATTTTAGCAATGAATTCCCAGGTAAGGTGAGTAAAACTGGACCATTTCCATATTCTT CACAGTTTAGAAGCTTGGCCGATCAAGAATCAGTTGCAGGCCCAAGTATGAAGAGGTAAATGGCAAATGTGGAAATTTGTAAGTTACCTATTATTTTCTT AGCAGTCTAGTCAACCGATATTTATGACATGTGTTAGTAATATGGTTCAGCATTTTGTATAGATTGATTTGTTGCATGTGTATTGAAAGTCTCTATTGGA ACTTGATGGTGTTTCTTTGTTTATGCATTTTGATTTTGATTTCTGGTCTTTAGTTTGGATCTTGAGCATTTCTACTTTTGTTAATTTAAGTCAGATTGAA CAAATATTCATCTAGGGAAGAGTTGAATTATTGAATTATTAAAAGTATGTACTTACTACATTGCTTGTAACTTAGCCGTCACTTATATGGGTGAATAAAC CATTATGAACTTTTTTCTAGGCACGGTTCTACTATGCTATGCC BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_165602; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_437075
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | - |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019455156.1) |
| Pfam | Ring finger domain (PF13639.5) |
| Rfam | - |
| GO | - |