Id Trinity | TRINITY_DN49171_c1_g1_i11 |
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Name Transcript | Ll_transcript_291324 |
Sequence | ATTAGGTGAAGGACTAAGCATAACCAAAACCAAAACGACGTAGTTCACTGAACTTCATTCACGCTTGTTGCACCTCTCTGATACAATTTGTTCATCTCTC TCTTTTCACGTTCATCTCCATTTTCAACAGTTCGATTTTAAGTCAATTTTCGCTTTCAACAGTTATCGCTTTCAACAATTCAGATCTGAGTGGGTTGAAC TTGATTCGTGTTTTAAGCTGATTTTGAGAAACTGGGGTCTCTAAATTTGAAAACTTTTGTCCAATGACGAGTGATTCGGATTCAATTGTTGAGATTTGAG TTTTTGAAGAAAGTTTTGAAGAATTTGGTTTTGAATTGATTAACGAAATTTGTTAAGGAGTCATGTTCTATGGTGCGGTTGTATGGGACCCTTGGCTTAT TGTTGGTCAAATTGTTTGTCTCCAATGCTTGTACTATATCACTCTGGGAATGTTCTTATCCTTACTTGTTGGAACTCGAGTTTCGCGAATGAGCCTTGTG TATTTCTTTGACTATGTAACCATCACTGCCTCCACTGTTACTGGTTGGTGTGTTATTGCTTCATTTCTGCTCAGCTCAATTGCAGGGTAATTGCTCTGTT CCACTTTACTTATTTTGGTGTTCATTAATAAAAATACAATGTGTTATTTTGTTATAGTTCATTAATGAGGGCGGCTAAAAGGAATGACACGTGTTTTGCT TTTTTCGATGAACAAACCACAAATAGTTGGGGAAATTTATTTATGTCATGTAATTAGAATATTGGATTGCCTTTTGTTGCTTGTTGATTATATTCAATGA TAATAGTTTGAGGTGGAACTAGATGGGTTTTTATTGGAGGTTGAAGTTGTTTAGGTGCATGTGATGCTGTTTACTAATAAATGTATAAATGTGTATTATT TTCGTATAGATTATTAATGAGGGGACTAAAAATAGGAGATGTGCTTTATTGGTGAGCGACACCACAATCATTAGACAATTTTTTCCTAACTTTTGTAATT AGGTAGCCTTTATTTAATATTTAGACGGAGAGCTAGGTTTTATTGGAGGAGCAAAGTAGATATTTTTTAGGAAATAATCGAAAAAACAGATTGCGATGTC GTTGAACTGTTAAGGTAAATATAGATATGGGTCAAAATATTGTCACTGCAGTGTAATTTTTCCTGTTATGTTGCACTAGTTGTAGACTTGCAGTCTTTTG TAATAAATAGGGGGCACTCTCCATCCTTTAAATACTCATGCTATTCTATGATTCTATGTAGATATGGAGATACCTAATGCTTTCTCAATTTACATGAGTG AATGCGAAGGATTGTGAAATTGGATGAGTATGTAATGAGAAGTGCAAGTAAGACCATTAGTGGTAACTAATGCTATTACTGTGTCAGTAATGTAAGCTGT AGCTCCTTTCCCTAACAAGACTGTCATACCAAGAACAGAGTTGTGTTTGTTTTAGCAGCATTATGTTCACAAGCTTATAAATAGCCTGACTATGTATTTA CCACCTTTCCAATTTTGTTCTTTGCTTCTTTTAGGCTTTTAGCAGCATTACGTTTAAAACCTTATAAATTGTTGTTCATTCTTAAATCTGTTTGTTTTCT TTGCGTTGGATTAATTGTGCTTTTTTCGAGCATTTGTAAAGAAATAAAAAGTTAACCTTTGACCCTTTGATTTAGATGTGCCTTTATTTAGGAGATTCCA TGTGTGTCTTCCTTTGTGTTCTGTGATTTTGTGCGAGAGCAAGATACTGAGAGAGGCATTCTTAGCTGTACATCTTTTTGTACCTTGGGTTGTTAACTGA AATTATGTAGTAACTCTACCTTGTACTGAGTTACTGACACTACTATTGGTTTAATTCAGGGCTGTATATATGTTTTATTTGATTGAAAGAGCGAATAAGT GCTTGGATTTTTCAGCCACTCTCTACATCATCCATATTTTTATATGCATTGTGTATGGGGGTTGGCCCTCTTCTATAACATGGTGGGTTGTGAATGGTAC TGGAATTGCAGTGATGGCTTTGCTAGCTGAGTATCTATGCATCAAGCGTGAAAGCCGGGAGATACCAATAACACGATATCGTTCAAGTAAGAACTTATGG TTGTTTGGCTGGCTCCTTTGACACGTGTTTTAAATCTCTGTATCTGTGTTATATTATAAATTGTATTTTCTTTTTTCCTTGTAAGTTTTACTTATTCCAG TAGCCTGAATATATATTTATCTCGTCAAACTAAAGTTTTTTAGGATTTTTTTAATCTCTATATGTTGTGTTGCTATGCTGACTGTATTTATGCGAAGATC TGGAATATTCTTGCTCAGTGGGTCACGATGCTATTTATGCATTATGTTTTATATGATGTGTCAAATGGCACTATCGCAGTCGGTTTGTATGTCGCCAAAT ATCGGTTTGCTATTTTTATGATTTAATATGCTTGAGTTCCTTGCAGATGTTTGATTGGCAGAAGTAACTCGAGTTTTGAATTCAAGAAAGAAGTTGTGTT GCGGGATGATGATAACTTTTGTTT BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_167122; |
Additional information | - |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_291324
Blastp | - |
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Blastx | Protein SYS1 homolog from Nematostella with 38.46% of identity |
Eggnog | SYS1 Golgi-localized integral membrane protein homolog (S. cerevisiae)(ENOG4111H59) |
Kegg | Link to kegg annotations (NEMVE_v1g229542) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019425098.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |