| Id Trinity | TRINITY_DN49011_c0_g1_i17 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_330211 |
| Sequence | TCATTCAGAATTTGATGGAAACAGCGTAGCGCGAAATTCTGAATAGCGGTTTCTTTTCTTAGCTCCTATTTTGGTTATTGTTGATTCTGATAATTCCGAT GATTCCGATGATTCCGATTCCGATTCGATTTCATTATCTTAAAGTTTGAAATGATTGTATAGGTTGTATTTCTTTGCTGGTTAATTTTGCTGAATTGAAG ATCGAAAGAAATTGATAGTTTTCGTGAATATCCTATCTGTGTTAGGGAAATAGTATTCTTCTTCATTTCATGATTGAAGATTTAGACGTTGAACTGTTTG TGTTTCTTCGTTAACAGAATTCTGGAGTTCGGACGTCAAAGATCGATGACGTGCAATCTTGATCGAAGGGTTCAGGATATTATTAATAATTTATCTTCAA TTTCTGGTTGATTTTGCTGATCGATGTGATCATGTGATTTTTCTGAATTTAAGATTGCTAGAGATTGATAGTTTTCACTCTGGTGTATAGAAGATTGGTG ATGTGCAATTCAGGGGTTCGGGATAATTAATTTGATTTCTTCGATCACTTTTTCCTCTTTTAATTCGTCATGAATGTGTTACAAATTGAATCGTGAAGCT GTTCGTTTTGCAGTTAGCGTCTCCTGACTATAAACTATTCAACTGCATAAGCTGGTGAACTTTACCATGGGCTCTGAATTCTTCAATAACTTTTGTTGTT GTCTTCCGTTTATAAGTATATTAGGATTTGCGAAGTTTTCCATGAATTATTCCCCTTTGGTTTTACAGGGAAGATTATCAATGAGTGCGAGCGAGGTTAT GAAAGCAATGGTTGGGACATTGATCGAGATTTTGTTTGTCTTGCAATATGGATATTCTTCCCGTTTTGTGTTTGGATATGATTATGGACAGCTACAAATA TGTTAGAGTCATCAAATTGTGGTCTAATAGGCCTCATATGCTGGAAGTATCTGCAAACACGACTATGCTTGTTCTGCTGTGTTTGTGCATCTCAAGCGTT TGAGTTTTAAGATGCTGGAGTTTCTACCTCTTGTGGATAGGCTTTTGTTGTGATGATCCACTTCTTTGGTTTGGAGAATTCTGCTATTTTTCTCTCCAAC TTTTATTATGATGAATTCTTGTTTCTCTACTTAATGGATTCTCCTACCTAACCTGCATGCTGATTGAACCAAAGCAACGGGTTTTGTGGAATATAATCAT GTTTAAAGAATAATTCCTATTCTGGAAAAATTTAACACGATCCTCTAAAAAATAGTTGTAAGTGAATTTGCAGTTGAGTTGATTTTGCTGGAAGAAATTA ACAAAATTTGATTGCTTTAGGTGGCCCTTCTTTTTCGTCATTTTTTAATGTTGTTTTCCCCATCATGATGATTAATTAGTAGTTGGACTTAATATTTTTA TCCCTTTGCAGAATTGCAACATTTTGGGCCCAGAGATTTTTGAACTAGGCCTAACCAGTAATTGCAAATGCTTAACCCGACTAGACCGGTGAAGGGAACC AAATTGTTCATTTTATTTTTTATTTTGTTACATGTGTTGTTCTTTCCTGTGTAACATCTTATGTCCAATTTTTTAATATCGTTCACCATTGATTCTGGAG ATCTAGGTGGTGAGACATTAAGATTTATGCACTGGAGTTGTCTATTTGGGCAGATTATACAGTATAGCAGTGCTGGTGTTTTTCTGTTGTTGCATGAATG AGTCTTATGGCGCTTTGATCAGACTTGGTTGGGGTTTTTGATTTACTTTTTGCTATATCAAGGGAGGAATAAGAGCTTGCTTGGGCTTTTGGTTCTTTTT TTGGATTATCTGTCTGGTTTTGTGGAGTTCTAATGTTTTTTGCTAAAACTTTGACATGGTGTTCACAGTTTGTCGGAAGTTGGGGCCTCATCCTGCTTCA AGTGACTACCTGCCTTCTATTTAGCAGGAAGTTGAGTCTCTTTAGTTTGTGGAGGTTGAAGTTGGATCTTTAGCAATTTTTTTGGTGATCAGGATGCGCT AAGGGGTTCAGCTCGTTATTGATGACTTAATTTCTTCAATTCTGTTTCTCTTTTTTATGGCTGAGTTGAACTGTGAAGGTTGTTTTATATTTAGTGTGTC CTAATTATCTAGCCATAACTTCGTGGCCTGTATCTGGATTCTGAACTCTTGGATTTGTCTTTTTGTCCATAAATTCATTCAGATTCTGTGCGTTTTCCAT GCATTTGGCTTGTCTCTGCAGGGAAAATGATTTTGTTCTGGGCTGTGGAAAAAAGCAGCAACCGGGGGTATTGATGGACATTTTCTTGCAATTTAGGTTT TGTTACCATTATAAAACTTTCTTCTCATTTGGTCCCCTCATATATGCTTGTTCTGGATTTGGACTCTGTGGCTATGCTTGTTACTGTGTTTGTATATCAG GAAGCATGTGGGTTTTGGGATGCAGGAATTTCTCTCCTTCGAGGAGTCTGTGTACCTTTGATGCTTTGGGCCTGTGTGACAGTTGTGATGATATGAGTCT TTGGTTTCGAGAATCTTCTGTGCATTATAATCTTCTTTGTCACAGGCTTATAGTGACACCCCTTCGTGTATTGAGCACCTATAAACCTTTAGGCAGGTTG AAATTTTAATTGAACCATATGTGAACCAACACTTAATGCATGATTTGTCATATAGTACTTCTAAGGGGGTATTACATTGGTATTTTTTTAGGAGTTTGCA GTCAATTATTTACATGTACACTTTATGAAGATATCGTTCCTTTAAGACCAGGTCTGATTTTTCGAATAGTTATGCACTTGGAAAATATTTTTGTACTATC CTGTGAATATGTTTTTTAATATAAAAAATTTAGTTTTTGTGAATTTTGTTTCTATAGCGGCAATAGAGTTGATATGCATGTTGCCTTGTGGCTGGACATC CGCATTATTAATCAATAAGTTGATAAAACTTTGTCAATCTTTGTTCAATTCTTTGAATATTGTTCAATTCTTCAATATTGTTCTGCTGATAATGACAATC TAGGTGTTGAATTTATTGCTTTATTCATATGCAGCATTTTTTGGGCCTGGAAATTCTACATTTATGGTGTGACCCCTCAAGGAGCGAATCTGAATGAATC TTCTAGAATTTATAGCTGGTGATAGGTTCAGGATTATTTTATTTTTGTAACATGAGTTATTGTTTTTGTTTTCAGTAATTGTGTAACTATATCCTAATGA TGTTCACTTTCTCATGCATATATCTAGGTGTTTAAACTGCTCGAATTTATGTGATCGAAGAAATCTAGAGCCTGGAATGAATTTCCTGTGTTAGCTGTTT CCAATCGAAGATCTAATCTTTAAGATGCTCTCTGAATAGCTCATTGATAAGTTGTTTGTTCTTTTTTAACTTGCATTATATAGTATAAATTTTAAATCTG TATTTCTGCAGTGTTGTGTAATCATCTTTGTGTTACATGGATTCTTGTGCTGTTGTGCATAGTGTTTCAAGTGAAGGTTCTGTAGCTGTGGGCCTCTTGC TAATTTGGGGAGAGAATTGTAGGCTGTGGACAGCGGTTAAGAGATCTTTCAAAAGCCTCAGCCTTTAAATGAATTTGCTTCTGTATTTATTTATCTGTGT TTTTTCCTTCTTGATTTGCTTCGACTTTTCAACGGGGAACATGGGATAGCTTGGTTGTGCATAATCTGCGACTTGAGTTGGAATGTGAAATTTTCTACCT TCATGTTTTCTGAGGAGCTTTGGAATGTTTTTTTGCTATACGAATTATGAATTTGGTAAACCTTCCTGGGTTTTGAATTGTTGTGTTTGCTTTACAGAGA CAACTTGTATGTGGGTGCTATGGTTGGACGTATCCAATATGGTACTTTAGATCTTACATCCTTCATTATGAATGTTCTGGATTTGGCTATTTTGGAGTTG TACCGTTTTTTGTATTACAGACCATATGAGCCCGGGCACAAGAATCATATTTGACTTACTTTTCCGTATCAATGGAGGAATAATAGCTTGGTTTGGTCCC CCTTGATTTTTATGATCCGTGGCTTGGTTTGTGGAGTTCTAAGCTTATACTGATGTTTTGCTAAACTTTCATGTTGCCAATGTTTCTTCAGATAATTGGA GTTTTTTATTCATCACACTTTGTGAGGCTGTAGTACTATTCTGCCAAAAAGGTCTTCTCCTACTGCTTTAAGTCACCATCTTCCTCTGGAATAGGAGCAA GTCTTGAATCCATAGGAAGGTTGAATATGGAGTCTGGAGTTTGGTCTTTGTAGAAATACTGTTCTCCATTTCATCATGGAAGTCTAGGAGTTGTGTTTAT TTGTTTGCAGCACTTTGGAGTCTGAAGATGAGTGTTCTGCAGCGTGTTCTGATGGTTTTATGTAATGTTCTGTGTCTTGTATCATTTGTGGTCTGTTGAC TCTGAGTGTTCGCTTTATCCATTAATGATTTTTGCTTGGATTTGCAGAGAGATTCTTGTCTGGGAGTGTGGTAGGGAGTATTCCTGTTCGGCATCAGATT TTGTTATCTTCAATACGATATTGCTTTGCCTAATTTTTAAGTGTTCGCTTTGTATTTGGCTAGTTGCACATTGCTGCCACATTGCACAGTTGGGTTTTTT TCTTCCTGTTTTTGTATCTGGTTCAATTGCCTAGTGAATGGAAGAAATATATCTTGTTTTGGCCCAGGATCTTTTTGTGATCATCTGTGTGGTTTGGAGT TATTTTGAGCTTTCTTTTTGTTGTAATTTTGGCATGATTCTCCCCCTAATTGCTTACTCTATTCCTTAAAGTTTGAAGGTATTTCATCCTATTGCACATG ATGACCTTCCTTTGGAATTGATCTTCTGTTAATCTTCCTACTGGGGCTTCTGCTCCAATTAGAATCAGAGACAACGGTGGTGCCAAATCCGGGAGTTGAT TTTATTTGTTTGCTGGGCTATTTAACCTTTTTTTTCTGGTGATGAATTGTAGTATATGAATTTAGTTGTGATGTTTCTCTTGTGCAGTTTCAGAAGTGAT CTCACTTACTCCGAATTTGTGGTTGACATCACACTTGCATATGTGTTGTAGCGTTCTCCATAAATCCGAAGGTGCTCGACATGCTTCTTACAATGTTCTG CCATAACCGCGTTGTCCACGGTCTTGTTTTTACCAATTTATAGGCCTTGTTGACATTGCTGATGATCTGGAACACTTTCTAAATGATAAGGTTTTTTCTG AATTGGAAGATTGTAAGAAAGGATCTGGAGCAATGTTCCTCATTTTTGTTGAGGATTATTAGAGTGGCTAAGATCATGATGTCTATAAATTGAGATTTTA GAAGTTGTTCTTTGAGTGCCTGCAATTATTTCATCACAGCAATGTCCTGCATATTAGCAAGTCCATTGCATAATTTGGTGACGTCTATCTGGATTCTGGA CTCTAGGTTTTGTTTTTTGTTGATAAATTTATTTTGATAGTGTGGAAAATTTCTGGTTTCCATGATTTCCGCTTGGGTGTTTCAGGCAAAATTGCAATAT TTATGGTCTGTTGAAGCAGCAGTTGGCGGTGTTGATGGCATTGTGGTCTGACTTAGGTTTTGTTAGTGTTAATGTGAATATTCTTCTCTTTTTCTTCTTG CTCGTTCTGTGGATTTGGTTATGTTTACAACATATGGCTATGTCTGTTTCTCTGTTGTGTATAGGAAGCCTCGGTTTCAAGGCACTAGAGATCTAACTCT AATGGAGACTGTATAGCAGTTGCTATGGGCACTTGGTCTTTTGTTCTGATTATCTGTGTTTTTGGTTTGGAGAATTCTGTCACCCTTTTATTGATGTTTT TGTCTAACTTTTGTATGATCTACTAAGTTTTTCGTTTCTCTAACTGGAATTTTCTTCGTCACAGGGATACCCCCTCCTATAGTGAGCACCTTAATCTGCA GGAAATTTAAATCAGCACCTGGAAACAGCCTCTCCTAAGTGCTTGACTTTACAGGGAAATTATATTGTTCTGGGCTGTGGAAGCATGATTGGGTGTATTG TTGGACATTCTGTTGCTTCTTAGGTTCTGTTACCATTACAAAATTTTATTCTTGTTTGTCCCCCTCATATGTGCTTCTTCTGGTTTTGGATGTCTGTGGA TATGCTCATTAATGTGTTTGTGTATCAGGATGCCTATGAGTTTTGGGATGCAGTAGTTTCTCTCTTATGAGGAGTCTGTGTGGTACCTTTATGCTTCGGG ATTGTGACTGCGTGATGGTTGTGATGATATTTTCTCATCTATAAGTTTTTCCTCTCAATGTCAATCTTCTTTGTCACAGGCCTGTAGTGTCACGACTTGT ATGTGAACCAACACTTTATGCATGATTTGTCATATAATACTTCTAAGGGTGTTACATCTGTATTTTTTAGGAGTTTGCAGTCAACTATTTATCATGATAT CGTTCTTGTGGGACATGCATGAAGGAAGAAGGAGTCAGTTTTCTATTCGTTTCCTTGGCACAGTTGGGCCATCCTGGACTTGAACCAGAGACCTATGAAA GGGTTAGTTCCTTACTCATAGGGTGAAGATTTATTTATACCAAAAATCAATTCTATGGTGATTGGCAATAGAGTTGATATGCATTGGCCTTGTGGCTGAA TATTGCATCAATAATCAATACGTTGATCAAAGTTTGTGATTCTTTGTCAATTCTTTGAATATTGTTCAGCCAGTGATCATGACAATCTATGTGTTGATCT TATTGCGTGATTCCTATGCCGCATTTTTGGGCCTGGAAATTCTACCTGTTGGTGCACAACCACCGTCATTAAAGTTTAGAGACCTGTAATGTATTTCCTA TCCTTAGTTGTTTCCAATTGAAGATTTAATCGTAAAAAATGCTCTCTGAAGTCTGAATAACTCGTTGATAAGTTGTTGCTTCTTTTTTTTTTACTTTCTT TGTACAATATAAATTTTAAATCTGTTTTCTGTAGTATTTTGAGTAATGATCTTTCTCTTACATGGATTCTTGTGCATAGTGTTTCATGTGAAGGTTCTGT AGCATTGTGCCTCGTCCATAATTTGGTGAACCCTACTTTGAGAGAAGTTTTGATTTGTCTTGTTTGAATAGGTCAAGCATTTAATAATTAATCTACTATC ATATTTTTTTTGCGCTTGGGTTTTACAGGAAAGATAATTGTAGGCTGTGGCCTGTGGACCTTGGTTAGAAGATCTTTCAAAAGCCTTAGGTTTTGTTAAA ACCTTTAAAATAACCTTTTTCTTTTAGTTTTTTCCCTTTTGATTTGGTTGTCTTTGTTGCTCCAACTTTTCAAGGTGGAATATGGGTAGCTTGGTTGTGC ATGATCTGCGGCTTGGTTTGGAATGCGAAGTTTTCTAGCTTCAAGTTTTCCAAGAGCTTTAGAATGTGCCTTTTGCTACGCGAATTATGAATTTGGTAAA CCT BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_165795; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_330211
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | - |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_003599575.2) |
| Pfam | - |
| Rfam | Intron_gpI (RF00028) |
| GO | - |