| Id Trinity | TRINITY_DN49115_c2_g1_i7 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_291072 |
| Sequence | CTTCAACTTCTAGGCTTCTTCTTATTTCTCTTTGCATTTCACTCTCTATACGACGTCGTTCCATGCTCTACTTCTTCACAATTTCTCCTCTCTTCGTTCC TCTCACGGATAAAAATTAGGGTTTCTTGGATATGGAAGGTGCTGAGAAATTGAATGATGAAGGTTATGGTGGTGAAGCTGGAAACAGCAGATCAGAGGAG TTTATAAGTGATTCTTTGGAAAAGGAGGAGAATTTGGTTGAAGATGAGAAGATAGAAATTGCAAATGGTGAAGATTTGGATGTGGGAATTGAGGTGATTG AAACTGTTCTTATGTCTGAGGAAGTGAAAGGAGTGAGCTCAGTTGTGCATGCTGAGAACAAGGGTCCCAATGGAAGCCTTGGGGTTGATGGAAGATCTGT ATCAGGTGCTAAAAGAGCCCGCGTCACTACTGACGAACATCAGCCTTCAGTTCATTTCATTTATAATTCCCTCACAAGAGCTAGTAGGCAGAAGCTTGAG GAACTGCTACAGCAATGGTCAGAATGGCACGAGAAACACGTTTCTTCGTCGAGTGTAAGACCACTTGTTTTATTTTTGTTAATGTATAGCGATTTACCTT TATAGAGAATAAAATAGTATTACTACAAAACATTGAAAAAGAATAGGGATGTCAATATCGTTCATGAAAGGGATTTAAATTTGAAATGAAGTTGGAGTTT GTGCAGTTGTCATTGTTGAGCTGCAATCTAAATGTTGACTAACGATTGGCTAAGATGCACAAAAACAGCTAAATGCCTACTTATTTCATAATAAAATATA GGACAATTGAAGGTGTAAGCACATTTTTAATTTCAAACCAAGCTTGAGGCTTGTTTTTTTATGAATTGCTCAGTAATTTTGGGATTGTTGATGAGTTTGG ACTCTAATCTTCGTATAAAAAAAATCCTTATTAATATGTGGGAATCTGACTTACCTTTATTTTATTGGAACCAAGGAAGCAAAAGCTTGATGCCTAAGTC AGAAGTTGTTTTCACTGATGGTTACATGAGATAAGGTCATAAAGGCTTCTTGTTGCTTATGTTTGGCTTTAGAGTTTAGACTTAGGTTTTGATAGACAAA TTAAATGATCTAGAGTACATCCAGTGGAATGATGGTTATATGTTTGGTGTATTCACTGTATTTGCAAGGGAATGGTGGCAATTGTGCACTTGTGCTGTTA AAAAAATGTTAAGAAGTTTTTCTGTCCAGGATCCTAGTGAAGTGGTGGAATCTGGCGAGGAGACATTTTTTCCTGCTCTAAAAGTTGGCCATGAGGAGAC CTCCGCTGTGCCATTCTGGATGGATAACCAGACAATTAATGATCAGAATAAGGATTTCATTCCTTTAAATCATAATTCTGTGCCTCTATATGATCGTGGA TTTGCTTTGGGATTGACGTCGGCTGATGGTCCAAGTAATCTGGATGGGTATATACTGCTACTTTGTATTATTTTATATGAAACTGTGGGTACACTTAACT TCTAGTTCTAGATGGTTTATATGATCTTAAGATGTTTAAAGGCATATTGCTAGCTTGTTTCTTGGTTGTCTAATATTGTGATGTTGCACTGCATATGGAA ACTTTTGCTTGGAAACTCGACAAACCCTTGATCATTGTGGCTACAGAATTTTGTCTTTTTGGAAAGGAACCATAACCTAAAACTTTGCACTGCGCCATTT GATTTGTATTTCAAATTTCTACTTTAACTAGAGTGAATATTGAACTACATCACTTATCCTGTTAATACATTTATATTTTTTAGTGTTAGCTTCACTATTT TAGTATATTGTTTAATGGCTGGGAGGATTTCAGATGGAAAGCCTATTTTAATTCTATGCAGAAGTCTCTATTCAGTTTTTACAAGTTTAACTTTTTGGTC CGGTATAAGGTACATTCTAAGTAGACTAACAATTGATGAATCCCTCATTTCAACCCTTTCCTTTTCTTTGCTTGCTCCATTTTCTCTAGCATGAGAAGTT AGTTCTTTTAGAAGATCCTTTTTTTAATTATTTTTATTGAGGTAGGAACTTGATTCGTATTATCTTGCAGTGAAAGTTTGATGTGGTAGAATTTGTGTAG ACAATTAAATTAGTGATAGAGAAATATGACGTCGTAAGATCCATGTAGCTGACCCCACCAAGTGGGACTAATGCTTAGTTTTTGTTGTTCTGCTGAATGA ATGAGAATTTGGTGGTTGGCTGCTTTAATAATTATTTTATCTCACATGTATCTTTTTTAATTGGTTATTGAAACTGTTGATCTGGTCATCCTTCATTTGC AACGAATATCATAGAATTTGCTGAATGTGTGGTGGTATACCATTATTGATATTTCTGGGAGTCAGGTTTCTGTTGGCCGATATGATAATATTTCTTTACG AATTTGTCTTCACATGATATGAGTAGTTCTAATCTGCCTATCGCATCTTGAAGACTTGTCATGCCTTCTGATTTTCTCATATCTTGCTGTGTGGGATCCG TAATAAAACAGAAATGTAAATGAAAGCATATGTATCATTCAAAGTTAAAAAACTTACCGTGTTCTGATTCACCTTGGTGGTACTCCTCATGTATTAACTA TATTATTATTGGTCATTTGAAAGTTAAGGAACATGCAGTGTGGTTTCTTTTGCAATATAAAAATTGAAAATTCAATTTTCAATTCATAATTTAGGAATTT ATATGTTCAGGTATGAAAAAGTTTAGGTTCTAGGGACATGTAGATGTTGAATGAAGCCTCGATTAATTGATATAGCAATTTGCAGCAGATTTTAGTTGAT ACAAAGTGATGTGGCTGCCAATATGGTGTGTGGTCTATGGGTTGGATTTATTAGTTAAGTAGTCTATGGTTATAGCTTGCAAAATAGTATATATATTCTG CATTGCTTTGTTTCTCTGCAATGCTTTTCTTTAATGTTGGTATTTGATCATTGAAACATAATTCGCTCAATTTGGCAAAGAACCACAAATTGGTTCGTGC ATACCAATTCGCGGTTCTTTTGTAAATTGCTTCTCTCCAGTTCTTGCGTTAATTCCCTGCAAGAAATGAACCACGTTTTCACCGACAATTTCAGTCTAAG GAAGAGTAGTTGGTGTCTTGCTGATTTGGGACCACCTGCATGATTAGGTTATAACAAACAAGAAAACATGAAAGTTAATGGGGTGTTTCTCTTATGGTGA AGAAATAGTTGATTCACTGCTCTAATCTACATGGAGATATGGAAACTGCTGTGCAAGGGGGAGCCATAGAAACCCTACATGTCAATGTCATGGGCTTATT TCAAATTGGCCTATGTATTGTTTTTTTTCCTAATCAAAATGATCCATCTAACTGAAGAATAACCAAATTATTAAATCATATTAGATCATAAATGACACAC ATCAAATATGGAATTAGATCAAAGAAAATTAAAATAAAATGTTTTTAAAATATATTATTAATTATTTATAATTAATAGTTAATGGTAATAATATAACCAT AGCAAGCATACCCGCATGACTCCCAAGTGAAAAAGGAAAGAACTCATCTTCTTTCTTTTTTGATTACCTTCCTTGCGTATGTATAGAACGTATTAACTAA GTATACCCCCACCCAACTATTTGATAGCGCAGTGTGCAGTGTACCCATACCAGTACCAAAGATAACCACTTATCAGGGGACTATGGTATTGATATTAAGG CGAGGTTCTGGAAATTTATTTGTTGGTATGATATGCCTAGCAGAATTCTGTTTTTTGTGTGTTCTTTATCCCTCTGGATGAATAATCATCTCTAGTTGGT ATCTGTGTTACCAACGGGGAGAAGTTTCAACATGTGATCTTATTAAACAACAGCAAGATTTGGTACTTCATTCTTTTGCCACACCTAGTTTTATTGTTAT CATGAGAGAATTGGGATAGAGGCATTGGGAAATATTCTTATTGCATTTTATGTTAGAGGATAAGAGCAAGGGAGGACATAATTGTCGGTCTCAGTTGGAT TTTGGCTTACATAAACACAATGGTGAAACAATTTATCATTTGCTTATTCACTTTCCTGATGCTGCAACCATTTTGGTATCTGCATGTTGTAACTGGAATG TGCCTAAATATGTCAAGGAGGTGCTACTCTTTCATGTTGAGCAAAAGACTGGGAAGGGCATAAAGATAAAGTCATCAAAAACAGTTCCAGGTTGATTCCT ATTTACGCTTAGTGAGAAAAAGAAAAAAAAGGATTTTGGGATTATTGGAACTTCTCCAGATTCTTCACTGTGGAATTGAACTTCATAGATCTTTTTACTT TGATTTCACTTCAGATGTTTTTCTTCTTTTTTTAGCATCTTGAAGTAAAACTCGTTTTGCATCATACGTTCTGGTGGTATGTGACTAATTCTTGATGAAT CATTCAATCACTTATTTAAAAGAGTGTCATGCTCATTCATGCAATTTCTATTTATTTATTGGAAAGATATACTGTCAGCTTCCATCACAATATTGTGCTG TCTTTTGATATTTTTTAAAACTTATTGTAGGGGTCTGGAGATCATTGATGAAGCTGCTCGGTGTTTCAACTGTGGCTCATACAGTCATTCTTTGAGAGAG TGTACAAAGCCTCGTGATAATGTTGCTGTCAATAATGCTCGCAACCAACTCAAGTCCCGACGGAACCAGAATGGTTCTTCCCGCAATCCAACTCGTTACT ATCAGAATTCTCCAACTGGAAAGTATGCTGGTTTGAGACCAGGTGCTCTTGATGATGTAACACGCAAACTCTTGGGCTTGGGGGAGCTTGATCCACCTCC ATGGCTTAAAAGAATGCGAGAAATTGGATACCCGCCTGGTTATGTAGGTAAAATACAATTCTTTGTCCTCACTTATATCAGTCTTGGAGGGAATAAGTTG CAATATTTTATTTATTGATCTTATTGTATAAGCATTGATGATATGCCAGTAATGAAAACATTACATATTTAGTATTCGAATCATAATGCTAAGCTTGTTC ATTAACACTTGCAAGATAAAAACATGTAACGTTTTAGGCACAAGGGAAATTTTAATGGGTGTCTCAACTCTCAAGCATAATTACATAACATATGATACTA TTTTTTTCACTTCTAAAATGTTGCTTGCATCTGAAAATGGTTGTCGAAGTCAAGTGTATGAGGAATCTTTTAAGTGCATTCCATTTTTTTCAAAAATATT TTAAGTAGTGCTTTGAATTACTTTGTCTTTGACATGAGTTGCCATCTTGTGTTCTTCGCAGTGTAAAGGCTTCGAATTGATTTTTATGTAATGTGATTAT GCAAAAGTTTCCCTTGACAAATTTCAAAAAGTCTTCTAATCCATTGTTGTTGCCTGTGCCCTTGTAAACTTAATGAACCTGTACTGTTATTATTATACAT ATATATATATATACACACACATATATATACACATTAAATTTCTTTCTTCTATGTTTTCTTGGTTGCTATTTATCATATTTGTATAGATCCTTTTCTTATA TGGGATATCAAAATAGTTTATGTCATGCATAGTGAATGTATTGGGCTATCATATTTCTTTTTTCTTACGTTTTGGAATTTAGATGTGGATGATGATGATC AGCCTTCAGGCATCACAATATACGCTGATAAGGAGATCGCAGAACAGGAGGATGGACAAATTAAGGGAATAAAAAAATTGAAACCAAAACGGAAAATGAC TGTCGAATTTCCTGGAATTAATGCTCCTATTCCGGAAAATGCTGATGAAAGATTGTGGAGTGCTGGGGCTGCACCTTCGAGTTATGACATTTCAAATATT TCAAGAAACTTGCCGCAGCACAGATCAAATCATACTACAGATTATGGCAGCAGAGGACATTTTCGCGAGCCGAGACTGCCAGGGGATTTCAGGGATGATG CTCCTCCGGGTGATCAAGGATTTAGTTCACCCCGGTATAGTTTTCATCCGATGTATGATCGGCATGATTCTTTACCAATCAGTTCTTCAATGTCGAGATT CCAACCAGAATGGAGTAGGAGAAGTCCTGTGCACGATGAAGAACCCCGACATCCTAGATCCTTCCATTCTCTATATTACTCGTCGTCGTCAGAGAGGCTT CTTTTCCCCCTGGACCAAGATTTAGCTAGATTTGGAAACTGGTCTCCTGGAAGCCTGTATGACAGAGACCGAGATCGGGCATTCCAAAATAGGTACATGT CGGACGACTGGCATTATCGGAGTTGGAGGTGAGTAGGCATCAGCAGGAATGTATTGGTAGATTGTGAAGTTACATTTCTTTCATTCATAGGTGGAAATCA TTTGCCCTTTTATTTAGTGTGGACAATTGTACAAAGTTTTGGTGAAGTTGCAGGTTTTTGCCATTTCTGATAGCTTTGTGGACACTCCTTTATTTGTTAC TACTTACTAGGGTTCATTAACTGAAAAAATCATCTCATTACTTTTAATTTCTTGTACAATGGATTATCAGCTGTAGTAATAGTCGTGCAGCCGAAAATCG AGAATGTTGTGCTATTTTAATAGATGTCATTATAAAAAATAGAACATTTATTGGACAAATGAGCATGAGTCTCGATGCAACAATAATGTTATCTTCCGAC TAGAGGTTATAAGTTGAAGTCCCGGAAAGAGCCTTGTGCATTGGACAATCCTTTATTTTATCGGAC BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_166681; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_291072
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Zinc finger CCHC domain-containing protein 8 from Xenopus with 34.21% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019453113.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |