| Id Trinity | TRINITY_DN49048_c0_g1_i21 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_331063 |
| Sequence | ATTTTTTTCGCTACTTTGTTTTGGCTAAGCTAAAGCTCTTCCAAAGTGCAGGTTCAATATTGTGACACTAATGGGTCACCTTCTGAATCTACTCCATGTA ACATCTTTCTTAACCAAACTAACTTTCTATCACTTCCCCAATTTACTTCACCACAATACATGTTCTTATCCTCCAAAAGTTTCCAAATTTCAGAAATATC ATGCTACCCCATTGGCTTTGCAAGGTAGTGGGGATATAGCAGGTCATGTTGAGAGCCCATTTAAGCATAAGGTAATATGCAGTCTAGGCTCCAATTTTGT TTGTTTTCGAGGATAAAATTGCGTACATCTACCATTTCCGGAATCCGGACCTCACTGGGTGGAGCCTCGCGGGTTAAGCCATGCTTTGATATTCAGTTTG TTATGATTGAATGCCCCATAATTTTAACATTTTTTGAAGTTTTATACAATTACTAATGCTTATACTTGGAGTATCAGTATTTGTTTGCTTCAATAACTTG TAAGAAGGAAAGAAAAATGCGAGTTTGTTTTGCATAGCTAGTTATTAAGGTAGTTGAAATGTTGTAAGATAAGCCCCTAACTTATAAGTCCATAAGTTAT CTCTATTCTCTAGTAGCTAATCAAATATGGGCATATAAGCTCCTAGCATATTGAAATAAGCCCTTTACCAAACACCTGAAAGTAGCTTATTTTTTGTCAA ATAAGTTAATTGAATAGCTTATAAGTTGTTTGATGGTGTTGCCAAACACACTCGTAAAGCTTCAACCACTCCCTCTAACAGTCATTTTGTGCTCTCCTCA TGAGTGTTTCAAGCAGAATTCAATAACTCTATGGTTGATATGAAGGGAATGGGGCAGCATTGTTGCATTTTTTAGCATTGTAGGTTGCTCTTTTTTCCAT TTTAGGATAGTAGGGGATGCCAAGTTATCTCCCGGATGCATTTTCTTTCCTTTTTACATCAAGGATCAACTGTACTAAAAGTTTAAGTTGCTGGGACTTG GGTGTAGGTTAACAGTAGTTATATAAAAAAGGAAGATTTTCTTTCCTTTGGGCATGAAAGGTCGATAAAGCAAAAGACAATCATGTCTTGTGCTAACATT TTAATTGAATTATGAAGGGCAAGTTTTGCAAGTATCACAATCCTGACTATTAGGTCATAAAAGCTTCGATACTATGTCAACTACTTTAATGCAACGGTAA GGTTGCTGATTAGTGACCATAATCTTGGAAACAGTCTCCCCACTTGTGGGGTAAGGCTTTGCATATCTACTCTCCCCTGACCCCAGTAGTTGGAAGTCTC GTGCAATGGGTCACCCAATATGTCGAGTACTAGATCTCCTAAAAGCTTAAGCTATTAGATGTGTACATTATATCTAACATGACCTTCTATGCAAAAACCA CTTTTGGATTGAGGTGTAGACAAATGATATGCCTCTCATACATTGTGCTGAAACTTAATTTAATTATGAAGAAGCTTTAATGCCACTTCAAAGAACAACC ATTCTAGAAACCTAGATTGTCAGGTGCTTCCCAGTAATGATAATTTTTTTCTTCTGGCGTAATGGTTATTGCCATTAATTTCAAAACAAATATGCTTTGG TTGTTTAAAACTGAAGTTCTACCATTTCGTTTTAGTTTTGCTCTTAAATTGTAAAAATCAAGTCTTAGTAGATAAAATCAGAGGTCATTGGTATCTCTAT TAGCTAATCAAATATGGGCATATAAGCTCCTAGCATATTGTAATAAGCTCTTAAATTGTAAAAATCAAGTCTTATGTAAAATATTTTAGCCTAATCTTGC TCTTCGTATTCTTACATGATATAGAGTGATAAGTACAATTATTGGTTGTAGATTTTGTTGTGGCTCTAAATATTATGGTTTTACTCTTAGATTTACATTA ATAATGGAGGAGAGTTGAATGGTATTCCTCATATACAAACTCTTAGAGAATTTCCCAGGGCGGAGCTTTTTGAAAAGGTAGTCATGGTCCGATTTGATTC TAACATATTGCTCAAGCAAGAGTCTAACCAGACGACTCCGTCAGGTTTTAATGCACTTTTTACGATTAAATATTTATATGAAGCTGGAGCAAAGGTAATC CTTGTAAGTGACTGGAATAGAAATGGTTCAGAGCTTCACACAGAGTCAGTTGCAGGTACATCCTTAAAACCTTTTCTCGCAATCGGTGTCTTTAGTTGCC ACTGTGAACTGTGAATTTTAGCTAATGGCTATTATAAGATATGTTTATTGCAATTCTACCTTTATCTAAGGCCAGGAAAGGCAGAAGAAAATTGTCTAAT GTCGAAGCATGAAGCTGTTATGAATATAGGCAACGAAATTGGCAAATCCTTTCTTTTATATAAGGGAGCTTCCATTTATATAGTTAACAATCTTTACTCT ATATTGTAGATTTCTTATCAGAAATTCTCCAAATACAAGTTGTTCCAATGCAAGGCATTTCTTGTAACAAGCTAAAAAACGTGAAAGACCACATTAAAGA GAATATCCATCTTCTGGAGAATCTTTCTTATTTTAAAGACGAAGTTTCCAATTGCTTGGAGTTTGCTAGAGTATTATCGTCGGGAGTCGATATCTTTGTC AACGACTCCTTCTCCAACTCTCATAAAGTTCTAGCATCAACGGTTGGTGTTACCCGCTTCTGCTATGCCTGTATAGCTGGTTTTCACTTTGAGGAGAGGC TCTGTCTACTGAAGAATGTCGGAGAAGCCAGCAAGAAACCATATGTTGCAATTATTGGTGGGGGTAATCTCTATGATAAAGCAGCATCTTTTCATTTTTT AGCATCCAAGTGCGAGGGTTTCTTGTTTGTTGGAATGATATCATTTCAAATAATGTATGCATTAGGAGTATCAGTTCCTCTTAATTTGGTGGACCGAAAG GCACTTGATGAAGCTCTAGACATAGTGAGACTTGCTCAAGATACAAATGTACAAATTTTGTATCCAAAAGATTTTTGGTGCCGGAATAAACAGAATCCAT CACAACTGCAAGTATTTCCTTCTCATGGAATTTCTGATGGTTGGGTGCCTGTTGACCTTGGACCGGTATCATTGGATGAAATAAGTTCCTTTCTTACAAA TTGTAAGAAAATCATGTGGATTGGTCCAGTGAAATTTGTTGATTCAAGTAAATACACAAATGGGGCATCTAGATTGGCAGAAGTTCTTGATCAGCTAAGC CAAAGTAACTGTGAAATAACTGCAGTTGGAACTACGGCATGCCAACTAATGAGGCAGAAAAAAAGTTCATTATCCTTTATAAGTATGATTGAGAATGCTA CAGTTGTCTGGGAATTTCTTAAAGGAAGAAAACTGCCCGGTGTTATGGCAGTAGACAGGGCATATCCTTTTGAAATCAAGTGGAATGATGTTTATTCTGA TCCAGCTCAACCTCTTGTTGTTGATATCGGAAGTGGTAATGGGCTTTTTCTCCTCGAAATGGCTAGAAGGAAGCGAGATTTGAACTTCCTTGGTTTGGAG ATTAATGAAAAGCTTGTTTTGCGTTGTCTGGATTCGACTCATCAATATGGCCTTAAGAATGGGTATTTTATTGCTACTAATGCAACATCAACATTTCGTT CCATCGTTTCTTCTAACCCAGGAGAGTTAGTTCTTGTCTCAATACAGTGTCCAAACCCCGATTTCAATAAACCTGGGCATAGATGGAGAATGCTGCAGAG GTCTTTAATTGAAGCCATAGTGGATCTTCTAGCATCTGATGGGAAGGTCTTTCTGCAATCTGATGTAGAAGCTGTAGCAATAAGCATGAAAGAACAATTT CTCAGATATGGCAAGGGTAAGCTTGATTTGGTGCATGGCCAAAATGAGTGGCTTGAGGAAAACCCTTTTGGAGTTAGATCAGACTGGGAAAAACATGTTT TAGAGCGCGGGGCCCCGATGTATCGAATGATGTTTTCTAAATCATCTGATATTAGTGAAGTTTCAGCTGCAAATGATGTAATCCAAAAAGATGATTAATC CATGAAACCCCTCCAAGGGATTGCTGCTTTTGCAGAATCTTTCTATCACAGAGCTAATGGTTTCTCCCTGTCAGGCAATGTTGCAGGTACACTGTTTTTT CATGAATTTTATCTTATTATGACATGGATAAATTATGAAATAATAAGAGGCTGAGTCTCGGCACAACAGTAAGATTGTTTGTCTTGTGACCTGGAGGTCA TCGGTTCAAATCCTGGAAATAGTCTCCTCACTTGTGAAGGTAAGGTTGCGTGTATCTCCCTCTCCATATCTTACTAGGTGAGAATCTCGTGTACTAGACC GCCCTTATATATGAACTCCGAACTATTGATCTTGTGCAGGGTTCAAATTCCTAACATTTGGAATTATGTGAAGAGTTGTTAATGAGCATAATCAGATATT CAACAAGAGAATCTGATCAAGGATGTCCAAAAGCTAGCATTGTGTAACTTTATATTGAAGTTATACAAGGCATAGAAAATCATAATTTCAAATACATGAC ATTTTGTCATTTCATGCATATATACACATCTCACTTGGTGAATGGTACAAAATTTGTGTAGGGAATGCAAAAAAGCCTAAATCTAACATTTTTTAGTTGA CAACCAAACCAACTTTTCTTCTAGTGTGAATTTCATATTTGAATTTTACACAGAAAACACCAAATTATCACTTGCGCGGGAACTAACATCAATAAGATTT TGAC BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_166089; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_331063
| Blastp | Phosphoglycerate kinase, chloroplastic from Spinacia with 31.53% of identity |
|---|---|
| Blastx | Phosphoglycerate kinase, chloroplastic from Spinacia with 31.83% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019442815.1) |
| Pfam | Phosphoglycerate kinase (PF00162.18) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |