Ll_transcript_330095

Id TrinityTRINITY_DN49027_c3_g1_i14
Name TranscriptLl_transcript_330095
SequenceCGTTGTCCCTGAGTATGTCTTCAAGTGTGTATCAAATTAATCAGAATGAAGAAAAAATAAATAAAATTAATTATATTTAATTTTTCAACTGATATGTTAT ACTGTGTAATTGGTTTAGTACACACTTTCGATATAATTTATGATAGAAGATCATTGTGCTAGAAACAACACAACACACAAAGAATTCAATTCTAATACGC GTAGCTCAAATTATTTTAAAATTAAAAAAGTAATATTTTTCCATTTCTCAATCTGGGTCGTTCAATTTATCTGCTCTCTCTCACTTTTCAACCTTCTCTT ATTTTCTCTCTCTTCTTCTCAGAAACAAAGGAGGAAAAACAATATTTCTACAAGTTTTTCATATTACCCAAATTAAAAAAATAATATTTTTTCCATTTCT GAATCTGGGTAAAGTTCAGTTTCTCTTATATCTCTCACTTTTGAATCTTTTGTTATCTCTCTCTTCCTCTGATATTTATATAAAAAAAGCATTTGTATTA TTTTGTTGTTTGCCTAGCAAGTACTCTGGTTCTGAGTACTGACAGAACCTATTGTTTTGGATCTATGATTTGTATTATAATCATTATTCTATGCACTGAG TTTGTTGGTGAGTACCTCTAACACATGTGGGATTTTATTCCTTGCCTCCTAAACATAAGCAAAGTTTCATTTTTAATTTGATTTTATGTTTTTTAATCAC TTATGACCGTGATTTTGGGACACTTACATGCTCTTATATTTCCTTGCCTTGTAGTGCAAAAAAAGTTGAACTTTTCTCTCTTTTCATACCCAACAAAATT ATAGCTCTAGTTTGGTCTCTAAGTAATGCAGAAAAAAAGCATGTATGTTGTACTTGCTTAGTGTGAGTGAGTGAGTGTTCATGCTACTAGCTATTTTACT ACTATCCAGTTTTTATAGAAATTGTATTCCCAAAAGCTCAAATTTGAGGCCTTAAACTTACTAGTTAGTTAAGTTTGAGTGCTATATATATATATATATA TTGTTGAGGGGAAAAAAGAGAGAGGAAAATGGGATCTGGGAATGAGGTTCATTCGGTTGAAGATTTCAATTTAGATGCTAAGTGGATTATAGATCCAAAA GAATTATTTGTTGGTCCAAAAATTGGTGAAGGTGCTCATGCCAAAGTCTATGAAGGGAAATATAAAAATCAGAATGTTGCTGTTAAGGTTATCAACAAGG GAGAAACTCCGGAAGAGATTTCGAGGAGAGAGGCTCGGTTTGGTAGAGAGGTTGCTATGTTGTCCAGGGTTCAACACAAGAATCTGGTTAAGTTTATTGG GGCCTGCAAAGAACCGGTTATGGTTATAGTAACTGAACTTCTATTAGGTGGAACATTGCGCAAATATCTCTTGAACATGCGGCCGAAGTGTTTGGATATG CGAGTGGCAGTTGGATTTGCTCTTGATATTGCTCGAGCGATGGAATGCTTACACTCCCATGGGATCATTCACCGTGACCTTAAACCTGGTATATGCCTAT ATGAATGTTGAAGTTGAGCTAATCACTTGATCGAAATGACTGTGATGTGTGACTGTGCTATAGTTCTGTTCTGCCGAATTTTGCATCCTGCATCAATTAC ATGTTGTCTTATTATGTGCCAGGGGTTGCTGATCTTGATTTGTAAGACCTTTCAAGTAAATTGAAATATAGTCATTGTTTTTGTTTGCTGCTATGAGTCA CTATGCAAAAATAGGCTTTATTGCTTTATGTTGTAAATTTATGCAACAAAGTCTATATTTCTTCCCTTTATATAGTAAGACCATATTTCTGTGCTAGCCG TTCTTGGCCGTTGAGTTTGTGATGATAAGGAAGTTTGGTCCTTATTATAAGGCAAGGAAAATACTTACTTTTCTTGAATTTTTAAAACGATACTATAAAA TTACAATTTTACCCTCTTAACTCTTCTCTTGAATTATGTTTCGAATTAATGAACAATGGTTAAATAATAGGAAAAAGCAATAAATCTTCTGTAGAAAATA TAAAACGCCTTATAAAAAGGATCATAAATTTTTTTAGAGGGTGCCTTATAACTTATAAGAAGGAGCATAGGGAATATATCTAATAACTTGTTTCTTCTTT TGTTTATTTCCAGATAACTTGATCTTGACAGCAGATCATAGAACAATTAAACTTGCTGATTTTGGTCTAGCCAGAGAAGAGTCGTTAACGGAGATGATGA CTGCTGAAACAGGAACGTATCGTTGGATGGCTCCAGAAGTACTTACCTCTTAATTAATGAAAACTTTGTTAACATTTATTAATTTTCCGGTTGGTTGGTT CCATATTATGTAATTTAGATCATTACATTCCTGTTTTGTGGCAGCTTTACAGCACCGTGACTCTAAGACAAGGCGAGAAGAAGCATTACAACCATAAGGT GGATGCGTACAGCTTTGCAATTGTGTTGTGGGAGCTCATCCATAATAAGGTGCCCTTTGAAGGCATGTCTAATCTACAAGCAGCATACGCAGCCGCTTTT AAGGTATTTAACATTCTTATGCTTACTTGCCGATAGAAGACTAATGCGATGACGCTTTAAATCTTTTAAGGATTGTGTTTACTAGTGAATGTGATGATGT TATTGTTGGAATTACCAATGACTGGTGGTAGAAATATTTGATTGTTTCAGAATACTAGGCCCAGTGCTGAAGACATTCCTGAGGATTTAGCTTTGATTGT AACTTCATGTTGGAAAGAGGATCCAAAGGAACGACCGAATTTTACCGAAATCATACAGATGCTCCTTCGGTATCTCTGTACTATTTCACCATCAATGTCG GTGGCTCCTTTGCAGAGGATGACTTCATCTGAGAATGCTGTGTTGCCACCGGAATCACCTGGTACACGCGCCTTAATGGCGACAAGAGATGATTCTATAG AAACACCAAAAGCAGCCAATATGGAAGACAGGCCTAAAGGGTTTTTGTTCTGCTTTAACCATTGTTATTGATTCCTCAAAACACATAATTTTGATTCTTA GGTAATTTTGGAATGTAATATATCATTGTAAAATAAGGTTCATCCAAAATGTTTATGTGGCACTGATAATAAAATAAAAGTGGAAAATGTTTACTTAGCA TTGATGATGAAACTTTGTATCATATTCCAATTCATTTAATTTGCTTTTCTATGTTGATGCTTCTATTTGTAAGATAATTGGTTTCAACATTATCAATGCC AACAAAAGTGGA BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_165920; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_330095

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_330095
BlastpSerine/threonine-protein kinase HT1 from Arabidopsis with 46.72% of identity
BlastxSerine/threonine-protein kinase HT1 from Arabidopsis with 46.72% of identity
EggnogSerine Threonine protein kinase(COG0515)
KeggLink to kegg annotations (AT1G62400)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019442512.1)
PfamProtein tyrosine kinase (PF07714.16)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;