| Id Trinity | TRINITY_DN49115_c2_g1_i6 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_291070 |
| Sequence | CTTCAACTTCTAGGCTTCTTCTTATTTCTCTTTGCATTTCACTCTCTATACGACGTCGTTCCATGCTCTACTTCTTCACAATTTCTCCTCTCTTCGTTCC TCTCACGGATAAAAATTAGGGTTTCTTGGATATGGAAGGTGCTGAGAAATTGAATGATGAAGGTTATGGTGGTGAAGCTGGAAACAGCAGATCAGAGGAG TTTATAAGTGATTCTTTGGAAAAGGAGGAGAATTTGGTTGAAGATGAGAAGATAGAAATTGCAAATGGTGAAGATTTGGATGTGGGAATTGAGGTGATTG AAACTGTTCTTATGTCTGAGGAAGTGAAAGGAGTGAGCTCAGTTGTGCATGCTGAGAACAAGGGTCCCAATGGAAGCCTTGGGGTTGATGGAAGATCTGT ATCAGGTGCTAAAAGAGCCCGCGTCACTACTGACGAACATCAGCCTTCAGTTCATTTCATTTATAATTCCCTCACAAGAGCTAGTAGGCAGAAGCTTGAG GAACTGCTACAGCAATGGTCAGAATGGCACGAGAAACACGTTTCTTCGTCGAGTGTAAGACCACTTGTTTTATTTTTGTTAATGTATAGCGATTTACCTT TATAGAGAATAAAATAGTATTACTACAAAACATTGAAAAAGAATAGGGATGTCAATATCGTTCATGAAAGGGATTTAAATTTGAAATGAAGTTGGAGTTT GTGCAGTTGTCATTGTTGAGCTGCAATCTAAATGTTGACTAACGATTGGCTAAGATGCACAAAAACAGCTAAATGCCTACTTATTTCATAATAAAATATA GGACAATTGAAGGTGTAAGCACATTTTTAATTTCAAACCAAGCTTGAGGCTTGTTTTTTTATGAATTGCTCAGTAATTTTGGGATTGTTGATGAGTTTGG ACTCTAATCTTCGTATAAAAAAAATCCTTATTAATATGTGGGAATCTGACTTACCTTTATTTTATTGGAACCAAGGAAGCAAAAGCTTGATGCCTAAGTC AGAAGTTGTTTTCACTGATGGTTACATGAGATAAGGATCCTAGTGAAGTGGTGGAATCTGGCGAGGAGACATTTTTTCCTGCTCTAAAAGTTGGCCATGA GGAGACCTCCGCTGTGCCATTCTGGATGGATAACCAGACAATTAATGATCAGAATAAGGATTTCATTCCTTTAAATCATAATTCTGTGCCTCTATATGAT CGTGGATTTGCTTTGGGATTGACGTCGGCTGATGGTCCAAGTAATCTGGATGGGTATATACTGCTACTTTGTATTATTTTATATGAAACTGTGGGTACAC TTAACTTCTAGTTCTAGATGGTTTATATGATCTTAAGATGTTTAAAGGCATATTGCTAGCTTGTTTCTTGGTTGTCTAATATTGTGATGTTGCACTGCAT ATGGAAACTTTTGCTTGGAAACTCGACAAACCCTTGATCATTGTGGCTACAGAATTTTGTCTTTTTGGAAAGGAACCATAACCTAAAACTTTGCACTGCG CCATTTGATTTGTATTTCAAATTTCTACTTTAACTAGAGTGAATATTGAACTACATCACTTATCCTGTTAATACATTTATATTTTTTAGTGTTAGCTTCA CTATTTTAGTATATTGTTTAATGGCTGGGAGGATTTCAGATGGAAAGCCTATTTTAATTCTATGCAGAAGTCTCTATTCAGTTTTTACAAGTTTAACTTT TTGGTCCGGTATAAGGTACATTCTAAGTAGACTAACAATTGATGAATCCCTCATTTCAACCCTTTCCTTTTCTTTGCTTGCTCCATTTTCTCTAGCATGA GAAGTTAGTTCTTTTAGAAGATCCTTTTTTTAATTATTTTTATTGAGGTAGGAACTTGATTCGTATTATCTTGCAGTGAAAGTTTGATGTGGTAGAATTT GTGTAGACAATTAAATTAGTGATAGAGAAATATGACGTCGTAAGATCCATGTAGCTGACCCCACCAAGTGGGACTAATGCTTAGTTTTTGTTGTTCTGCT GAATGAATGAGAATTTGGTGGTTGGCTGCTTTAATAATTATTTTATCTCACATGTATCTTTTTTAATTGGTTATTGAAACTGTTGATCTGGTCATCCTTC ATTTGCAACGAATATCATAGAATTTGCTGAATGTGTGGTGGTATACCATTATTGATATTTCTGGGAGTCAGGTTTCTGTTGGCCGATATGATAATATTTC TTTACGAATTTGTCTTCACATGATATGAGTAGTTCTAATCTGCCTATCGCATCTTGAAGACTTGTCATGCCTTCTGATTTTCTCATATCTTGCTGTGTGG GATCCGTAATAAAACAGAAATGTAAATGAAAGCATATGTATCATTCAAAGTTAAAAAACTTACCGTGTTCTGATTCACCTTGGTGGTACTCCTCATGTAT TAACTATATTATTATTGGTCATTTGAAAGTTAAGGAACATGCAGTGTGGTTTCTTTTGCAATATAAAAATTGAAAATTCAATTTTCAATTCATAATTTAG GAATTTATATGTTCAGGTATGAAAAAGTTTAGGTTCTAGGGACATGTAGATGTTGAATGAAGCCTCGATTAATTGATATAGCAATTTGCAGCAGATTTTA GTTGATACAAAGTGATGTGGCTGCCAATATGGTGTGTGGTCTATGGGTTGGATTTATTAGTTAAGTAGTCTATGGTTATAGCTTGCAAAATAGTATATAT ATTCTGCATTGCTTTGTTTCTCTGCAATGCTTTTCTTTAATGTTGGTATTTGATCATTGAAACATAATTCGCTCAATTTGGCAAAGAACCACAAATTGGT TCGTGCATACCAATTCGCGGTTCTTTTGTAAATTGCTTCTCTCCAGTTCTTGCGTTAATTCCCTGCAAGAAATGAACCACGTTTTCACCGACAATTTCAG TCTAAGGAAGAGTAGTTGGTGTCTTGCTGATTTGGGACCACCTGCATGATTAGGTTATAACAAACAAGAAAACATGAAAGTTAATGGGGTGTTTCTCTTA TGGTGAAGAAATAGTTGATTCACTGCTCTAATCTACATGGAGATATGGAAACTGCTGTGCAAGGGGGAGCCATAGAAACCCTACATGTCAATGTCATGGG CTTATTTCAAATTGGCCTATGTATTGTTTTTTTTCCTAATCAAAATGATCCATCTAACTGAAGAATAACCAAATTATTAAATCATATTAGATCATAAATG ACACACATCAAATATGGAATTAGATCAAAGAAAATTAAAATAAAATGTTTTTAAAATATATTATTAATTATTTATAATTAATAGTTAATGGTAATAATAT AACCATAGCAAGCATACCCGCATGACTCCCAAGTGAAAAAGGAAAGAACTCATCTTCTTTCTTTTTTGATTACCTTCCTTGCGTATGTATAGAACGTATT AACTAAGTATACCCCCACCCAACTATTTGATAGCGCAGTGTGCAGTGTACCCATACCAGTACCAAAGATAACCACTTATCAGGGGACTATGGTATTGATA TTAAGGCGAGGTTCTGGAAATTTATTTGTTGGTATGATATGCCTAGCAGAATTCTGTTTTTTGTGTGTTCTTTATCCCTCTGGATGAATAATCATCTCTA GTTGGTATCTGTGTTACCAACGGGGAGAAGTTTCAACATGTGATCTTATTAAACAACAGCAAGATTTGGTACTTCATTCTTTTGCCACACCTAGTTTTAT TGTTATCATGAGAGAATTGGGATAGAGGCATTGGGAAATATTCTTATTGCATTTTATGTTAGAGGATAAGAGCAAGGGAGGACATAATTGTCGGTCTCAG TTGGATTTTGGCTTACATAAACACAATGGTGAAACAATTTATCATTTGCTTATTCACTTTCCTGATGCTGCAACCATTTTGGTATCTGCATGTTGTAACT GGAATGTGCCTAAATATGTCAAGGAGGTGCTACTCTTTCATGTTGAGCAAAAGACTGGGAAGGGCATAAAGATAAAGTCATCAAAAACAGTTCCAGGGGT CTGGAGATCATTGATGAAGCTGCTCGGTGTTTCAACTGTGGCTCATACAGTCATTCTTTGAGAGAGTGTACAAAGCCTCGTGATAATGTTGCTGTCAATA ATGCTCGCAACCAACTCAAGTCCCGACGGAACCAGAATGGTTCTTCCCGCAATCCAACTCGTTACTATCAGAATTCTCCAACTGGAAAGTATGCTGGTTT GAGACCAGGTGCTCTTGATGATGTAACACGCAAACTCTTGGGCTTGGGGGAGCTTGATCCACCTCCATGGCTTAAAAGAATGCGAGAAATTGGATACCCG CCTGGTTATGTAGGTAAAATACAATTCTTTGTCCTCACTTATATCAGTCTTGGAGGGAATAAGTTGCAATATTTTATTTATTGATCTTATTGTATAAGCA TTGATGATATGCCAGTAATGAAAACATTACATATTTAGTATTCGAATCATAATGCTAAGCTTGTTCATTAACACTTGCAAGATAAAAACATGTAACGTTT TAGGCACAAGGGAAATTTTAATGGGTGTCTCAACTCTCAAGCATAATTACATAACATATGATACTATTTTTTTCACTTCTAAAATGTTGCTTGCATCTGA AAATGGTTGTCGAAGTCAAGTGTATGAGGAATCTTTTAAGTGCATTCCATTTTTTTCAAAAATATTTTAAGTAGTGCTTTGAATTACTTTGTCTTTGACA TGAGTTGCCATCTTGTGTTCTTCGCAGTGTAAAGGCTTCGAATTGATTTTTATGTAATGTGATTATGCAAAAGTTTCCCTTGACAAATTTCAAAAAGTCT TCTAATCCATTGTTGTTGCCTGTGCCCTTGTAAACTTAATGAACCTGTACTGTTATTATTATACATATATATATATATACACACACATATATATACACAT TAAATTTCTTTCTTCTATGTTTTCTTGGTTGCTATTTATCATATTTGTATAGATCCTTTTCTTATATGGGATATCAAAATAGTTTATGTCATGCATAGTG AATGTATTGGGCTATCATATTTCTTTTTTCTTACGTTTTGGAATTTAGATGTGGATGATGATGATCAGCCTTCAGGCATCACAATATACGCTGATAAGGA GATCGCAGAACAGGAGGATGGACAAATTAAGGGAATAAAAAAATTGAAACCAAAACGGAAAATGACTGTCGAATTTCCTGGAATTAATGCTCCTATTCCG GAAAATGCTGATGAAAGATTGTGGAGTGCTGGGGCTGCACCTTCGAGTTATGACATTTCAAATATTTCAAGAAACTTGCCGCAGCACAGATCAAATCATA CTACAGATTATGGCAGCAGAGGACATTTTCGCGAGCCGAGACTGCCAGGGGATTTCAGGGATGATGCTCCTCCGGGTGATCAAGGATTTAGTTCACCCCG GTATAGTTTTCATCCGATGTATGATCGGCATGATTCTTTACCAATCAGTTCTTCAATGTCGAGATTCCAACCAGAATGGAGTAGGAGAAGTCCTGTGCAC GATGAAGAACCCCGACATCCTAGATCCTTCCATTCTCTATATTACTCGTCGTCGTCAGAGAGGCTTCTTTTCCCCCTGGACCAAGATTTAGCTAGATTTG GAAACTGGTCTCCTGGAAGCCTGTATGACAGAGACCGAGATCGGGCATTCCAAAATAGGTACATGTCGGACGACTGGCATTATCGGAGTTGGAGGTGAGT AGGCATCAGCAGGAATGTATTGGTAGATTGTGAAGTTACATTTCTTTCATTCATAGGTGGAAATCATTTGCCCTTTTATTTAGTGTGGACAATTGTACAA AGTTTTGGTGAAGTTGCAGGTTTTTGCCATTTCTGATAGCTTTGTGGACACTCCTTTATTTGTTACTACTTACTAGGGTTCATTAACTGAAAAAATCATC TCATTACTTTTAATTTCTTGTACAATGGATTATCAGCTGTAGTAATAGTCGTGCAGCCGAAAATCGAGAATGTTGTGCTATTTTAATAGATGTCATTATA AAAAATAGAACATTTATTGGACAAATGAGCATGAGTCTCGATGCAACAATAATGTTATCTTCCGACTAGAGGTTATAAGTTGAAGTCCCGGAAAGAGCCT TGTGCATTGGACAATCCTTTATTTTATCGGAC BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_166681; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_291070
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Zinc finger CCHC domain-containing protein 8 from Xenopus with 34.19% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019453113.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |