Ll_transcript_291298

• Id Trinity: TRINITY_DN49171_c1_g1_i5
• Name Transcript: Ll_transcript_291298
• Sequence: CGTAAGAGTTTAATATTTATATATCATTAATGTAAAGTTTTTTATATTATTGATATATTATTCACTAACATTTTATTTTTGAAATAAACGAATTTGTTAG ACACCAAATTTGTTGAAGCGTGTTGCAGTGATATTGTTTGTTCATCCATTTTTTTTCATTTCTCTCTTAACATCACCATAGAGAAACATCGATCTCCATT TTTCAACAATTCCATTTTCCTGCGAATTTTCGAAACCCTAGATCCTTCCATTCAATTTTCGCTTTCAACAGTTATCGCTTCCACAATCCAGATCTGAGAG GGTTGAACTTGAATTATGTTTTGAGCTGATTTCGTGAATCTGGGGTCTCTAAATTTGAAAACTTTTCTCCAATGACGAGTGATTCTGGTTCAATTGTTGA AATTTGAGGAATTGGGTCGATTCTATAGTGAAGAAATTTAGAGAATTTAGGTTTTGATTTGGTTAAAGAAGTTTTTGAAGGAGTCATGTTCTATGGTGCA GTGGTTTGGGACCCTTGGCTTATTGTTGGTCAAATTGTTTGTCTTCAATGCTTATACTATATCACTCTGGGAATGTTCTTATCCTTACTTGTTGGAACTC GAGTTTCGCGAATGAGCCTTGTGTATTTCTTTGATTATGTTACCATCACTACCTCTACCATTACTGGTTGGTGTGTTATTGCTTCATTTCTGTTCAGCTC GCTTGCAGGAGTTGCAGTGTTTTGTAATATAGAGGAGGCACTCAATCCCTTAAATCTTCCTGCTTTTCTATGATTCTATGTAGACACCTAATGCTTTCTC AGTTTACTTGAGGTAATTGGAAAGATTACGAAAGTCGGTGAGTGTGCATTTATGCAATGAGAAGTGCAAGTAAGATCATTACTGGTTAAAAATACTAGTA CCGTGTTGGTAATTTGACATGTAGCTCCTTTCCTTAGCAAGATTATCATATCAAGAACAGAACTGTTTCTTTATTTTAGAAGCATTATGTCGACAAGCTT ATAAATAGCCTTAGTATGTGTTTACCATCTTTCCACTTATGCTATTTGTTGTTGCAGCATCATGTTGATAACCTTATAAATTGGTATTCAGTCTTTTCTG TTTGTTTTCATTGCATTGGTTCTGCTTTTTACGAGCATTCGTAAAGAAACAAAAGCTTAACCTTTGACCGTTTGAAGTTTGAATAGCTGTGCCTTTAATT AGGAGACTCCATGGGTCTCTTTCTTTGTGTTCTGTGATTTTGTGTAGGAGGAAGGTACTGAGATGAAATTCTTAGCTGAATGACTTTTATGTATTATTGG CTTGTTAACTGAAATTATGATGCTCTAAATTGTACTGACGTCACCGTTGGTTTTATCAGGGCTGTATATATGCTTTATTTGATTGAAAGAGCAAAGAAGT GCTTGGATTTTTCTGCTACTCTCTACATCATTCATCTTTTTATATGCATTGTGTTTGGGGGTTGGCCCTCTTCTATAACATGGTGGATTGTGCAAGGTAC TGGAATTGCAGTGATGGCTTTGCTAGGTGAGTATCTGTGCATCAAGCGTGAACTCCGGGAGATACCGATAACACGATATCGTTCAAATGTTTGATTGGCA CAAGTAACATGAGTTTTGAATTCGAGAAAGGAGTTTTGTTGCGGGATGATGATAACTTTTGTTTCTGTACATCGGATGATCTCCAAGATAAAACCGACCG TGTGCGTAATTCTATTATGCCATTGAAGGAATTTCTTTCCTATTCTTTAGTTGCAATATAGAGTTGAACCATAGATAATGAGAGGAGACTAGATATATAA CTTTTCTGTAAACTCTGGAAATCTTAATGTATGTTATTCTTATTGTTTCTCTTTTCCCCTATTAGTTTTGGTTAAGGTAATGCCTTTAGTGGGTAGAGGT TCAATTCTTTTACCTTATGTTTGTTTTGGATTTGTTTACATAAACAGTTTGTATAAATTATTAACATACACCTTACCCTTTACTAATAGTAAAACCATAC TATTGTCTCCTTATTATGAAAATGGAGCATGTTTCTCACATAAAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_167122;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_291298

FPKM

• PAB: 2.6
• PNAB: 1.4
• PS1: 1.6
• PS2: 1.1
• PS3: 1.3
• PW1: 0.8
• PW2: 0.8
• PW3: 0.3

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_291298

• Blastp: -
• Blastx: Protein SYS1 homolog from Mus with 48.1% of identity
• Eggnog: SYS1 Golgi-localized integral membrane protein homolog (S. cerevisiae)(ENOG4111H59)
• Kegg: Link to kegg annotations (66460)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019425094.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;