Id Trinity | TRINITY_DN49048_c0_g1_i20 |
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Name Transcript | Ll_transcript_331062 |
Sequence | ATTTTTTTCGCTACTTTGTTTTGGCTAAGCTAAAGCTCTTCCAAAGTGCAGGTTCAATATTGTGACACTAATGGGTCACCTTCTGAATCTACTCCATGTA ACATCTTTCTTAACCAAACTAACTTTCTATCACTTCCCCAATTTACTTCACCACAATACATGTTCTTATCCTCCAAAAGTTTCCAAATTTCAGAAATATC ATGCTACCCCATTGGCTTTGCAAGGTAGTGGGGATATAGCAGGTCATGTTGAGAGCCCATTTAAGCATAAGGTAATATGCAGTCTAGGCTCCAATTTTGT TTGTTTTCGAGGATAAAATTGCGTACATCTACCATTTCCGGAATCCGGACCTCACTGGGTGGAGCCTCGCGGGTTAAGCCATGCTTTGATATTCAGTTTG TTATGATTGAATGCCCCATAATTTTAACATTTTTTGAAGTTTTATACAATTACTAATGCTTATACTTGGAGTATCAGTATTTGTTTGCTTCAATAACTTG TAAGAAGGAAAGAAAAATGCGAGTTTGTTTTGCATAGCTAGTTATTAAGGTAGTTGAAATGTTGTAAGATAAGCCCCTAACTTATAAGTCCATAAGTTAT CTCTATTCTCTAGTAGCTAATCAAATATGGGCATATAAGCTCCTAGCATATTGAAATAAGCCCTTTACCAAACACCTGAAAGTAGCTTATTTTTTGTCAA ATAAGTTAATTGAATAGCTTATAAGTTGTTTGATGGTGTTGCCAAACACACTCGTAAAGCTTCAACCACTCCCTCTAACAGTCATTTTGTGCTCTCCTCA TGAGTGTTTCAAGCAGAATTCAATAACTCTATGGTTGATATGAAGGGAATGGGGCAGCATTGTTGCATTTTTTAGCATTGTAGGTTGCTCTTTTTTCCAT 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Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_166089; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_331062
Blastp | Phosphoglycerate kinase from Synechococcus with 32.2% of identity |
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Blastx | Phosphoglycerate kinase from Synechococcus with 32.41% of identity |
Eggnog | phosphoglycerate kinase(COG0126) |
Kegg | Link to kegg annotations (Synpcc7942_1116) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019442814.1) |
Pfam | Phosphoglycerate kinase (PF00162.18) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |