| Id Trinity | TRINITY_DN49101_c1_g1_i2 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_292071 |
| Sequence | TGTAGCTTTTTGCTTTCCCCTTAAATGTTTTTCTTTTTGTTTTCTACTTACCTTTCAAACCCTTCTTCATGCTTTTTTTCTTTCTTTTTTTATGGTCTTC ACTTTTGAATCTTGCATAGAAACTAGGGTTAGGGCTGGTCTATATCCTTATCTATTTTTCTATTTCCTACTTTTCTCTCTCTTCTCTTTTACATGGATAG CAATCATGACTATCACAAAGAGATCTAAAGAAACCAGTCGTTGTTTGCTCTTGGAGCATCATCAAGATTCACATGGTTTAAGGGGTTTTGATTCAAGGTG GTCTTAGATTGCTTCAAATCAATTATATAACCCTTTGATATGAGAATCTTGATGATGCTGCAGCGGCAATAAATGACTAATACTGATACCATGTTATTTC CCAAGGATTTTCACTACAACACAATAGTATGTTTGTACTTTACCAGCTTGGAGCATAAGAGGTTTATTCAATTCATCATGTTTAATTCTTTATATTCTCT ATTTTAATTTTTTTATTAGATGCTGAATTGAATCACACTTTATACATGGTTTCAGGTGATTCCGGTAGTGTATCTTAGAACACAGTGATCCTTGATCTTC TGACATCATTGAAGGTTTATTGTTCAGTGATGTTGGAGTTGAGTCATTTCACCATCACTACCCTTCTGGCATTTGTACTGCAAAAACACCTTGCTGCAAA TCTCATCAGGTTTGTCTGTACCATGGCGAAATTTTCTGTCCTACCATAAATCATTGAATGCTTTTACTTCATGGATATTTTGGGTTTACATTATTTATCT CTTCTTTTCAGCTTTTTACCTCTTTATCTAGATCTTGATCTTGATGTTATTCGATCTTGAGTACAACCAATATTTCTTTTACTGAGTATCAATCAATTTG GACACAGACCATCTTTTAACTTTTACTCGATTTATTTATTTTGGTATTATATATACACAAGTTGCATTATATTGTAGGTCATTTGAGTTTTGCTAGACAG TAAAAATACATGTATTTTTTATAAACAAAAGATTCAATAAAATAGCAGAAACATAACCAACCAAATTTAAGATCTAATATGAATAATTTTAATTTAATTA ACCTCCTTAGCAAAAAATATTATTTCATTTCTTATGAGCTAAATCGACCTCATTCAAGCATTCTCTATGACGTTCTAGCTTTTGATCAGTACGTCAATTT TTATTCTTTAACTTTAAAGTTTGGTGACTTTGTGATTTGTTCTTTTTCTGGGAACATTTTTATCTATATCTTCACTTTATGTTTTTATCAATAAATTAAA TACTGTTGATAATTTTTTAAAAAGATATGAAGTCACAACTCACAAAGACATCAAAACGTGTATTTAGTAAATCCAAATCTTTTTTTAAGACAAAGATATA TTGGGTTTGTTGGAAACTATCATGGATGGAAGATAAGTTCTTATAACAGCATACTCCAATAACCATTAGGGTTTGTTTAGAGTTGGATATTAGAGGGAAA TGAAAGACTTAGAACTATTAATATACTTATGAGATGACTTTCAAGTCTTCTCTTTCTCTTCACCCCCTCTAAAATTCAGCTCCCATCAAACCCTTATAAA AGGAAAAATAATATCTTTATACCAAATAACATGCTATTTTATTTCTTTCCTAGTGTGAAAAATGATATTTAGTTAAAGAGTGAGAAGTAAAAATGGCTAG TGGAGTTGTGTCTTGCTATAAGATCTTACGACAATTGTTAATGCCTCGTGTATCTTAGTAGGAAGGTCTTATTTTATACTATAAGGTTTCATACAAACAC AATTCCTGTAACCATTCTTCTTCTGTTTTTGCAAATCATTTTATACTAAAAATAACAGCATCTTTTAAGTTTAACTAAAGTAGAATTCAGCACAAATCTC TTTTACACATATATGTAGATGATTTTACTGTGGGATAAGGTGTTTGATTTAGTTCCTAAACTCAATGTGAAAATGGATGGAATCAGAAAACTAAATTGCA AAAGATGTTAGCTTAGATCCCAATAATATTATTTCGATCCAAGTTCTTTAGTTTGTTTGTAAGAGGTTTATAATAATGTTGGTTATAAATATTTATATCT ATGCATCTTTTATTGATATGTTTGGTTTTGTTGCTTGTTGCTGTTATTTGCTTTGCATATCATTGATTTGCTCCTAATTGCAATTGAGAGGGTTGTTTTC TAGGTTTCTTATTCATGCAGGCATGTATCTAGGATTATTATCAAATTTGTCAAATTCCTCAACTCCAACACGACACGTTCGAATGATGAATTTATCAAAT GTTATGGTTGCAACTAGGATCTGCAATTGTTTACCTAATTGGAAATTAGTCTCATATTAGATAATAAATGTCATTTTTCTACCACTCCAATTATTCTTTC AATCATATTTCAGGATGAAGAATTTGCATGGCTTAATATTTGTAAACTATCTAGAGATTGATTACCGGCTCTAAATTTAGGAGTGAGATTAGTTTCACCT TTGTATGGTGCTAAGGAAAAATTATATTTTTAC BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_166573; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_292071
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | - |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | mdm-MIR172o (MI0023070) |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_016200080.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | mir-172 (RF00452) |
| GO | - |