Ll_transcript_291288

• Id Trinity: TRINITY_DN49171_c1_g1_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_291288
• Sequence: ATTAGGTGAAGGACTAAGCATAACCAAAACCAAAACGACGTAGTTCACTGAACTTCATTCACGCTTGTTGCACCTCTCTGATACAATTTGTTCATCTCTC TCTTTTCACGTTCATCTCCATTTTCAACAGTTCGATTTTAAGTCAATTTTCGCTTTCAACAGTTATCGCTTTCAACAATTCAGATCTGAGTGGGTTGAAC TTGATTCGTGTTTTAAGCTGATTTTGAGAAACTGGGGTCTCTAAATTTGAAAACTTTTGTCCAATGACGAGTGATTCGGATTCAATTGTTGAGATTTGAG TTTTTGAAGAAAGTTTTGAAGAATTTGGTTTTGAATTGATTAACGAAATTTGTTAAGGAGTCATGTTCTATGGTGCGGTTGTATGGGACCCTTGGCTTAT TGTTGGTCAAATTGTTTGTCTCCAATGCTTGTACTATATCACTCTGGGAATGTTCTTATCCTTACTTGTTGGAACTCGAGTTTCGCGAATGAGCCTTGTG TATTTCTTTGACTATGTAACCATCACTGCCTCCACTGTTACTGGTTGGTGTGTTATTGCTTCATTTCTGCTCAGCTCAATTGCAGGATATGGAGATACCT AATGCTTTCTCAATTTACATGAGTGAATGCGAAGGATTGTGAAATTGGATGAGTATGTAATGAGAAGTGCAAGTAAGACCATTAGTGGTAACTAATGCTA TTACTGTGTCAGTAATGTAAGCTGTAGCTCCTTTCCCTAACAAGACTGTCATACCAAGAACAGAGTTGTGTTTGTTTTAGCAGCATTATGTTCACAAGCT TATAAATAGCCTGACTATGTATTTACCACCTTTCCAATTTTGTTCTTTGCTTCTTTTAGGCTTTTAGCAGCATTACGTTTAAAACCTTATAAATTGTTGT TCATTCTTAAATCTGTTTGTTTTCTTTGCGTTGGATTAATTGTGCTTTTTTCGAGCATTTGTAAAGAAATAAAAAGTTAACCTTTGACCCTTTGATTTAG ATGTGCCTTTATTTAGGAGATTCCATGTGTGTCTTCCTTTGTGTTCTGTGATTTTGTGCGAGAGCAAGATACTGAGAGAGGCATTCTTAGCTGTACATCT TTTTGTACCTTGGGTTGTTAACTGAAATTATGTAGTAACTCTACCTTGTACTGAGTTACTGACACTACTATTGGTTTAATTCAGGGCTGTATATATGTTT TATTTGATTGAAAGAGCGAATAAGTGCTTGGATTTTTCAGCCACTCTCTACATCATCCATATTTTTATATGCATTGTGTATGGGGGTTGGCCCTCTTCTA TAACATGGTGGGTTGTGAATGGTACTGGAATTGCAGTGATGGCTTTGCTAGCTGAGTATCTATGCATCAAGCGTGAAAGCCGGGAGATACCAATAACACG ATATCGTTCAAGTAAGAACTTATGGTTGTTTGGCTGGCTCCTTTGACACGTGTTTTAAATCTCTGTATCTGTGTTATATTATAAATTGTATTTTCTTTTT TCCTTGTAAGTTTTACTTATTCCAGTAGCCTGAATATATATTTATCTCGTCAAACTAAAGTTTTTTAGGATTTTTTTAATCTCTATATGTTGTGTTGCTA TGCTGACTGTATTTATGCGAAGATCTGGAATATTCTTGCTCAGTGGGTCACGATGCTATTTATGCATTATGTTTTATATGATGTGTCAAATGGCACTATC GCAGTCGGTTTGTATGTCGCCAAATATCGGTTTGCTATTTTTATGATTTAATATGCTTGAGTTCCTTGCAGATGTTTGATTGGCAGAAGTAACTCGAGTT TTGAATTCAAGAAAGAAGTTGTGTTGCGGGATGATGATAACTTTTGTTT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_167122;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_291288

FPKM

• PAB: 0.5
• PNAB: 0.3
• PS1: 0.3
• PS2: 0.3
• PS3: 0
• PW1: 0.2
• PW2: 0
• PW3: 0.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_291288

• Blastp: -
• Blastx: Protein SYS1 homolog from Nematostella with 38.46% of identity
• Eggnog: SYS1 Golgi-localized integral membrane protein homolog (S. cerevisiae)(ENOG4111H59)
• Kegg: Link to kegg annotations (NEMVE_v1g229542)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019425098.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;