| Id Trinity | TRINITY_DN49080_c5_g1_i1 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_331808 |
| Sequence | AGAAACATGGTGCAAAACCCCGGGTTTGTTTCTTCACTTAAGGCCTGTAGGCTGTAGGAACCTTTGTTTATGCACCTGGCAAATAAGTGATTGTTATTTT GATTAAAAACACATTTCTTGCACTCACTCATTTGTTTGATTGGGCTTTTACTAAAAAAGAACTGCAAGAAAGGCTCCAATTGAGTTTTGTTATGAAGCTA TACTTATTCAGCTTCTAAAAATCATTTTTTGCCATAATCACCTTTTTTTTAAGTCCAATCAAACAGGCCTTTCATTCCTTAGTTTCCACTGACTTTTATT TGAATGACTATATTGCGTGCATTATTTTTTCCTTTTTCTCTCTCCCTCTCTTTATGTAGATGGCACCCATTCTTGTCAAAAGTGACCGTGAAGTACCAGA ATATGAGATTGATCCTTCTGAACTTGATTTTACAAATAGTGTTTGCATAACAAAGGTAAGTATTTAAATTTCCTTTGTATATAGTTAACAATCATGTTAT TCGATGCTTTCTCCTTTTATATTATCATATTCTTCCCGAGTCCTGTGTCAGCATTACTCATTTTTTCATTGCATATTTTGTATTGAATATAAATCGAATT TTAGGGAACTTATAGTATTGCATTATGGCGTGGAATTAAAGTTGCTGTCAAAACACTGAGGGAAGAAGTGTTCACTGATGATGATAAAGTGTGGGTTGGT CTAATTATACTATTGGTTTTTTGTTCATGTTAATTCAATTACTCAGTTCTGGATTTGTATTCTCATAGTGGATTTTAAATGTCCTTAACTGCCACTCAGA AAAGCATTTCTTGATGAACTGACGTTACTTCAGAAAATACGGCATCCAAATGTAGTCCAGTTTTTAGGTGCCGTAACACAAAGCACACCAATGACAATTA TCACAGAATATCTACCCCAGGTTAATCTTGATCCTACACTGCCTGTAAGGAAAAATTTGTTGATCATTTCTATTTGCTCAATGTTCGTGGTGTTCATGAG AAAATTATGTTGGTTAGTTGACTATCACAGATTAGAGAGTAGAAGTATGTTCTTTGAACTTTGTCATTTTGATTTAGTCTTTAGATAGAATGTGACAACT GTAATTTCAATAGGACTAATGCAAATCGAACATGCATAATTATGAACTTAAGATCATAAAAAGTGCTCACCTAGATTTGTGCTTAATTACTAGTTTTTTA TATGCAGTAATTGTTATTTGCATGGATCAATCAAATGTGTCCTTGTTCCGCCTAGAAGTTATAACTATCTGCAATGAAAGAATTTAAGTATTGATTACAT ATACCAGTTTGTACCCAATAATTTATTGATCTCTGTCTTCAAATGGACCAGACATAGATGTGCGAGTTTTGTTCTGTTTATTCGGTATTCAACTCCATAA CTATGAAGTGGTAATAAATGGGGAAGTGCAAGTATTTTAAAAGTTGCCATAAAAAGATACATGTACATGTGTTGGTGCTGGATACATAAATACTGATATA TATGTGATGTTTGCTGTTCCAACAAATTGAGAGATATCTCTACTTACATGTAATGTAGTTAACTATAATCCACATCTTCCACAAATGTAATTCCTGACAA TTTGCAATGGATTGTCATCTTTTCAGGGAGATCTCCGTGCCTACTTGAAACTGAAAGGTGCTTTAAAACCAATAACAGCTGTTAAGTTTGCACTTGACAT TGCCAGGGGGATGAATTATTTGCATGAACATAGACCAGAAGCCATTATACACCGAGATCTTGAGCCTTCGTATGTTTTCTGATCTCCTTTCCCATCTAGT TGATATTCATACTCTTCTAGAATTTGTATGAACTATGAAGCATCATATATTCTTCAATAGAAGCATGCATTTTTTCTTCGTTCTTGAATGCTTTAAACTG TTTGAAGTTTCTTCATTGTAATTGAGTAAGATAACAGAAATATACTGCGGGATGATTCTGGACATCTGAAAGTTGCAGACTTTGGAGTGAGCAAGTTGCT TAAAGTTGCAAAAACTGTCAAAGAAGACAAGCCGGTGACATCCCAGGATACGTCATGGCGCTACGTTGCTCCAGAGATCTATAGAAATGAGGAATATGAC ACCAAAGTGGATGTGTTTGCATTTGGTCTGATATTGCAGGAGATGATTGAAGGTTTGCCCCCGTTTTATCCAAATCCAGAAAATGAAGTTCCTAAGGCTT ATGTTGAAAATAAGCGACCACCATTTCAAGCTTCACCCAAGCTTTATGCTTATGGACTAAAACAGTTAATTGAAAAATGTTGGGATGAAAAATCTTCCAG AAGACCAACATTTAGGCAAATAATTGAGATATTGGAAGACATCAACTACCATCTTGCTCAAAAAAGGGGATGGAAGGTATTTCTCTAACATGCAAAACTC AACTTTTCTTCAATTTTAGTACCAGTTGTCATAGTATTGTTTTAAATGCTAAAAATCACAATGTACAGAATTTTAGCTTTAAGGATTTTTCTTGTACCAT TGCTGTTGTTATCAGCAACATCTGTGGTTGATGTGGGCAGTGTAAATGGCCACTTCAAGAGGGGTTGATGCCAATTTAACTACCCAAGGATATAGTATAT TTCAATGCATCCACCTTATCCCTTTAAATAAAAGTATAGGCTGGAGAGTGAGATCATGGATCCAAAATCCACCACATTCACCTTTAATCCCCTTCGGGTT AGTTTGGGAATTGGATTTTAGAGGGGAAGGAAGGGAAAGGGAAGGTTTGGGAGCCATGAAATACACTTGTGAGATGACTCCCAAGCCTTCCCTTTACCTT CCTCCCCCTCCAAAATCAACTCCCAAACAAACCCTTAAGGAAGAGTGATATGTAGCAATACTTAAAAATATGGCTTGTATTTTGCATTTCACTACTGATT TAGACTGATTTTAATTTTACATACCTCAATATTATAGGGCGAGTTTCAGTGTAACGGTAAGGTTATTGCTTAGAGATTAAGAGATGTGAGTTCAAATCCT GTTAACAACCTCTCCACTTGTGAGGTATAACTACGTACATTTACCTTTTACAGATTCTGCTAAGTGTGAGTTTCATGCATTTGACCGCCTAGCAGTCAGA TTGTTGTGTAGTAACCTAGAGGTAAAGTGTTCAAATCTTGAAAACAACTTTTCCGCTTGCGGAATAAGGCTACCCACATCTACCTTCCCCATACCCCAAT AAGTGGGCCTCATGCACCGGGCTGCCAAACGGTAAGGTTGTTGCTTAGTAACAAGATGTTACAAGTTCAAATCCTGAAAACAATCTTTCTGTCTATAAAG ATAAGACTGCGTATATTATGCTCATTATACCCTACTAGATGAGAGTCTCGTGCAAATAGACAATGACTATCCTTTTCAATATTAAAATGCCCTCATGCTT AAAAAAGTGTGGACGTTGCTATTCACATCGTGGCCATGTATGATTCATTTTCAAATGTGTGTATTTTTTCTTGTATGGTAAACAGGCTTGCTTTCCTACA TGCACCCTGAAGGGCCTTTTTAAGGGGGATCGCACACGTCCAACTAGTAAATCATCTCGCGCTTCAATCAGATAAATAATTAGCCTTATAAAGCAAGAAT TTCAATTTCATGATTCGTCTTTCTTACTAAACCACCATGTCGTTTTGTGAATTCTCATTTCATAATGTGGTCTAATGAAAACCTCTATGTGGATAGTTTT GACCATATTCCTGACAAATTTGTATAAAACATGTGGATATATGAAGAATTTTGTTGCCAAATAGAAATAAGAATAGAATATTCTATGCAATGTTTAAATC TCCTCATCAGTAATTATATGAAGAATTTTGCTGCCA BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_166408; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_331808
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Serine/threonine-protein kinase HT1 from Arabidopsis with 36.03% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019462043.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |