Ll_transcript_291386

• Id Trinity: TRINITY_DN49112_c0_g1_i24
• Name Transcript: Ll_transcript_291386
• Sequence: CAAACACGGCGCACGCTTCTCTCTCTCTCCTTCGCTTTCTCTCTCCTCTCTTGATCCCAAATCGATTTGGATTCATATCCGATGCTGTTCTAAGCTTATT TATCGACGTCAACGTTTCGTTTCGATTTAAAAAAAAATATTTTTTCCGCAATCAACAAGTTTGGCTTTGGTTATGTCTTGCAGTTTTTGTTTAATTTCGC TTGTACTATTTGTTTCTGTCCAATTTTAGTTTTCTATGTATCATGTAAAGGGATCTCTGTTTAAGTTAGGTGCAAAAAAAAATACTATGCTGTATTTGCA GATATGGACAAAGATTGCATACTTTATTTTCTTTTCTTTTCTTTTTCCTTTTTTTTAGTTTAATTACAGTAGAGTTGGAATTTGTTTAATAATACAAACT GCATGTACCTAAATATTCGAAGTTATCAATATATGTTTCGAAACATTTTCCTCACATGTCATGCTGGTATGTTATGGAATTTATTGCAATTTTTGTACTC TGTTCTGGTATGGGATATAGCTTCTGAATTGTCTGTTCCTAATGATTTAGAGTTGAACGCTTGATATTTCCTTTTCAGGCCTCTATAGTGATCTTAATTT TTTATCCAGAAGGGAAACTCTTTCAAATTATAATTGAGAAGAAATGCAATAGTATACACTGGTAGTAATATATTTCATCTTGTGCGTGGTAAAACCTACC TACCTGTATGTGATGTCAATTAAGTGCTTAAAATTGTATAGATAAACTTTTACACATAGCGAATAGGGTGGTATAGTTGAAGCAAGTCATAATTTGAGCT TATAAAGAGTCGATGCCAAAAGGTACTCCTGTACTCTTCTGTGATTCATTTAACTAGTGTGTGCTCATTGCTATTTCTTCAGGAGTTTACTTTATTCTTT GGCTGCAATTGCATCTTGAAAATTTTGGGTTTATCTGTTTAGGTAAACTTGCGTAGTCATGCTTAAAGAGAAGCAAGGGACCCCCTCTGTTATTTATTTG TTTAAGTGCACATGTTGGCTAAGAAGTTTGTTTTGGGAATATTTAGGCTGCAGAAAAGACGGCTCATATTGATTCTTTATGTCAGTTGGTTAATAATCAA ATTTGGATAGTGGGTATGCTCTAGAGTAGAGTGGCATATGTTTCTCACTTGAATTCATGATGACTGACTTTATATATTATTAATTTGAATATCTTTGGTG CAGGAAAGTTGAAAAAATATGGACCATGACAAGACTGGATGCCAAGCTCCCCCTGAAGGTCCTATTTTGTGTGTTAACAACTGTGGATTTTTCGGAAGTG CAGCTACCATGAATATGTGTTCTAAGTGCCACAAAGACATGATGCTCAAAGAGGAGCAGGCCAAGCTTGCAGCATCATCCTTTGGTAATATTATGAATGG ATCATCAAGCAGCACTCCAACTGAATCTGTTGCTGCCAAGGTGGATGTCCTGGTAAATGCAGTGGAGCCTAAACCTGTCTCTGTGCAACCTTTATTTGCT TTCGGTTCAGGGGAGAGTGGTGAGGCAAAACCAAAGGACGGTCCAAAGCGTTGCCTTAGCTGCAATAAGCGGGTTGGTTTGACAGGATTCAATTGTCGAT GTGGTAACATTTTCTGTGCTGTACATCGCTACTCAAACAAGCATGATTGCCCATTTGATTACCGCACTGCTGGACGGGAAGCCATAGCTAAGGCAAACCC GGTTGTTAAGGCTGAGAAGCTTGACAAGATCTAGATTTGGTATCCTGAGTTACTGTTATGGTCAATTTCATCATGATATAATCCAAGTTTCCTGCATGTT TTAATGGTGTTCTTATTAAATTGCTATATGCGATAGGGGACTTGGAGTTTTATGACATCTCTGCAGTTTAAAGCATTGTAATGCGTTTATTGACTTTATT CTGCTCCCTATCTCTGCAATAGTACATGTCAGAATGGTATGTGCGATTTAAAGATGATTTCAGAACATGTGGTTAGATTGTAAATTATTGTTATGGTTTG GTGTCTATCTATGAATTTCTCTCACCAACAATGTATTTCAATTGTTTAGGCATCATTTTTCATAAATTTACTCCTTGTTTAATTAATCAGTACCTTCTTG AACTATATGTGATGTCTCAGGTGAGTATCTAATCTTTGAAAATTGATATGGATGACCATCTCATTGTTCATGTAAGAGGTTGCCTCCATTTTTGCACTGC ATTGCACTATTGGTTATTACATGTACCAAACATCTTTGATATACATACTGCTGCATTGGGTGGTAGTGAT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_166662;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_291386

FPKM

• PAB: 14.7
• PNAB: 5.7
• PS1: 4.6
• PS2: 3.5
• PS3: 4.3
• PW1: 3.6
• PW2: 4.4
• PW3: 3.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_291386

• Blastp: Zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein 8 from Oryza sativa with 65.32% of identity
• Blastx: Zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein 8 from Oryza sativa with 65.32% of identity
• Eggnog: zinc finger(ENOG4111UWC)
• Kegg: Link to kegg annotations (4341520)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019454121.1)
• Pfam: A20-like zinc finger (PF01754.15)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;