Id Trinity | TRINITY_DN49097_c1_g1_i5 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_330041 |
Sequence | ATTTGTTAACAGTTATTAGTATGATAAAGGCAGTAGGGGCAACAATTTATTACAGCGTCATATTTAGGTAGCGCTTTATTTCCCTATATATTGTCATTTC TGTGTCACAGAAGGAGAAGAATATAACAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAATTAGAAATGGCGAAATCATCCGAAAACGAACACCCACACAAATCT TTTGGTTGGGCTGCCAAAGATACTTCTGGCATTCTTTCTCCCTTCCATTTCTCTAGAAGGGAAAATGGCCCTGATGACGTCGCTATTAAAATCCTTTTCT GTGGTGTTTGCCATTCGGATCTGCATACCATCAAAAACGATTGGGGTTTCACTACTTACCCTGTTGTTCCTGGGTACATAATATATACCTCTTAACCATA TTTTACATCTTTAAAAGGTTAATGGTTAATTGTTAATCTCAAATATGCTAGAACTATTAAACGACTAAGGGTCTTTACCTTTTTCTTTCTAAATGGATTA AATCTTAGCCCATCAATAATTTATCTCATAAAAATAGTTATTAAATTGAGAAAGAAGTTAAGAGTTTTATATATTGTCAATTCATATTCACCGTCTATTT TTAATCATCATTGAATGTTAGATAATGAATGTATAAATCTATGTTGTAAAAAATATTATACTCAATTAAATTTTGGTTAAGAAGTAGATGACACAATATT AAACACCTTATGTGACACATATTAGAAAATAAAAAATGGGTTTTATTTTTAAATTGTAAATTATATTTTAATAAAATAAATATAAAAATTAAGGAAACTT TTTTTGCTTTGTATTATGACAGTAATGGACACTCTGATACTAGTACCTATGGAGTATGGAGAGTAGATGGATTGTTAATGTTGAGACCTAAGGTGGTTGT ATTTTGGATCTCAATTCTTAAATATTCATAAATTCTCTTTGGACTTCAGTGTACCGGGTCATGAAGGATAAAGAAGAAAACAACTTCGTTGCACACATTT TCGCCACATCAACTTACATAGGCAGCGCAATGTTGGTGTGTAGAATTTTAGTAAAAATCATTAAAAATTGTATAGACATGTGCTGATCAACCGATGAATA TATTACTTAATATTAAAGGTGAGGTTGGATTATATTAGAACTATATTATTATAAGAAGTGTGGAGGAGAGAAAAGAATATTTTATATTGGACTTGGCATA ACTTCCACCAATTAGTAATACCAATTATAAGCACACATGGGTCTTGGGCGCCTAATCTCTAATAATATATTGTTAACTGTTCATTGTTCTTGGGGATCTA GTTATAATTGGTCATATCTCATTAACAAAATATTTTATGTTCTGAATTGGGTGTTTGTGTAATTTAATTGAACAAAATTGATTAGTTTTTAAATTCTCTC ATACTTGAGTGATAAATTATAGTTTGAGGCTTGTATATATTTGTGCATTAGTCAACGCTGCACATAGTAATACTTGTTGCTTATTAAGAAGACATCTTTG AGTGTGGCCCGCATTGGCTTTTCCAATTGTATTTTGTAGGCATGAGATTGTTGGTATTGTGACAAAAACTGGAGATAATGTGAAAAAATTCAAAGTGGGT GATAGAGTTGGAGTTGGTGTTATAGTGGAATCTTGTAAGGAATGTGAGTGTTGCAAACAGGATCTGGAGAGTTATTGTCCTAAACCTGTGTTTACCTATA ACTCTCCCTATTATGATGGGACAAGAACCCATGGTGGCTATTCTGACTTTGTGGTTGTTCATCAGCATTATGTTCTTCAATTTCCTGAGAATTTGCCCCT TGATGCTGGTGCTCCACTACTGTGTGCTGGTATTACTGTGTATAGCCCAATGATTTACTATGGGATGACAGAGCCAGGTAAACACTTGGGTGTGGCAGGG CTTGGTGGATTAGGCCATGTTGCAATCAAATTTGGTAAAGCATTCGGTCTGAAAGTTACTGTTATCAGTAGCTCTCCAAACAAGGAATCTGAAGCCATTA GCAAACTTGGAGCTGATTCTTTCCTTCTATCCACAGACCCTGCAAAATTCAAAGTAAGTGAAATATAAATCTTGAAAACGTTTGGAGGACTTGCTTTATC TTCTAGGCTTTGGTTTTGACAAATTTACTGGAACTGGTAAGGATAATGATGTTCTATGTGGTAGCAAATAATATATGCTTTAATAGTTAGAGGATTAGAG CTAGAAATAGAGAGAAAAATCAATAAAATGACTTAAATCTAAAAGATGTTTCTAGAGAGTTGGTTTTAGACATAACACAGTGGTGTTATTCTTGCATGTG GTCAACCTCATCTAGTGGAAAAGTTGTTTGTTTGTTAGAGTTTGCTATTTTGTGATGATAATCTTTTGTCACTGTTTAAAAGCTTGGTTACTGACACAGT AGTGTAATAGAAAGTTGCTTGAATTTGAAGCTGTAAATTGAAATTTGCCTCAACACGAGAAGACCTCATTTCCTCCCTCAGCTTTATAAACTGGATTAGC TGAACTATCCTAGCCCTGTTGAAAAATAGAACCCAACCATGTTCTGCTTTTCCATGATAAACAATATTACAAGAATTGACTGAAGGGTCACTGAATTCTT ATAATGACTTTGTATTCTTGTTCATATTATACGACAGGAAGCTATAGGGACCATGGACTATATCATTGACACAATCTCTGCTGTTCATTCTCTGACTTCA TTGCTTGCTCTACTGAAGCTGAATGGGAAGCTGGTCACTGTTGGGTTGCCGAGCAAGCCTCTCGAGCTGCCAGTCTTTCCGTTAGTTATGGGAAGAAAGC TTATAGGAGGGAGCAACTTTGGAGGGATAAAGGAAACTCAGGAAATGCTTAATTTTTGTGGGAAACACAACATAGCTGCTGATATTGAGCTGATTAAAAT TGACCAAATTAATACAGCTATGGAAAGGCTTGTCAAATCTGATGTCAAATATCGCTTTGTGATTGATGTTGGTAACTCCTTATCAACTTCATAGAGGCTA TCATAAATTTTCAACTCTTTGCATGTGGTGCCTTAGATGTCTCAGTATATTAGAAAACATAAGATTGGTGTTACATGCCAAACTTTAGATATGAGGTCAT TCTCTAATTTCTTCTGCACAATGGTTTGGACTCTTGAATTTATATCATGTTGCTTTATTTTCATAAAGTACTAATCTAAGCTGTTTATTTTGTGATTTTG TTTGCTATTTATTTATTTTTGCTCTCCTTTTTCTTTGATGTATCAAGCTATGTGCCTGCATATGTTGGACTTCATCCCCTTTACTGGTTTCAGTGATTCC AAATGCATTTGGCATTTTGGCCAATACATTTTGCATACTGAGATTTTGTACACAGTGAAAGCATTTTACTTTTTTGACATGATACATTTTATAAAGAACC TCATTTCTGCATTAGGAGAAGAAGAAAAAATTGTACATATATTTTTAATGAAACAAATTCCATTCAAGGATTTCGTTTTCTTTTAAATGACATAGCTTAA CAATAGGAGTGGCATTTCAGGTTGGGTCATTAACACAATAGCACATGACTCGTTTCACAGTTTCACCTACAAAATGAAGTTATTTCACCTCATTAAATTC ATAATTTCTTAATATTGACTTTTATTGTGAATTTCTTGATATTGACATTTATTGTGAATGGTTAATGAAAGTAAATATATGCCCCTCTGTCATGCAATCA TTCCATATCAGTACTTTAGGATATAAAACATAGTCATCTAACCTCTTGTGAACCCCTGTGATTGGTGATGGTAAAACATGTTCTGATGAGGAAAAAATTA TATTATATTTTAACATTAAGAAATTTATCAACTAAAATTTGTCTATATTAGGATTCTAAATAATATATATTCTTTAGGACAAATTAAAAAATTGAAAAAC CCATTCCAATTTTGTAATAAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_166536; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_330041
Blastp | Probable cinnamyl alcohol dehydrogenase 9 from Arabidopsis with 78.38% of identity |
---|---|
Blastx | Probable mannitol dehydrogenase 1 from Stylosanthes with 83.24% of identity |
Eggnog | alcohol dehydrogenase(COG1064) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT4G39330) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019464294.1) |
Pfam | Zinc-binding dehydrogenase (PF00107.25) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |