| Id Trinity | TRINITY_DN49048_c0_g1_i19 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_331061 |
| Sequence | ATTTTTTTCGCTACTTTGTTTTGGCTAAGCTAAAGCTCTTCCAAAGTGCAGGTTCAATATTGTGACACTAATGGGTCACCTTCTGAATCTACTCCATGTA ACATCTTTCTTAACCAAACTAACTTTCTATCACTTCCCCAATTTACTTCACCACAATACATGTTCTTATCCTCCAAAAGTTTCCAAATTTCAGAAATATC ATGCTACCCCATTGGCTTTGCAAGGTAGTGGGGATATAGCAGGTCATGTTGAGAGCCCATTTAAGCATAAGGTAATATGCAGTCTAGGCTCCAATTTTGT TTGTTTTCGAGGATAAAATTGCGTACATCTACCATTTCCGGAATCCGGACCTCACTGGGTGGAGCCTCGCGGGTTAAGCCATGCTTTGATATTCAGTTTG TTATGATTGAATGCCCCATAATTTTAACATTTTTTGAAGTTTTATACAATTACTAATGCTTATACTTGGAGTATCAGTATTTGTTTGCTTCAATAACTTG TAAGAAGGAAAGAAAAATGCGAGTTTGTTTTGCATAGCTAGTTATTAAGGTAGTTGAAATGTTGTAAGATAAGCCCCTAACTTATAAGTCCATAAGTTAT CTCTATTCTCTAGTAGCTAATCAAATATGGGCATATAAGCTCCTAGCATATTGAAATAAGCCCTTTACCAAACACCTGAAAGTAGCTTATTTTTTGTCAA ATAAGTTAATTGAATAGCTTATAAGTTGTTTGATGGTGTTGCCAAACACACTCGTAAAGCTTCAACCACTCCCTCTAACAGTCATTTTGTGCTCTCCTCA TGAGTGTTTCAAGCAGAATTCAATAACTCTATGGTTGATATGAAGGGAATGGGGCAGCATTGTTGCATTTTTTAGCATTGTAGGTTGCTCTTTTTTCCAT 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AACCTGGGCATAGATGGAGAATGCTGCAGAGGTCTTTAATTGAAGCCATAGTGGATCTTCTAGCATCTGATGGGAAGGTCTTTCTGCAATCTGATGTAGA AGCTGTAGCAATAAGCATGAAAGAACAATTTCTCAGATATGGCAAGGGTAAGCTTGATTTGGTGCATGGCCAAAATGAGTGGCTTGAGGAAAACCCTTTT GGAGTTAGATCAGACTGGGAAAAACATGTTTTAGAGCGCGGGGCCCCGATGTATCGAATGATGTTTTCTAAATCATCTGATATTAGTGAAGTTTCAGCTG CAAATGATGTAATCCAAAAAGATGATTAATCCATGAAACCCCTCCAAGGGATTGCTGCTTTTGCAGAATCTTTCTATCACAGAGCTAATGGTTTCTCCCT GTCAGGCAATGTTGCAGGTACACTGTTTTTTCATGAATTTTATCTTATTATGACATGGATAAATTATGAAATAATAAGAGGCTGAGTCTCGGCACAACAG TAAGATTGTTTGTCTTGTGACCTGGAGGTCATCGGTTCAAATCCTGGAAATAGTCTCCTCACTTGTGAAGGTAAGGTTGCGTGTATCTCCCTCTCCATAT CTTACTAGGTGAGAATCTCGTGTACTAGACCGCCCTTATATATGAACTCCGAACTATTGATCTTGTGCAGGGTTCAAATTCCTAACATTTGGAATTATGT GAAGAGTTGTTAATGAGCATAATCAGATATTCAACAAGAGAATCTGATCAAGGATGTCCAAAAGCTAGCATTGTGTAACTTTATATTGAAGTTATACAAG GCATAGAAAATCATAATTTCAAATACATGACATTTTGTCATTTCATGCATATATACACATCTCACTTGGTGAATGGTACAAAATTTGTGTAGGGAATGCA AAAAAGCCTAAATCTAACATTTTTTAGTTGACAACCAAACCAACTTTTCTTCTAGTGTGAATTTCATATTTGAATTTTACACAGAAAACACCAAATTATC ACTTGCGCGGGAACTAACATCAATAAGATTTTGAC BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_166089; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_331061
| Blastp | Phosphoglycerate kinase, chloroplastic from Spinacia with 31.49% of identity |
|---|---|
| Blastx | Phosphoglycerate kinase, chloroplastic from Spinacia with 31.71% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019442815.1) |
| Pfam | Phosphoglycerate kinase (PF00162.18) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |